Слава о его учености и строгости жизни привела к Иоахиму множество учеников, так что убежище Пьетралаты сделалось слишком тесным. Учитель со своими последователями поднялся еще выше в горы Калабрии и там, па плоскогорье Сила, основал церковь, посвятив ее св. Иоанну Предтече. Незадолго до смерти, он попросил перенести себя в Пьетралату, где благословил всех своих учеников и завещал им «возлюбить друг друга, как Господь Иисус Христос возлюбил нас»
.Из оставленного Иоахимом Флорским наследия до нас дошло, по крайней мере, семь сочинений, известных под следующими заглавиями: «Согласование Ветхого и Нового Заветов» (Concordia
veteris асnovitestamenti), «Руководство к Апокалипсису» (EnchiridioninApocalypsin), «Новый Апокалипсис» (Apocalypsisnova), «Десятиструнный псалтериум» (Psalteriumdecemchordarum), «Превосхождение четвероевангелия» (Superquattuorevangelia), «Против иудеев» (ContraJudeos), «О правиле веры» (Dearticulisfidei). Содержание и характер этих сочинений исходят большей частью из комментария на Апокалипсис и проникнуты эсхатологическим беспокойством. Мистическая основа учения о «Вечном Евангелии» основана на толковании текста Апокалипсиса.