Его умелая политика заключалась не в том, чтобы уничтожить других Великих Ануннаков, а в том, чтобы подчинить их себе. После того как строительство Эсагиля было завершено, Мардук пригласил остальных богов в Вавилон и предложил поселиться в храмах, специально построенных для каждого из них на территории священного места. Шестая таблица вавилонской версии «мифа творения» описывает пир, устроенный Мардуком после окончания строительства. «Вот Вавилон - жилье ваше ныне, - сказал он. - Радуйтесь в нём, веселитесь, ликуйте». Приняв его приглашение, остальные боги действительно превратили Вавилон в то, что подразумевает его название - «Врата божьи».
Как рассказывает миф, боги заняли места перед высоким помостом, на котором восседал сам Мардук Среди них были «Семь богов Судьбы». После пира и совершения всех обрядов - после того, как «возвышенное в Эсагиле сотворили, все уставы назначили, все предначертанья», Энлиль:
Признавая декларацию о «мирном сосуществовании» лидера клана Энлиля, Энки сказал:
Перечисляя все молитвы, которые люди должны возносить в честь Мардука и других богов, собравшихся в Вавилоне, Энки провозгласил:
Объявив о своих пятидесяти именах - что гарантировало ему числовой ранг, равный пятидесяти, как у Энлиля и Нинурты, - Мардук превратился в бога богов. Не единственного бога, а верховного, которому должны были подчиняться остальные.
Хотя новая религия, провозглашённая в Вавилоне, не имела ничего общего с монотеизмом, учёные (и особенно на рубеже девятнадцатого и двадцатого веков) увлечённо спорили по поводу утверждения, что идея триединства зародилась в Вавилоне. Признавалось, что новая вавилонская религия подчёркивала родственную линию Энки - Мардук - Набу и что свою божественную сущность Сын получал от Отца. Указывалось, что Энки называл Мардука «наш сын» и что само имя верховного бога МАРДУК, означает «сын священного места» (П. Йенсен), «сын космической горы» (Б. Мейснер), «сын сияющего дня» (А. Деймель) или просто «истинный сын» (В. Паулюс). В то время все ведущие «ассирологи» были немцами, и это является следствием того факта, что немецкое археологическое общество - оно играло также важную роль в политической и культурной жизни Германии - провело серию раскопок в Месопотамии с 1899 по 1917 год, пока Ирак не перешёл под британский контроль.
Раскопки Древнего Вавилона (несмотря на то что большинство находок датировались седьмым веком до нашей эры) привели не только к пониманию того, что библейский миф творения имеет месопотамские корни, но и вызвали жаркие споры среди учёных и теологов на тему «Вавилон и Библия». После того как стал известен миф о погребении Мардука и его последующем возвращении, во многих работах зазвучал вопрос- не был ли Мардук «Христом из Ура»?
Со временем этот вопрос, ответ на который так и не был получен, исчез сам собой - послевоенная Европа, и особенно Германия, столкнулась с более важными проблемами. Однако следующий факт не подлежит сомнению: Новый Век, провозглашённый Мардуком в Вавилоне примерно в 2000 году до нашей эры,
Анализируя четыре тысячелетия религии Междуречья, Торкилд Якобсен («The Treasures of Darkness») указывал, что основной переменой в начале второго тысячелетия до нашей эры стало появление национальных божеств взамен универсальных богов предыдущих двух тысяч лет. Прежняя множественность божественных сил, писал Якобсен, «требовала способности различить, оценить и сделать выбор», причём не только между богами, но и между добром и злом. Присвоив себе силу других богов, Мардук уничтожил возможность выбора.
Национальный характер Мардука, утверждал Якобсен (в работе под названием «Toward the Image of Tammuz»), создавал ситуацию, «в которой религия и политика оказывались неразрывно связанными» и в которой боги «через знаки и предзнаменования активно направляли политиков в своих странах».