В марте 2006 года стало известно, что Генпрокуратура РФ завела против Березовского новое уголовное дело по обвинению в «действиях, направленных на насильственный захват власти в нарушение Конституции РФ». Речь идет о высказываниях Березовского о том, что он планирует в России переворот с целью свержения президента РФ Путина. Глава МИДа Великобритании Джек Стро предупредил, что эти высказывания Березовского могут повлечь пересмотр его статуса беженца. Однако олигарх не видит особых причин для этого, тем более что он заявляет не о захвате власти, а о «перехвате» ее (по типу прихода к власти самого Путина). Тем не менее, Борис Абрамович заявил, что ему «безусловно выгодна революция в России». «Я предпринимаю самые активные действия, но все они в рамках закона. Мною проводится колоссальная работа по дискредитации режима Путина. Давно прошло время, когда надо мной в Европе смеялись. Теперь у меня здесь нет оппонентов. Думаю, что перехват власти произойдет уже совсем скоро», — сказал олигарх.
Комментируя же сообщения о том, что предварительным следствием предпринимаются меры к розыску его собственности для наложения на нее ареста, Березовский заявил: «Чтобы арестовать мой бизнес, нужно арестовать весь бизнес, существующий в России, — и добавил: — Бизнес у меня остался в России, просто им неизвестно какой». На самом деле все уже давно известно, вплоть до единственного производителя «Боржоми» — компании «Georgian Glass & Mineral Water» (GG&MW). И хотя в самой компании утверждают, что GG&MW является российско-украинской компанией, бизнес принадлежит Борису Березовскому и Бадри Патаркацишвили. Так что это против олигарха были направлены действия российских властей, запретивших реализацию ценного напитка в РФ.
По всей видимости, Березовский чувствует шаткость своего положения. Управлять своим бизнесом в России, тем более под пристальным надзором правоохранительных органов, ему становится все труднее, а шансы на возврат в «постперестроечное пространство» выглядят все более призрачно. В ноябре 2006 года в результате «великой ноябрьской» революции в Киргизии начался пересмотр итогов конкурса на разработку крупнейшего в регионе золоторудного месторождения Джеруй. В борьбе за лакомый кусок киргизской экономики столкнулись интересы английского миллиардера индийского происхождения Лакшми Миттала и опального олигарха Березовского. Причем впервые в новейшей истории Борис Абрамович выступает в роли жертвы «цветной» революции, и шанс, что в этот раз «кинут» его, — огромный. Более того, правительство Киргизии подало иск к «Oxus Gold» (находящейся под крылом австрийской компании «Global Gold», принадлежащей Березовскому) с требованием о возмещении убытков, якобы нанесенных государству деятельностью компании. Убытки эти оценили в 145 млн долларов. А на кону был огромный куш — 74 тонны золота и 11,5 млн тонн руды. Исходя из этого, Борис Абрамович заявляет, что, понимая сложное положение своих партнеров, он решил полностью свернуть свои активы в России и продать их своему давнему партнеру Бадри Патаркацишвили, который, кстати, также находится в международном розыске.
Многие сотрудники спецслужб склоняются к мнению, что Березовский причастен и к отравлению Александра Литвиненко, бывшего сотрудника ФСБ и своего главного телохранителя, которому он дал приют в Англии. Член комитета Госдумы по безопасности Геннадий Гудков считает: «Возможны две версии: либо устранить Литвиненко распорядился сам Березовский, так как весь последовавший скандал был выгоден ему лично, либо в деле замешаны люди из ближайшего окружения Березовского». То, что смерть Литвиненко и последовавший за ней скандал и возродившийся страх перед спецслужбами России были выгодны изгнаннику (имидж России и Путина пошатнулся), — ясно и непосвященному. Однако доказать это будет сложно, потому что следы злосчастного полония нашли еще в сотне мест по всей Европе.
Но если большинство преступлений Березовского раскрыть практически невозможно, то свои педофильские наклонности он не скрывал никогда. О его романе с 14-летней девочкой «желтая пресса» писала очень подробно. Борис Абрамович заказывал малолеток в печально известном агентстве «Мадемуазель», которым руководил фотограф Александр Бородулин, поставляющий девушек толстосумам. Однажды Березовский сделал очередной заказ, но «под рукой» у сутенера оказалась только юная сожительница Марианна. Желание клиента — закон, и юная уроженка Новокузнецка отправилась к миллиардеру. В результате между ними вспыхнул роман, скандальные подробности которого периодически просачивались в прессу. Например, официанты столичного ресторана «Эльдорадо» были потрясены, когда в отдельном кабинете заведения Марианна под столом орально удовлетворяла БАБа, едва прикрывшись скатертью. Вскоре после этого, по слухам, девушка получила в подарок «мерседес» и мансарду в доме на Старом Арбате. На праздновании совершеннолетия Марианны Березовского не было — он уже прятался в Лондоне. Зато поздравить любовницу опального олигарха пришли многие известные люди.