Дислокация кораблей флотилии на 1 октября была следующая: у Сулина находились «Sava», «Barsch», «Compo», у Рени — «Bodrog»; у Браилова — «Hebe» с командованием Дунайской флотилии, «Bosna», «Wels», «Viza», пароход «Bessarabec» и минное судно «Una» с речным минным отрядом; у Журжево — «Enns»; у Зимницы — «Fogas»; у Корабии — «Koros»; у Лом-Паланки — «Csuka»; у Калафата — «Temes».
Когда события стали развиваться дальше, царь Фердинанд отрекся от престола, и его наследник король Борис объявил демобилизацию болгарской армии, причем должно было быть принято условие беспрепятственного прохода через Болгарию войск Антанты. Австро-венгерские и германские войска были вынуждены уйти обратно. Германским войскам, входившим в состав болгарских армий, приказали сосредоточиться в Малой Валахии; им следовало в Рущуке и Лом-Паланке перейти в оккупированную центральными державами область Румынии. Таким образом, пришлось отказаться от завоеванного с такими большими жертвами Дунайского пути.
Дунайская флотилия вновь получила оперативное задание сконцентрироваться на фланге нового фронта и обеспечивать переход своих войск через Дунай.
«Bodrog» был отозван из Рени и вышел 11 октября вверх на Рущук. Для наблюдения за нижним участком Дуная у Сулина была введена постоянная смена находившихся в Браилове и Сулине сторожевых кораблей.
Уже «Bodrog» наблюдал у Рени сосредоточение войск румын. В Килийском рукаве Дуная вооружался и погружал мины румынский флот. Казалось, что приготовления румын направлялись больше против Добруджи. В соответствии с этим болгары делали все, что было в их силах для создания и укрепления своих позиций на Дунае. Главное командование, в лице Макензена, учитывая все эти обстоятельства, объявило, что войска центральных держав, в случае вооруженного конфликта между Румынией и Болгарией, на первых порах вмешиваться в боевые действия не будут.
12 октября командование Дунайской флотилии получило следующую телеграмму из штаба Макензена:
«Задачи Дунайской флотилии с 16 октября 1918 г.
1. Обеспечение и наблюдение за судоходством и обеспечение его охраны на участке Браилов — Сулин до принятия на себя охраны морскими силами Средиземноморской дивизии[76]
.2. Готовность к заграждению фарватера ниже Браилова по линии прежнего заграждения.
3. Обеспечение румынского берега против действий болгарского берега на участке Браилов — Турну-Северин. Главные пункты переправы для возвращающихся из Болгарии германских войск — Лом-Паланка и Рущук. Переправа войск Антанты считается возможной у Силистрии, Тутракана, Рущука, Систова, Турну-Магуреле, Корабии, Ряхово и Лом-Паланки.
4. Донести о базировании и распределении речных боевых сил флотилии».
Хозяйственные интересы центральных держав должны были отныне отступить перед военными нуждами. Эвакуация всех менее необходимых вспомогательных кораблей и барж Дунайской флотилии из Браилова началась, и для ускорения этого мероприятия у Центрального транспортного управления был запрошен пароход «Achilles».
Главный этап был перенесен из Орсовы в Уйвидек. Дальнейшее оставление дивизиона тральщиков в Сулине казалось нецелесообразным, тем более, что включенные в него моторные катера были существенно необходимы для охраны границ. Поэтому дивизион тральщиков Черного моря распустили и его вспомогательные единицы ушли в Браилов.
Пароход «Bessarabec» не смог бы из-за своей осадки уйти вверх по Дунаю, поэтому он был отослан в Одессу, где ценные плавучие средства и несколько моторных катеров еще ожидали приемки их австро-венгерским морским флотом.
Между тем французские войска медленно оттесняли отступавшие болгарские и германские части и пробивались к Дунаю.
Об отступлении союзных войск из Болгарии, Сербии и Албании генерал-полковник Арц пишет:
«Наша слабая оборонительная линия, расположенная между Нишем и Лесковацем (Leskovac), не могла удержаться против нажима противника. 12 октября Ниш был сдан противнику. Состоявшая из германских дивизий 11-я армия, под командованием генерала Штеубена, отступила на высоты между Алексинацем и Крушевацем, позади западной Моравы, хотя противник еще не нажимал там, но в долине Тимока 2-я сербская армия захватила Зайчар, а французская кавалерийская дивизия проникла за Видин…»