Следует назначение командиром 38-го корпуса в Штеттине. Генерал фон Манштейн участвовал во Французской кампании, за отличие в которой наградается Рыцарским крестом Железного креста. После победы над Францией следует назначение командиром 56-го танкового корпуса в составе 4 дивизий: танковой, моторизованной, моторизованной СС и пехотной. Перед вторжением в Советский Союз корпус вошел в состав 4-й танковой группы генерала Гепнера.
За первые пять дней войны танковый корпус Манштейна совершил прорыв в глубь советской территории на 200 километров и занял мост через Западную Двину у города Даугавпилса. В боях под Демянском участвовал в разгроме 3-й армии противника.
С сентября 1941 г. – во главе 11-й армии, действовавшей на Крымском направлении, имея перед собой задачу взятия Крыма и Ростова-на-Дону. В состав армии входили два армейских и горнострелковый корпуса, 3-я румынская армия, 1-я моторизованная дивизия СС «Адольф Гитлер».
28 сентября части Манштейна взяли Перекоп. Советские войска нанесли контрудар, оголив при этом свой левый фланг. Манштейн умело воспользовался этим и в 6-дневном сражении нанес поражение противнику, взяв в плен более 100 тысяч человек, но захватить Севастополь ему не удалось. Героическая оборона города продолжалась 250 дней.
В начале декабря армия Манштейна совместно с 1-й танковой армией Э. фон Клейста провела операцию по окружению противника у Азовского моря, в ходе которой была разбита 18-я и часть 9-й советских армий, пленено около 65 тысяч человек. В январе 1942 г. Манштейн нанес удар по Керченскому плацдарму, разгромив там противника и взяв в плен около 170 тысяч человек. Он был произведен в генерал-полковники.
Обезопасив свои фланги, Манштейн, наращивая свои силы, приступает к методической осаде города-крепости Севастополя, который пал лишь 3 июля. В плен к немцам попало около 90 тысяч человек. В июле 1942 г. Манштейн получает чин генерал-фельдмаршала, теперь он становится одним из самых авторитетных полководцев Третьего рейха.
После захвата Крыма 11-я армия была передана группе армий «Север», наносившей удар по Ленинграду. Однако советские войска нанесли сильный контрудар, и войскам Манштейна пришлось закрывать собой брешь. Ему удалось выполнить эту задачу успешно – в плен к немцам попало более 12 тысяч человек из состава советской 2-й ударной армии. Генерал-полковник получает отпуск в Германию, который ему пришлось прервать.
Советские войска под Сталинградом окружили 6-ю армию генерала танковых войск Ф. Паулюса. Манштейну было приказано на базе штаба 11-й армии сформировать командование группы армий «Дон». Он, восстанавливая линию фронта, стал настаивать на немедленном прорыве из котла войск Паулюса. Силам Манштейна удалось остановить наступление противника на Ростов-на-Дону и продвинуться на 30 километров навстречу окруженной 6-й армии. Ее остаткам пришлось сложить оружие перед советскими войсками.
Прибыв в ставку Гитлера, генерал-фельдмаршал добился от фюрера разрешения сократить линию фронта. Группа армий «Дон» преобразуется в группу армий «Юг» под командованием Манштейна. В середине февраля 1943 г. советские войска начали наступление, но немецкая 4-я танковая армия успешно нанесла контрудар, выведя из строя 615 танков противника. Немцы вернули себе город Харьков.
В марте того же года Гитлер посетил ставку Манштейна и наградил его Рыцарским крестом с дубовыми листьями. С началом битвы на Курской дуге армиям группировки «Юг» пришлось отступить, оставя Харьков. Вину за это Манштейн возложил на командующего 8-й армией генерала Кемпфа, который был снят со своего поста. Наступление советских войск развивалось столь успешно, что у Манштейна на 1300 километров фронта осталось всего 257 танков и 22 °CАУ.
В такой ситуации генерал-фельдмаршал, получив поддержку армейского генералитета, предложил Гитлеру провести коренную реорганизацию Восточного фронта – объединить все его силы под единым командованием и передать все фронты в подчинение Генерального штаба сухопутных войск. Гитлер узрел в этом немалую утрату личной власти в военных вопросах и отклонил требовательное предложение Манштейна.
Советские войска неудержимо наступали по всей линии фронта. Последним успехом Манштейна стал контрудар у Кривого Рога. Генерал-фельдмаршал прибыл в ставку Гитлера и доложил ему стратегическую ситуацию на Восточном фронте, потребовав назначить его главнокомандующим на Востоке с чрезвычайными полномочиями. Гитлер вновь ему отказал.
После невыполнения ряда приказов Гитлера генерал-фельдмаршал был вызван в его ставку, награжден Рыцарским крестом с дубовыми листьями и мечами и отправлен в отставку. Конец войны Манштейн встретил в своем поместье. Англичане в 1949 г. осадили его на 18 лет тюрьмы, позже срок был сокращен до 12 лет. В 1952 г. он был освобожден из заключения по состоянию здоровья. Был советником при создании в ФРГ бундесвера. Умер в 1973 г. в Баварии.