Император Павел усмотрел в этом своего рода ультиматум и тайное стремление масонов прибрать к своим рукам государственную власть. Он еще больше утвердился в этом мнении, когда узнал, что среди высших чинов министерства полиции немало масонов. И Павел принимает для себя окончательное решение — «искоренить» масонство. Однако у него хватает сообразительности, чтобы официально не отдавать такого приказа, ибо император понимает, что курс на решительное «искоренение» может обернуться противоположным результатом — жребием «извести» государя. И Павел решается лишь на то, что запрещает масонам собираться в ложах, проводить собрания и осуществлять бесконтрольные связи с зарубежными «братьями». Большую надежду он также возлагает на войну. Союз с Турцией и война против революционной Франции, по его мнению, должны отвлечь внимание масонов от престола и политических интриг, а также невольно возбудить в них чувства национального патриотизма, что и заставит их порвать связи с иноземным тайным орденским руководством.
Однако «сценарий» императора не совсем удался…
В это время осложнилось положение в Италии. Неаполитанская монархия выступила против Римской республики. На помощь Риму пришли французы. Они вступили также в Неаполь и провозгласили там в январе 1799 года Партенопейскую республику. Павел I выразил готовность оказать помощь свергнутому неаполитанскому королю. Русская армия выступила против Франции. В апреле русские войска во главе с Суворовым вошли в Милан. Французские войска освободили Италию и перешли за Рейн. Армия австрийской монархии, выступавшей в этой войне союзницей России, находилась в это время в Швейцарии. Австрийцы должны были начать совместные военные действия с русской армией. Однако австрийцы словно специально поторопились вывести свои войска из Швейцарии. Русская армия, которой надлежало сменить австрийцев на военных позициях, начала хаотичное перемещение. Отдельные части русских войск оказались полностью изолированными друг от друга, что дало возможность французам нанести ощутимые удары. Таким образом русская армия неожиданно оказалась в «ловушке». Полного поражения удалось избежать лишь благодаря мужеству и находчивости Суворова и героическому переходу русских через Альпы.
Павел I был возмущен австрийцами. Он дал приказ о возвращении русской армии. Таким образом, эта война, кроме отдельных героических эпизодов самой русской армии, не принесла российскому императору желаемого политического эффекта.
И это поспешили использовать его враги, в том числе масоны, упрекавшие императора в предательстве орденских интересов.
В конце 1800 года Павел I почувствовал, что против него зреет недовольство, что надвигается какая-то опасность. Он отдает приказ срочно завершить строительство Михайловского замка.
В конце января — начале февраля 1801 года, когда в замке еще не совсем просохла краска император переехал в свой «неприступный» дворец. Он окружил себя усиленной охраной. Однако крепость, в которую он добровольно себя заточил, оказалась не очень надежной. Ему не помогли ни караулы, ни каменные стены и брустверы, ни подъемные мосты и водные рвы. В ночь на 12 марта 1801 года Павел I был убит в собственном замке.
Ходило предание, что Павел был приговорен к смерти масонами за его непослушание, нарушение орденской клятвы и невыполнение обещаний покровительствовать «вольным каменщикам». Насколько были верны эти слухи, сказать трудно.
Достоверно известно лишь то, что среди заговорщиков действительно были члены ордена.
После смерти Павла I масоны вновь воспряли духом и развернули бурную деятельность. Кое-что ими было подготовлено ранее. В частности, масоны предусмотрительно обхаживали будущего императора Александра I. Обязанности в этом смысле были распределены заранее и весьма четко. Например, масон А. А. Жеребцов, сын урожденной О. А. Зубовой, принимавшей участие в заговоре против Павла І, уже в 1796 году в числе других придворных масонов состоял при Великой княгине Анне Федоровне, супруге Великого князя Константина Павловича. «Братья» умело распределили между собой и другие «влиятельные» места.