В Вел. Отеч. войну вступил в янв. 1944. В распоряжении РУ ГМШ (1-4.1944). Нач-к 5-го (4.1944), 6-го (4-5.1944) отд-й ГО штаба флота. Ком-p 3-го д-на БТКА (5.1944—4.1945) СФ. В этой должности показал высокие боевые качества моряка-катерника. Первый мор. бой провел 28.6.1944. В условиях полярного дня группа катеров под команд. А. при полной видимости пошла на сближение с пр-ком, вошла в дымовую завесу, сблизилась с караваном пр-ка и на предельно короткой дистанции во взаимодействии с авиацией потопила 2 ТР и ТЩ. Все катера вернулись в базу. 15.7.1944, имея в подчинении 8 ТКА, А. вышел в море с целью перехвата и разгрома конвоя пр-ка в Варангер-фьорде. В составе конвоя было свыше 30 ТР и кораблей охранения; в условиях пониженной видимости в р-не п-ва Стуре-Эккерё катера А. встретили ТР и пошли на сближение с ними. В этом бою было потоплено 3 транспорта и несколько боевых кораблей пр-ка. Особо отличился 12 окт. 1944 в ходе Петсамо-Киркенесской операции. В группе ТКА находился ТКА-230 с радиолокационной станцией. Конвой был обнаружен на дистанции 100 каб., атакован и разгромлен. Это был первый успешный в истории нашего флота морской бой, которому способствовало умелое использование радиолокации. За время боевых действий д-н БТКА под команд. А. потопил 17 кораблей пр-ка. За героизм и мужество, проявленные в дерзких торпедных атаках, А. было присвоено звание Героя Сов. Союза. Имя А. отмечалось в приказах ВГК.
Нач-к штаба (4.1945-6.1946; 7.1946
4.1947), врид ком-ра (6-7.1946) БТКА СФ. Нач-к штаба сводного полка НК ВМФ при подготовке и во время Парада Победы в Москве 24.6.1945. Из репортажа Вс. Вишневского с Парада Победы: «...Упругим, легким шагом идет сводный полк военных моряков... Впереди белоголубого знамени идет Герой Советского Союза капитан 2 ранга Алексеев — североморец. Его торпедные катера потопили 26 немецких кораблей. Четыре ордена и две медали на груди офицера ».
Ком-p ОВРа в Архангельске Беломорского МОР (4-9.1947), бригады (9.1947-7.1951), 51-й ди (7.1951-2.1952) ТКА СФ. Ком-p Лиепайской ВМБ 4-го ВМФ, БФ (12.1953-11.1956).
С 28 марта по 10 апр. 1956 ОК (четыре ТЩ пр. 254) под команд. А. был переведен из польского порта Гдыня в египетский порт Александрия для передачи ВМФ Египта. По окончании передачи ТГЦ личный состав отряда возвратился из Александрии в Одессу в мае того же года на сов. ТР «Крым».
В распоряжении ГК ВМФ (11
12.1956). Ст. преподаватель кафедры операт. искусства и ТВС ВМФ военно-мор. фак-та ВАГШ ВС (12.1956-9.1957; 10.1962-11.1963). Нач-к штаба — первый зам. (с 9.1957; зам, — с 12.1960-7.1962) команд. БФ. В распоряжении ГК ВМФ (7-10.1962).
Пом. представителя Гл. команд. ОВС по ВМФ в Румынской армии (11.1963— 11.1965). В распоряжении ГК ВМФ (1112.1965). Зам. нач-ка по оргвопросам (12.1965-6.1967), 1-й зам. нач-ка
(6.1965-10.1975) ГШ ВМФ. В распоряжении (10—12.1975) ГК ВМФ. Консультант ВАГШ ВС (12.1975-9.1986).
А. неоднократно выполнял ответственные воен. и дипломатические поручения руководства страны, возглавлял воен. делегации, представлял нашу страну на различных конференциях и совещаниях. От имени правительства СССР в 1973 подписал в Вашингтоне протокол о соглашениях между СССР и США о предотвращении инцидентов в открытом море и воздушном пространстве. На всех занимаемых постах А. проявлял высокую компетентность и профессионализм, ответственность и инициативу, что было высоко оценено руководством нашего гос-ва.
С сент. 1986 в отставке.
Контр-адмирал (27.1.1951), вице-адмирал (27.4.1962).
Награжден орд. Ленина (1944), Октябрьской Революции (1974), 5 орд. Красного Знамени (1944 — 3, 1953), 2 орд. Отечественной войны I ст. (1945, 1985), орд. Красной Звезды (1948), «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» III ст. (1975), медалями, именным оружием (1962), орд. «Республика» Египет (1956), Командорский Крест ордена «Возрождение Польши» (1962),орд. КНДР «Государственное Знамя» 2 ст. (1970), орд. ГДР «За заслуги перед Отечеством» в золоте (1985).
Лауреат Гос. премии СССР (1980) — за участие в создании фундаментального науч. труда «Атлас океанов». Почетный гражданин г. Киренска Иркутской обл.
Похоронен на Новодевичьем кладбище.