Основным работающим органом Союзного государства стал в последние годы Постоянный комитет Союзного государства. Именно под его руководством реализуются многочисленные совместные российско-белорусские программы и проекты. Постоянный комитет, или Постком (как его часто называют в печати), является чем-то вроде неофициального правительства Союзного государства, работой которого фактически руководит государственный секретарь Союза Павел Бородин и его заместители с белорусской и российской сторон члены Посткома Сергей Шухно, Василий Хрол, Альберт Степанов и Юрий Дубинский. У Постоянного комитета есть офисы как в Минске, так и в Москве.
В систему органов Союзного государства входят еще Пограничный и Таможенный комитеты, Комитет по гидрометеорологии, Комиссия по тарифному и нетарифному регулированию при Совете министров Союзного государства и ряд других комитетов и комиссий. Как в Москве, так и в Минске нередко собираются совместные коллегии различных министерств. Для их работы создана уже весьма значительная правовая база - на конец 2009 г. только в рамках российско-белорусских отношений действовало более 140 межгосударственных договоров, а также межправительственных договоров и соглашений, которые позволяют нашим государствам продуктивно взаимодействовать в самых различных сферах. Среди этих договоров есть и Договор о союзной собственности (весьма значительной).
Далеко не все аспекты деятельности в рамках Союзного государства имеют, однако, институциональное оформление, и практика отношений между Беларусью и Россией идет, несомненно, впереди теории. Тем не менее есть все основания утверждать, что именно Союзное государство России и Беларуси - самое жизнестойкое на сегодня объединение на постсоветском пространстве. Оно существует, если вести отсчет с апреля 1998 г., уже 14 лет и вполне доказало свою состоятельность.
Нерешенные и нерешаемые проблемы
Отношения между Беларусью и Российской Федерацией развивались отнюдь не по прямой восходящей линии. На пути нашего сотрудничества возникало много препятствий, и далеко не все они к настоящему времени устранены.
У России и Беларуси так и нет общей валюты, хотя именно с проблемы ее создания начинался в 1992-1993 гг. разговор о российско-белорусском Союзе. У Союзного государства нет до сих пор своей Конституции или Конституционного Акта, который должен быть обсужден народами Беларуси и России и принят на референдумах. Соответственно, нет и символов государства - гимна, герба, флага. Обо всем этом говорилось в Союзном договоре, ратифицированном в декабре 1999 г., но прошло уже более десяти лет, а прогресс невелик. По свидетельству Павла Бородина, разнообразные комиссии подготовили уже пять вариантов Конституционного Акта, но ни один из них так и не был вынесен на открытое обсуждение, а Конституция Союзного государства готова на 99%, но несколько статей этого документа не удается до сих пор согласовать.
В Европе есть избираемый всеми гражданами стран-членов ЕС Европейский парламент. У нашего Союзного государства такого парламента нет. А российско-белорусский Постком не имеет тех прав и полномочий, какие имеют комиссары Европейского Союза, штаб-квартира которого расположена в Брюсселе. Недавно здесь появились как президент ЕС, так и комиссар по международным делам. У Союза такого рода постов пока нет.