В 2009 г. участники Совета сотрудничества приняли решение о формировании Сил быстрого реагирования ССАГПЗ, численностью 22 тыс. чел. Специалисты считают, что СБР ССАГПЗ могут заменить собой объединенные вооруженные контингенты «Щит полуострова». СБР ССАГПЗ планируется задействовать — путем оперативной переброски морским и воздушным путем из мест их постоянного базирования в странах-членах ССАГПЗ — в районах возникновения потенциальных угроз безопасности любой из стран «аравийской шестерки».
На территории стран-членов ССАГПЗ находится сегодня более 50 тыс. иностранных военнослужащих.
Наращиванию интеграционных процессов в рамках Совета сотрудничества мешают все еще сохраняющиеся между некоторыми из стран-членов ССАГПЗ территориальные разногласия. В Уставе ССАГПЗ есть специальная статья (ст. 10) насчет обращения участников Совета сотрудничества — в случае возникновения между ними каких бы то ни было спорных вопросов — к услугам специальной третейской комиссии. Решения ее к тому же должны иметь для участников Совета сотрудничества обязательную силу. На практике существование такой статьи Устава ССАГПЗ участниками этой организации, по сути, игнорируется. Такая комиссия до сих пор даже не сформирована. Именно поэтому вопрос о пограничных разногласиях между Катаром и Бахрейном, резко обострившийся в 2001 г., решался не в рамках ССАГПЗ, а в Международном суде в Гааге (март 2001 г.).
До передачи данного вопроса в Международный суд он неоднократно обсуждался в рамках ССАГПЗ, в том числе и на высшем уровне — на саммите Совета сотрудничества в Абу-Даби, в декабре 1992 года. Спор между Бахрейном и Катаром в отношении архипелага Хувар (возле него обнаружено месторождение нефти) и района Зубара (родом из этих мест — правящее на Бахрейне семейство Аль Халифа) урегулировать в рамках Совета сотрудничества не удалось. Согласно решению Гаагского международного суда, архипелаг Хувар должен отойти Бахрейну, а район Зубара — Катару.
Следует отметить, что всплески напряженности в отношениях между Катаром и Бахрейном продолжают иметь место. Крупнейший из них произошел в 2005г., когда из Катара на Бахрейн было выдворено 5 тыс. чел., принадлежавших к проживавшему в Катаре, но пробахрейнски настроенному, влиятельному племени аль-мурра (на тот момент члены этого племени имели двойное подданство, катарское и бахрейнское).
Сохраняются противоречия по территориальным вопросам и в отношениях ОАЭ с Саудовской Аравией. Начиная с 2005 г., ОАЭ настаивают на изменении пограничного соглашения с Саудовской Аравией от 1974 г., предоставляющие Эр-Рияду, как считают в Абу-Даби, необоснованно преимущественные, по сравнению с Эмиратами, права (80%) на добычу нефти с месторождения Шейба, расположенного так называемой разделенной зоне.
Наличие между странами-членами ССАГПЗ территориальнопограничных разногласий, представляющих собой один из самых опасных для будущего этой организации дестабилизирующих факторов, с одной стороны, и отсутствие у них собственного механизма по урегулированию спорных вопросов — с другой, чреваты для «аравийской шестерки» опасными для ее единства последствиями. В такой ситуации (в случае рассмотрения спорных вопросов в Международном суде в Гааге) огласки принимаемых этим судом решений и, как следствие, ударов по престижу и авторитету того или иного из правящих в странах-членах ССАГПЗ семейств, — не избежать. А это значит, что нельзя исключать и вытекающих из этого негативных последствий для состояния дел и перспектив развития межгосударственных отношений в рамках Совета сотрудничества.
Несмотря на наличие соглашения о делимитации морской и сухопутной границ между Саудовской Аравией и Катаром (1999 г.), претензии Дохи в отношении стратегически важного для Катара района Аль-Хуфус, что на границе Катара с ОАЭ, отошедшего по этому соглашению Саудовской Аравии, явно просматриваются. Особенно в свете усилившихся, по сравнению с 1999 г., роли и места Катара не только в системе межгосударственных отношений внутри Совета сотрудничества, но и в масштабах ближневосточного региона в целом. Не говоря уже о резко возросшей с того времени значимости Катара, как одного из ведущих финансово-энергетических центров планеты, играющего заметную роль в мировых хозяйственных связях.