Древнегреческие мифы повествуют о том, что гиганты, дети богини земли Геи, восстали против олимпийских богов и в жестокой битве — гигантомахии — потерпели поражение. Сцены битвы гигантов одна за другой разворачиваются на фризе Пергамского алтаря. Чтобы подчеркнуть, что это не просто сражение, а битва двух миров — верхнего и нижнего, художники изобразили богов над фигурами гигантов. Всего на фризе изображено около пятидесяти фигур богов и столько же — гигантов. Фигуры выполнены в очень высоком рельефе, они как бы отделяются от фона и по сути являются отдельными скульптурами. Фон между фигурами заполнен множественными развевающимися одеждами, крыльями гигантов и орлов, а также извивающимися змеями. Детали фриза изготовлены и обработаны настолько тщательно, что можно буквально почувствовать их материальность. Изначально все фигуры были раскрашены, и даже позолочены. Высокий рельеф давал большие глубокие тени, из-за чего даже мелочи можно было хорошо различить на расстоянии.
Изображен самый разгар сражения, хорошо подчеркнут яростный темп схватки. Отчаянное сопротивление гигантов противопоставляется стремительному натиску богов. Боги и гиганты показаны в полный рост, у многих гигантов вместо ног — змеи. Имена каждого бога и гиганта, поясняющие изображения, аккуратно вырезаны на карнизе под фигурами. Центральный образ фриза — сражающийся Зевс-громовержец. Он ведет борьбу сразу с тремя противниками. В его фигуре ощущается беспредельная, буквально нечеловеческая мощь. Поразив одного из врагов, Зевс готовится метнуть свою испепеляющую молнию в предводителя неприятеля — змеиного исполина Порфириона. Мышцы гиганта бугрятся от напряжения, лицо искажено гримасой — он готовится отразить удар. Особой выразительностью и драматизмом наполнена сцена сражения богини Афины Паллады и крылатого гиганта Алкионея. Афина со щитом в руках повергла противника на землю, в ее движениях прослеживается решительность и торжество победителя. К Афине устремлена крылатая богиня победы Ника: она готовится увенчать голову победительницы лавровым венком.
Поверженный гигант-титан тщетно пытается освободиться от беспощадной хватки воинственной богини. Его мускулы напряжены, а прекрасное лицо выражает сильное страдание. Священная змея Афины, обвившая титана, впивается ему в грудь. Рядом с Афиной находится скорбная богиня земли Гея, мать гигантов. Ее руки подняты вверх, а длинные волосы разметались по плечам. У скульпторов получилось с особым драматизмом передать горе матери, оплакивающей своих детей.
На верхней площадке Пергамского алтаря находился второй фриз — малый, посвященный мифу о Телефе, аркадском герое, очень почитаемом в Пергаме. Этот фриз был выполнен в совершенно другом стиле. Неторопливые движения героев, спокойный пейзаж, на фоне которого происходят события, контрастируют с динамичным и напряженным сюжетом предыдущего фриза.
По своим художественно-историческим характеристикам Пергамский алтарь приравнен к Парфенону. Это одно из самых величественных строений древней Эллады, которое одновременно является одной из непревзойденных жемчужин мирового искусства.
Однако, по утверждению В. Бумагина, уже в древности Пергамский алтарь стал обрастать дурной славой. Апостол Иоанн Богослов в своем Откровении писал: «И Ангелу Пергамской церкви напиши: так говорит Имеющий острый с обеих сторон меч: знаю твои дела, и что ты живешь там, где престол сатаны, и что содержишь имя Мое и не отрекся от веры Моей даже в те дни, в которые у вас, где живет сатана, умерщвлен верный свидетель Мой Антипа».
В XIV веке после окончания Четвертого крестового похода Пергамский алтарь на некоторое время будто бы стал объектом поклонения какой-то тайной неоязыческой секты, действовавшей в сердце духовно-рыцарского ордена госпитальеров, широко известного как Мальтийский орден. В этот период на алтаре якобы происходили человеческие жертвоприношения.
В 1864 году правительство Турции заключило с немецким инженером Карлом Хуманном контракт на возведение дороги от небольшого городка Бергамо до великого Измира. Изучая место будущего строительства, инженер заметил на восточной окраине городка довольно крутой скалистый холм высотой более трехсот метров. Поднимаясь на него, Хуманн увидел там остатки двух колец бывших крепостных стен. Инженеру удалось разговорить рабочих, которых наняли из окрестных деревень для строительства дороги. Один из них заявил: «Эфенди! Тут копать нельзя. В горе живут белые дьяволицы и рыжие дьяволы. Аллах не раз наказывал тех, кто добывал здесь камень. Они покрывались струпьями, а затем их разбивал паралич. И мулла наказывает тех, кто здесь копает». Другие утверждали: «Ночью бесплотные духи языческих дьяволов выходят наружу и устраивают бесовские пляски. Если их потревожить днем, как рассказывали наши деды, начнется землетрясение. Гора волшебная, она скрывает богов очень древней языческой страны. Их проклятье над Бергамо длится тысячи лет. Но если их откопать и вывезти, то наш город снова будет процветать. Это я слышал в мечети».