О судьбе белых эмигрантов, воевавших в Гражданскую войну, написал в своей «Энциклопедии белого движения» историк С. Волков, который приводит много сведений касательно арестов бывших белогвардейцев. Так, из Белграда был вывезен в СССР бывший председатель Югославского отдела НСНП забайкальский казак Георгий Перфильев. Впрочем, известный деятель и историк НТС Борис Прянишников считал, что Перфильев был советским агентом и за это негласно исключен из Союза. Это не кажется таким уж невероятным, поскольку известно, что в последующие десятилетия Перфильев сотрудничал в московской газете «Голос России», издававшейся Обществом по культурным связям с соотечественниками.
Один из руководителей НСНП Евгений Дивнич, председатель белградского отдела, работавший в министерстве по делам восточных территорий Германии, также был арестован и вывезен в СССР. Там он остался жить и после освобождения.
По предложению Берии 7 июля 1945 года аппараты уполномоченных НКВД на фронтах были преобразованы в аппараты уполномоченных НКВД при Группе советских оккупационных войск в Германии (генерал-полковник И. А. Серов), Центральной группе войск в Австрии, Венгрии и Чехословакии (генерал-лейтенант Павел Мешик), Северной группе войск в Польше (генерал-лейтенант Николай Селивановский) и Южной группе войск в Румынии и Болгарии (начальник войск по охране тыла 3-го Украинского фронта генерал-майор И. М. Павлов)[60]
.В Советской зоне оккупации Германии сотрудники военной контрразведки по настоянию Серова, бывшего старшим оперативным начальником, не имели возможности вести оперработу среди местного населения, ограничиваясь работой в самих частях, что в итоге привело к конфликту между Абакумовым и Серовым.
Тем не менее, несмотря на сопротивление бывших соратников, военным контрразведчикам удалось к декабрю 1945 года ликвидировать 620 групп нацистских диверсантов «Вервольф».
Сотрудники «Смерша» вместе с органами НКВД и НКГБ участвовали в проверке военнопленных — бывших солдат и офицеров Красной армии, а также советских граждан, угнанных на работу в Германию, содержавшихся в проверочно-фильтрационных лагерях НКВД и проверочно-фильтрационных пунктах фронтов. Из 1 млн. 682 тыс. общей численности проверяемых советских людей было арестовано около 16 тыс. чел., почти 144 тыс. отправлены для продолжения проверки в ПФЛ НКВД, остальные были освобождены и направлены в армию и в родные места[61]
.Судьбой 36 освобожденных из плена генералов РККА также занимались органы «Смерша». 25 из них в итоге обрели свободу, а 11 генералов «за сотрудничество с немцами» оказались в советской тюрьме под следствием «Смерша».
Органы «Смерша» участвовали в «фильтрации» — проверке военнопленных и репатриантов из числа советских граждан. Организацией всего этого занимался 2-й отдел ГУКР «Смерша», возглавляемый полковником Сергеем Карташовым.
Среди захваченных советскими органами безопасности власовцев оказался и бывший председатель Чехословацкого отдела НСНП Дмитрий Брунст. Уроженец Киева, инженер-строитель по образованию, он после недолгого ареста гестапо работал на немецкой радиостанции, которая вела вещание на советской территории, а затем был одним из руководителей русской секции и читал лекции в лагере подготовки административного персонала для оккупированных советских территорий в Вустрау. Неоднократно выезжал в командировки в оккупированные немцами Киев, Днепропетровск и другие города. В июне 1944 года Брунст был вновь арестован гестапо, но в апреле 1945 года освобожден вместе с другими вождями НТС по ходатайству Власова и принят на работу в штаб ВС КОНР. После ареста органами «Смерша» находился в заключении, но избежал высшей меры и умер уже после освобождения в 1970-х годах.
Из Чехословакии не по своей воле под конвоем вернулись на родину в 1945 году колчаковский военачальник генерал-лейтенант С. Н. Войцеховкий (активно работал по линии РОВС в Мукдене и Праге, умер в лагере в 1951 году); казачий генерал-майор Г. И. Долгопятов; начальник 6-го отдела РОВС капитан 1-го ранга Я. И. Подгорный (умер в Москве во время следствия); дроздовец полковник А. К. Фридман; сотрудник штаба Деникина и Врангеля полковник А. М. Шкеленко (до 1938 года служил в том же чине в армии Чехословацкой республики, умер в заключении) и др.