По состоянию на 1 января 1973 г, инозаказчикам было продано 19 самолетов: в Италию, ФРГ, Чехословакию, Югославию, Болгарию, Афганистан и Польшу. На этом дело не закончилось. В 1974-75 гг за границей эксплуатировалось уже 62 самолета Як-40. Они летали в следующих странах (в скобках — число самолетов): Афганистан (3), Болгария (8), Венгрия (1), Вьетнам (4), Замбия (2), Италия (3), Лаос (1), Польша (13), Чехословакия (15), ФРГ (5), Югославия (4), Прошло еще несколько лет, и к концу 1980-х гг число поставленных за рубеж самолетов Як-40 достигло 125 (по другим данным — 130), а список стран-эксплуатантов пополнили Ангола, Камбоджа, Куба, Мадагаскар, Экваториальная Гвинея и Эфиопия.
К сожалению, существовавшие одно время радужные перспективы продвижения Як-40 на рынки развитых западных стран не реализовались в полной мере. В 1975 г велись переговоры с авиакомпаниями США, Канады и Франции о закупке ими таких самолетов. Проводилась работа с вероятными покупателями в Великобритании, Австрии. Однако по ряду причин эти переговоры так и не вылились в подписание контрактов.
С распадом СССР и воцарением новых принципов экономической деятельности изменились и условия эксплуатации самолетов Як-40 в гражданской авиации. Так, в России от Аэрофлота отпочковалось большое число мелких авиакомпаний, каждая из которых располагала небольшим парком Як-40. Вот лишь несколько названий из этого большого списка. Як-40 в варианте «Салон» использовались авиакомпанией «Россия» (бывший 235 ОАО Аэрофлота), авиакомпаниями «БАРКОЛ», «Ак Барс Аэро» и «Тулпар» (последние две — в Татарстане), «Русджет» и «СКОЛ» и целым рядом других, в том числе таких крупных, как «ЮТэйр».
1990-е гг были периодом упадка в гражданской авиации на постсоветском пространстве, резкого сокращения объема перевозок на авиалиниях, в том числе местных. Тем не менее, Як-40 продолжали летать на регулярных рейсах, наиболее активно в России, как между крупными городами, так и небольшими районными центрами. 12 июня 2000 г открылся регулярный рейс Москва-Минск, выполнявшийся на Як-40 Орловского авиапредприятия совместно с авиакомпанией «Трансаэро». Некоторые авиакомпании стали использовать Як-40 для чартерных полетов в служебном варианте. Так, в середине 2000 г авиакомпания «Авиалайн» начала полеты на Як-40 VIP между областными центрами Центральной России по программе «Воздушное такси». Наконец, некоторые крупные частные компании («Газпром», «ЛУКОЙЛ», «АвтоВАЗ») приобретали для своего руководства самолеты Як-40, переоборудованные в VIP- варианты по спецзаказам.