В конце осени 1912 г. «Гебен» вместе с легким крейсером «Бреслау» зачислили в состав германской Средиземноморской дивизии. В это время в Средиземноморье полыхала Первая Балканская война. Боевые действия еще продолжались, когда в марте 1913 г. анархистом был застрелен греческий король Георг I. «Гебен» входил в состав международной эскадры во время доставки тела монарха из Салоник в Афины. После окончания войны морской министр Германии А. Тирпиц попытался убедить кайзера отозвать линейный крейсер в Северное море, но не сумел. В конце года турки предприняли попытку купить «Гебен», однако сделка не состоялась. До лета 1914 г. корабль демонстрировал флаг в Средиземном море, и после ряда походов ему потребовался ремонт энергетической установки (в первую очередь – находившихся в отвратительном состоянии котлов). Предполагалось заменить его однотипным «Мольтке», но после убийства в Сараево началась лихорадочная подготовка к войне. Средиземноморской дивизией в это время командовал контр-адмирал Вильгельм Сушон, «Гебеном» – капитан цур зее Рихард Аккерманн.
29 июля на крейсере получили предупреждение из Берлина, и он вышел в море, встретившись с «Бреслау». Когда война с Францией была объявлена, «Гебен» отправился к берегам Алжира и утром 4 августа обстрелял Филиппвиль («Бреслау» бомбардировал порт Бон). Хотя французам нанесли не слишком большой ущерб, переброска XIX армейского корпуса во Францию оказалась задержана на трое суток. Крупные силы французского флота предотвратить обстрел не смогли. Когда отряд Сушона уже отходил, он встретился с двумя английскими линейными крейсерами. Но война между Германией и Британией еще не была объявлена, и боя не произошло.
В дальнейшем, умело используя политические и географические особенности региона, Сушон, получивший приказ прорываться в Турцию, смог избежать боя с превосходящими силами англичан. «Гебен» и «Бреслау» прибыли в Константинополь 10 августа, а на следующий день состоялась сделка по фиктивной продаже крейсеров Турции. Официально об этом объявили 13 го числа. Новые «хозяева» переименовали «Гебен» в «Явуз Султан Селим» («Jawus Sultan Selim»), а «Бреслау» – в «Мидилли», но экипажи на них остались немецкие. Сушон стал командующим султанским флотом. На Черном море, где Российский флот не имел в строю ни одного линкора или крейсера нового типа, сразу создалась напряженная обстановка.
Появление немецких кораблей в Турции позволило сторонникам союза с Германией и Австро-Венгрией втянуть страну в войну с Антантой. Военные действия начались 29 октября с внезапного нападения германо-турецкого флота на русские порты. «Гебен» под флагом Сушона обстрелял Севастополь, при этом он некоторое время маневрировал на крепостном минном заграждении – к счастью для немцев, отключенном. Русские береговые батареи открыли ответный огонь и достигли двух или трех попаданий в линейный крейсер, потерь он не понес и существенных повреждений не получил. Когда «Гебен» уже начал отходить от Севастополя, с него заметили возвращавшийся в базу русский минзаг «Прут». Спасти заградитель попытались три дозорных эсминца, предпринявшие торпедную атаку. Но головной «Лейтенант Пущин» получил три попадания 15 см снарядами и вышел из боя, а два других продолжать атаку не решились. После этого команде «Прута» осталось только затопить свой корабль, вместе с которым погиб большой запас мин. Отходя к Босфору, «Гебен» и миноносцы потопили пароход «Ида». Война на Черном море началась…
«Гебен» являлся основной силой германо-турецкого флота, и ему приходилось решать множество самых разнообразных задач: обеспечивать воинские перевозки и снабжение Константинополя и флота углем, противодействовать русским кораблям. 18 ноября у мыса Сарыч «Гебен» (флаг Сушона) и «Бреслау» встретились с эскадрой Черноморского флота. В условиях плохой видимости русские не смогли организовать эскадренный огонь, и фактически бой вели «Гебен» и броненосец «Евстафий». Линейный крейсер получил одно попадание 305 мм снарядом – в третий 15 см каземат, вызвавшее пороховой пожар и гибель 12 моряков (еще двое умерли позднее). Впоследствии русские приписали себе еще множество попаданий и сообщили о гибели и ранении более 170 немцев и турок, но это откровенные домыслы. «Евстафий» получил четыре попадания.
В конце декабря «Гебен» обстрелял Батуми, а 26 го числа, возвращаясь в Босфор, подорвался на двух русских минах, получил большие пробоины и принял много воды. Причем в Турции не имелось подходящего дока для ремонта такого большого корабля! Но Сушон и его подчиненные сумели найти выход из положения: были сооружены и подведены к борту специальные кессоны, позволившие осушить район пробоин. Интересно, что «Гебен» несколько раз выходил в море (4 апреля потопив русский пароход) еще до окончания ремонта, завершенного лишь к маю 1915 г. С линейного крейсера также сняли и отправили для обороны Дарданелл несколько 15 см орудий (два из них на корабль не вернулись).