Съезд открылся в большом зале в здании Собрания армии и флота, присутствовало около 600 делегатов. По утрам проводились общие заседания, вечерами шли заседания по казачьим войскам. Такой способ работы оказался весьма выигрышным, т.к. у присутствующих на съезде видных политических деятелей складывалось впечатление полного единства всего российского казачества. За время работы съезда заседания посетили такие видные политические деятели, как А.Ф. Керенский, М.В. Родзянко, А.И. Гучков, П.Н. Милюков, Н.В. Некрасов и В.Д. Набоков, иностранные послы и военные атташе. На заседаниях присутствовало множество зрителей. Основной лозунг, выдвигавшийся на съезде, — «Война до победного конца», делегаты активно выступали за созыв Учредительного собрания. По всей видимости, к этому периоду относится и свидетельство главнокомандующего войсками Петроградского военного округа Генерального штаба генерал-майора П.А. Половцова:
С первых дней работы выявились противоречия между фронтовой казачьей молодёжью и представителями казачьих регионов, в основном стариками. Главным итогом работы общеказачьего съезда стала общая резолюция, включавшая такие положения, как: единая и неделимая Россия, широкое местное самоуправление, война до победы, почётный мир, вся власть Временному правительству до созыва Учредительного собрания и решения вопроса об образе правления. 13 июня делегаты избрали состав Совета Союза казачьих войск — постоянного, достаточно представительного и вполне легитимного казачьего органа, который должен был работать в перерыве между съездами. В Совет сроком на три года было избрано 36 (по другим данным — 38) человек пропорционально численности их казачьих войск, многие из них ранее состояли во Временном совете: Дон — войсковой старшина А.Н. Греков, сотник П.П. Калмыков (оба — бывшие члены Временного совета), есаул А.И. Аникеев, прапорщик (по другим данным — сотник) А.Ф. Худяков (оба — от строевых частей), учитель П.И. Ковалёв, урядник А.И. Попов (оба — делегаты с мест); Кубань — есаул Бережный, урядник П.А. Авдеев, есаул Д.Г. Новосильцев (оба — бывшие члены Временного совета), подъесаул А.В. Винников (от строевых частей), хорунжий В.К. Бардиж, сотник В.Я. Поночевный, В.Д. Гамалий, Г.Н. Колков; Терек — Г.А. Ткачёв (член терского Войскового правительства, бывший член Временного совета), сотник П.Д. Мигузов (от строевых частей), подхорунжий В.Ф. Зайцев, фельдшер К.А. Шамшин (оба — бывшие члены Временного совета); Оренбург — войсковой старшина А.И. Дутов (бывший член Временного совета), А.Ф. Пономарёв, войсковой старшина Н.С. Анисимов, И.Е. Соколов (бывший член Временного совета); Урал — А.А. Михеев, хорунжий Г.М. Мусатов, сотник Г.Е. Герасимов; Забайкалье — Ф.Г. Тюменцев; Сибирь — И.И. Лаптев (умер в сентябре 1917 г.), Е.Я. Глебов (бывший член Временного совета); Семиречье — А.Г. Сидоров; Астрахань — А.И. Попов (бывший член Временного совета), П.В. Колоколов, Б.Д. Самсонов; Амур — А.А. Вертопрахов; Уссури — С.Ф. Ларионов; Енисей — И.С. Макридин (бывший член Временного совета); Красноярск — И.Л. Лукин[310]. Каждое войско должно было выплачивать по 500 руб. в месяц на содержание одного своего депутата, кроме того, казачьи войска должны были оплачивать аренду помещения и канцелярские расходы Совета Союза казачьих войск — по 1000 руб. в год на депутата. Общая сумма взносов всех войск за год должна была составить 231.000 руб., однако свой взнос выплатило лишь Донское войско. На двух последних заседаниях съезда зачитывались протоколы его работы. К сожалению, стенограмма заседаний съезда была уничтожена в ноябре — декабре 1917 г. при разгроме помещений Совета большевиками.