Когда, наконец, истерика закончилась, Александр приказал устроить траур по безвременно ушедшему другу и в знак этого траура велел обрезать хвосты всем лошадям македонской конницы. Совершенно очевидно, что эту идею он позаимствовал из поэмы Гомера «Илиада», в которой Ахиллес таким образом отмечал траур по случаю гибели своего друга Патрокла. Как мы помним, десятью годами ранее, объявив себя возродившимся Ахиллесом, Александр во время празднеств в Трое выбрал на роль Патрокла именно Гефестиона. Согласно сведениям Арриана, Александр желал, чтобы весь мир увидел, насколько они с другом похожи на древних мифических героев Эллады.
Однако царь решил, что всего этого будет недостаточно, чтобы почтить память любимого друга. По словам Плутарха, он издал несколько совершенно безумных указов. Во-первых, он приказал распять тело лекаря, лечившего Гефестиона, и установить крест на видном месте, чтобы и после смерти наказать слугу, недостаточно старавшегося спасти жизнь своего господина. Затем он запретил любые проявления легкомыслия и веселья и повелел учинить массовое избиение ни в чем не повинных простых людей, считая это жертвой, которую он принес в дар душе Гефестиона.
Коссаены были народом, жившим в горах Мидии. При этом они сами никогда не восставали против власти македонян и никогда не давали убежища мятежникам. Тем не менее Александр приказал своим гипаспистам полностью истребить этот народ, заявив, что приносит их в жертву Гефестиону. По всей видимости, уничтожение этого миролюбивого племени, убийство мирных женщин, стариков и детей, которые никогда не выступали против македонян, показалось Александру недостаточным, потому что он тут же начал гонения на последователей зороастризма, точно так же ни в чем не виноватых. Это произошло после того, как жрецы отказались погасить священные огни, которые постоянно горели в их святилищах. Вот что пишет об этом Диодор:
В данном случае под персами понимались как раз приверженцы зороастризма, священный огонь у которых символизировал присутствие божества. Для жрецов Зороастра погасить огонь считалось совершенно немыслимым делом, и они, конечно же, не подчинились. В ответ разъяренный Александр приказал закрыть все храмы. В зороастрий-ском тексте, известном под названием «Книга Арды Вираф», говорится, что царь приказал осквернить храмы, казнил жрецов и приказал сжечь «Авесту», священную книгу.