Будущий атаман закончил школу садоводства в Балте, служил унтер-офицером, позже прапорщиком в конной гвардии, воевал на фронтах Первой мировой войны. В конце 1917 года Семен Заболотный стал мелким чиновником Центральной Рады в Балтском уезде и одновременно организатором Савранской сотни Подольского куреня вольных казаков. Осенью 1918 года он фигурировал в числе организаторов восстания против гетмана Скоропадского и оккупационных войск. Именно тогда в густых Савранских лесах сформировался «партизанский край», который давал убежище повстанцам вплоть до осени 1924 года. Кстати, в 1941–1944 годах Савранские леса стали базой уже советских партизанских соединений.
В декабре 1918 года Семен Заболотный оказывал помощь войскам Петлюры в захвате Балты, Бирзулы, Ананьева. Но с февраля следующего года он отказался от непосредственного подчинения Петлюре и вскоре вступил в противостояние с «Сечью» атамана Божко. В мае 1919-го на Савранщине был организован мощный повстанческий отряд, в котором атаман Кощовой (Кошевой)[54]
стал командиром, а Заболотный — начальником штаба. Вскоре Семен Заболотный возглавил крестьянское восстание против большевиков в Балтском уезде. Повстанцы отбивали конфискованный у крестьян хлеб и скот, уничтожали документацию по продразверстке, нападали на продотряды, осуществляли террористические акты против представителей советской власти. Но в конце июня 1919 года отряд Заболотного был разбит большевистскими частями. Спастись удалось только атаману и шестерым его товарищам.В середине августа 1919 года, когда власть ослабела и части красных стали отступать на север Украины, атаман Заболотный стал во главе крупной повстанческой группировки, пытавшейся контролировать территорию от Балты до Ольгополя. Став атаманом-диктатором «республики Савранского леса» (Савранского, Будейского, Черницкого, Кишевского, Бондуривского, Переймского лесов), Заболотный наложил контрибуцию на местных евреев и поборы с крестьян на «повстанческую армию», проводил мобилизацию в свои отряды местной крестьянской молодежи. Эти меры, естественно, привели к настоящей войне между частями Заболотного и местным отрядом крестьянской «республики» села Песчаное.
В сентябре того же года Семен Заболотный временно распустил свои отряды, но уже в ноябре 1919 года провел новую мобилизацию, призвав крестьян к восстанию против режима Деникина, который с октября укрепился на севере Одесской губернии. В своих воззваниях он утверждал, что способен сам создать местную власть, и заявлял, что «Деникина и Колчака нам не нужно, не нужно Всероссийского Учредительного собрания».
В 1919 году Заболотный напрямую не подчинялся никаким политическим «центрам», хотя поддерживал связь как с боротьбистами, так и с петлюровскими командирами. В декабре этого года он наладил тайную связь с частями Украинской галицкой армии, которая недавно, как мы уже упоминали, перешла на сторону белогвардейцев. Войдя в состав армии Деникина, части УГА были отведены в район Балта–Одесса–Тирасполь в тыл на переформирование и отдых. Несмотря на то что галицкие генералы перевели УГА к белым, большинство офицеров были против этого решения. Они возобновили связь с армией Петлюры и украинскими повстанцами. Галичане тайно переправили часть вооружения и патронов из арсеналов белогвардейцев в Савранские леса — к Заболотному. В январе 1920 года атаман Заболотный разгромил мелкие гарнизоны белогвардейцев и взял под свой контроль Балтский уезд.
Свой отряд в две-три тысячи сабель и штыков атаман Заболотный называл «Черноморским повстанческим войском». Это «войско» имело свой политический центр — Повстанческий совет, который в разное время возглавляли атаман одного из повстанческих отрядов Деревьяга, подручник армии УНР Чехович (псевдоним Гуляй-Беда) и бывший студент Лещенко. При Повстанческом штабе имелся политический отдел, который возглавлял бывший чиновник министерства внутренних дел Директории Дороганич-Перейдидорога и некий Крещак. Совет и политотдел проводили агитационную работу среди населения, красноармейцев и повстанцев, выпускали листовки и прокламации. Штаб Заболотного состоял из 30 человек (начальник штаба полковник Совенко, его заместители — поручик Садовский и бывший авиатор и учитель Нога).
В начале 1920 года Красная армия, разгромив белогвардейцев в Центральной Украине, вышла в район Балта–Саврань. В этот период Заболотный думал покаяться, перейти на сторону победителей. Но для атаманских формирований в Красной армии уже не было места. В феврале–марте 1920 года Заболотный снова распустил большую часть своего отряда и сам ушел в тень — в лесную чащобу.
Во время Первого зимнего похода войск УНР командующий армии Омельянович-Павленко наладил связь с Петлюрой через атамана Заболотного. В то же время чекисты указывали на связь Заболотного с Румынией и на тайные поездки атамана за пограничный Днестр.