9 марта 1918 года Муравьев учредил на подвластной ему территории Украины военно-революционные трибуналы. Через несколько дней после оставления Одессы воинством Муравьева была создана Комиссия УНР по расследованию злодеяний большевиков. Эта комиссия вскрыла массовые захоронения жертв террора, подняла со дна моря десятки трупов замученных и утопленных жертв.
До 12 марта 1918 года Муравьев командует войсками Одесской советской республики{4}, которая не признавала верховной власти Советской Украины. Однако удержать Одессу Муравьев не смог.
11 марта советские войска в панике покинули оборонительные позиции в 10 километрах от города и бежали в Одессу. Муравьев отдает приказ своим частям "отступать в направлении Одесса - Вознесенск, при приближении к Одессе врага открыть огонь всеми пушками по буржуазной и национальной части города и разрушить ее...". Приказ об уничтожении Одессы Муравьев отдает и кораблям Черноморского флота: "...вступить в бой и открыть огонь по городу и его буржуазным кварталам". К счастью, этот приказ моряки не выполнили. В противном же случае тяжелая морская артиллерия могла разрушить жемчужину Юга Украины с ее дворцами и курортами, театрами и памятниками.
12 марта в восемь часов вечера Муравьев начал отводить свое в панике бегущее войско на Николаев. Утром следующего дня в Одессу вошли австро-немецкие войска.
Муравьев заявляет, что не признает Брестского мира с немцами и будет делать все, чтобы его сорвать. Однако через десять дней он оставляет свою "армию" на погибель в степях Украины и едет в Москву, чтобы начать политические баталии в коридорах власти (вспомним: его кумир тоже "забывает" свою армию - в Египте).
Прибывшего 1 апреля в Москву Муравьева встречали как триумфатора, особенно постарались ораторы левых эсеров. Левоэсеровская партия видела в нем главного "военного вождя революции". Ленинское правительство предложило ему пост командующего Кавказской советской армией, однако Шаумян (лидер большевиков Закавказья) прислал протест против назначения авантюриста и насильника Муравьева в Закавказье. "Бросок на Юг" не состоялся.
Муравьев заявляет, что в сдаче Одессы виноваты рабочие, "резко выступавшие против советской власти под лозунгом Учредительного собрания. Защитить Одессу стало невозможно. Город дал всего 500 красногвардейцев, в то время как в городе - 120 тысяч мужчин-пролетариев. Ухожу в отставку. Невозможно работать при всеобщем недоверии.
В конце марта 18-го одесские газеты сообщили, что был арестован "сподвижник и адъютант Муравьева" некий Юров. Он стал известен одесситам тем, что реквизировал особняки "на нужды революции", а потом продавал их бывшим владельцам.
Когда Лениным был подписан "позорный" Брестский мир и войска Германии и Австро-Венгрии с согласия Москвы уже продвигались по Украине, чистокровный русский Муравьев чуть было не стал "хохлом Муравенко". Ленину необходимо было скрыть свою двойную игру, скрыть от "германца", что части, сформированные в России, воюют с австро-германскими войсками в Украине. Посылая тысячи людей на фронт под немецкие пули, большевики обманули и предали их. Все уже было решено в Бресте... Ленин также считал, что обман сработает для привлечения украинцев в состав советских войск. В апреле 1918 года Ленин писал в тайном послании "комиссару Украины" Серго Орджоникидзе, что возникла нужда в "безоговорочной перелицовке имеющихся на Украине наших частей на украинский лад". Ленин приказывал: "Нужно запретить Антонову называть себя Антоновым-Овсеенко - он должен называться просто Овсеенко. То же самое нужно сказать о Муравьеве (если он останется на своем посту, и о других)".
В начале апреля 1918 года заканчивалось время союза большевиков с левыми эсерами и анархистами. Недавние "подельники" большевиков выступили против Брестского мира, продразверстки и диктатуры ленинской партии. Они требовали отставки Ленина. Анархистские газеты шокировали лозунгами свержения диктатуры Ленина, призывали к "третьей антибольшевистской анархической революции".
В середине апреля 1918 года анархистские военные отряды Москвы и Петрограда были внезапно разгромлены, Сотни анархистов оказались за решеткой. Тогда же был арестован и Муравьев по обвинению в превышении власти на Украине, в вакханалии расстрелов и реквизиций, а главное, в связях с анархистами-заговорщиками. Возможно, Муравьев готовился в анархистские диктаторы, собирался использовать хаос анархистского правления для установления своей власти. Только тогда правительство и ЧК вспомнили о расстрелах и грабежах на Украине, о самовольном оставлении фронта, об огромных деньгах "Юга", растворившихся в хаосе "муравьевского управления".