Была проведена штабная игра, в ходе которой сразу проявились недостатки. Условный противник обнаружил ударную группу и с успехом отразил нападение. Причинами стали отсутствие визуального контакта и радиосвязи между самолетами, из-за чего сбор ударной группы в воздухе был очень затруднен, а также низкий уровень подготовки летчиков — боевые полеты с палубы подлодки совершали только два человека.
В ходе игры и ее анализа часть летчиков открыто заявила о несогласии с планом, что вывело из себя Аризуми и его заместителя Фукунагу. Тем не менее, они внесли в план некоторые изменения. В частности, дату удара согласовали с фазой луны, чтобы взлет и сбор группы происходил при лунном свете, и отказались от торпедной атаки. В новой редакции плана все самолеты вооружались бомбами. Командир авиагруппы с лодки I-400 Ацуши Асамура в личной беседе с Аризуми предложил провести самоубийственную атаку, используя тактику камикадзе. Он считал, что только это компенсирует низкую подготовку и может исключить промахи при бомбометании. Согласившись, Аризуми отдал негласное распоряжение заблокировать механизмы сброса бомб на всех самолетах. В начале мая план атаки был окончательно утвержден командованием Объединенного флота Японии.
Весной командование рассматривало еще один вариант применения «Сейранов». В марте вице-адмирал Дзисабуро Одзава предлагал в отместку за массированные бомбардировки японских городов нанести удар по городам на Западном побережье США при помощи «фарфоровых» бомб системы «Удзи», наполненных бактериями чумы и сибирской язвы. Но начальник Генерального штаба Исидзиро Умедзу не поддержал Одзаву, опасаясь ответных ударов со стороны США.
20 мая утвердили списки экипажей самолетов «Сейран» всех четырех подводных лодок. Лидером ударной группы назначили Ацуши Асамуру.
Лодка I-400. Самолет № 1: летчик — Казуо Такахаши, стрелок — Тору Юшимине. Самолет № 2: летчик — Хисао Ватанабе, стрелок — Ко Шимаоко. Самолет № 3: летчик — Шуджи Окуяма, стрелок — Йорозу Ватанабе.
Лодка 1-401. Самолет № 1: летчик — Ацуши Асамура, стрелок — Суео Такано. Самолет № 2: летчик — Нобуо Такахаши, стрелок — Еигоро Норо. Самолет № 3: летчик — Macao Охаши, стрелок — Томонори Нишино.
Лодка 1-13. Самолет № 1: летчик — Киюкозау Фуруя, стрелок — Катсумото Ямамото. Самолет № 2: летчик — Широ Дои, стрелок — Такеши Тсуда.
Лодка 1-14. Самолет № 1: летчик — Нобуо Токунага, стрелок — Такаюруки Кашивара. Самолет № 2: летчик — Матсуносуке Накахара, стрелок — Хидео Камеи.
Аризуми не объявил своим летчикам о том, что им предстоит совершить самоубийственные атаки. Он решил сделать это непосредственно перед вылетом, но пилоты заметили, что механизмы сброса бомб заблокированы, и начал назревать конфликт. Некоторые летчики посчитали себя оскорбленными, так как самоубийственную атаку против неодушевленных шлюзов расценили как унижение самурайского духа. Казуо Такахаши на повышенных тонах заявил своему командиру: — Мы не боимся стать камикадзе, но почему Вы не могли открыто заявить нам правду!». Тот ответил, что это не его решение, а засекречивание некоторых деталей операции сделано для сохранения душевного спокойствия личного состава. Конфликт удалось приглушить, но напряженные отношения в коллективе сохранились.
5 июня начались тренировки авиагруппы. Во избежание бомбардировок американской авиации они проводились исключительно в ночное время. Сначала отрабатывался сбор ударной группы в воздухе, затем — полет по маршруту. Через десять дней начались условные бомбометания по макету ворот шлюзов. Сбросы бомб в этих упражнениях не проводились, так как бомбодержатели на всех «Сейранах» были уже переделаны. В ходе тренировок группа потеряла два самолета и их экипажи — пилоты заблудились и врезались в гору.
На дальнейший ход событий оказала влияние оперативная обстановка на Тихом океане. Несмотря на отчаянное сопротивление, японский флот и армия сдали Окинаву. В результате американцы получили плацдарм, с которого можно было готовить высадку непосредственно на Японские острова. Удар по панамским шлюзам утратил свою стратегическую важность, и японское командование отменило операцию. Нужно было спасать свой дом.
Согласно приказу командования Императорского флота № 95 от 25 июня 1945 г., все морские силы должны были противодействовать американским кораблям, чтобы не допустить высадки десанта на Японские острова. Аризуми вызвали в Главный штаб и поставили перед ним и его флотилией новую задачу — нанести самоубийственный удар по американским кораблям в районе атолла Улити.