Предпоследний властелин Хуайна Капак, отличавшийся легкомыслием и разгульным нравом, закончил тем, что разделил царство на две части, посадив во главе каждого из них своих сыновей. Братья начали кровопролитную войну. Очень скоро в страну, охваченную междоусобицей, пришел отряд конкистадоров, возглавляемый искателем приключений Франциско Пизарро, который в 1531 году двинулся из Панамы на юг континента и достиг Перу. Под его командой находились 110 пеших солдат и 67 кавалеристов. Они были вооружены огнестрельным оружием, какого у инков не имелось. Весной 1532 года один из враждовавших братьев Атахуальпа одержал победу над братом-соперником, но уже в ноябре он оказался пленником испанцев, а его брат погиб от рук своих же придворных. В августе 1533 года погиб и Атахуальпа: несмотря на громадный золотой выкуп, он был по приговору испанского суда повешен.
Империя инков перестала существовать.
Испанский летописец Педро де Леон оставил нам свои впечатления о столице империи: «Ни один город империи не имел такой превосходной планировки, как Куско — столица и место пребывания владыки. Улицы были длинными, правда, узкими, дома возведены из чистого камня, превосходной кладки. Примечательностью были огромные и очень старательно подобранные камни. Роскошный и праздничный стоял храм Солнца. Его украшали золото и серебро, доставленные из всех частей империи».
Куско не был только резиденцией правительства и власти, в которой божественный владыка со своим окружением правил страной. Город стал символом империи, называвшейся «Тацантинсуйу», что означало «царство четырех соединенных провинций». Четыре дороги, преодолевая крутизну подъема, вели в столицу страны. Вот как пишет один из летописцев: «Представители отдельных народов и провинций жили в кварталах города, которые были закреплены за ними таким образом, что город представлял всю страну, ее отдельные части». По современным расчетам, в центре Куско жили около 20 000 человек, на периферии столицы — 50 000 жителей, в окраинных районах, в долине, где были дома из соломы, обитали 80 000 человек.
Высоко над городом высились стены крепости Саксахуаман, они были поставлены зигзагом и больше напоминали имперский символ, чем оборонительное сооружение. По сути, это был склад — хранилище продовольствия, оружия и тканей. Другой летописец удивляется: «Был дом, в котором хранились 100 000 засушенных птиц, поскольку из их многоцветного оперения изготовлялись парадные одежды. Трудно себе представить, что они хранили так много различных вещей». Здесь напрашиваются некоторые параллели с Древним Египтом. Ведь «фараон» в переводе означает «большой дом», дом, где хранились запасы продовольствия и всего того, что нужно государству. Владыке Инке, как и фараону, принадлежали все подданные, все земли и что на них производилось