Биофизика познает рак

В табл. 6 приведены только различия в аминокислотной последовательности М- и Н-форм ЛДГ у цыплят. Указаны порядковые номера аминокислот в пептидной цепи и избранные триплеты характерных для них кодонов. Из 85 различий в 70 случаях (82%) предполагаемая замена аминокислоты при переходе от Н₄-формы к М₄-форме могла происходить по принципу изменения одного из нуклеотидов триплета (чаще всего по первому нуклеотиду кодона — 61 случай) или по сдвигу рамки чтения (9 случаев). В 12 случаях необходима замена двух нуклеотидов триплета. Это данные в пользу возможного объяснения различий между двумя изоформами белка, характерными для разных состояний пролиферативной активности тканей, механизмами ошибочного чтения кодонов.

Однако в трех случаях — замена аланина на лизин (ГЦУ и ААА), серина на глутамин (УЦУ и ГАА) и глицинина на метионин (ГГУ и АУГ) — такое объяснение не подходит. В этих случаях единственно возможное объяснение замен связано с генетической регуляцией, с репрессией одних локусов генома и депрессией других при изменении пролиферативной активности тканей. Удивляет малый процент таких случаев (3,5%).

Таблица 6. Различия в аминокислотной последовательности М- и Н-форм ЛДГ у цыплят (выписка из работы Торфа и соавторов)

2

5

6

9

10

12

13

14

15

17

18

19

20

24

30

41

43

45

M

УЦА

ГАУ

ЦАУ

ЦАЦ

ААУ

ЦАУ

AAA

ГАГ

ГАА

ЦАЦ

ЦАЦ

ГЦУ

ЦАУ

УЦА

ГЦГ

АУГ

ГАУ

ГЦУ

Ser

Asp

His

His

Asn

His

Lys

Glu

Glu

His

His

Ala

His

Ser

Ala

Met

Asp

Ala

H

Thr

Glu

Lys

Thr

Pro

Ala

Ala

Gly

Ser

Thr

Val

Pro

Ser

Thr

Gly

Gly

Gly

Cys

АЦА

ГГУ

AAA

АЦЦ

ЦЦУ

ГЦУ

ГЦУ

ГГГ

УЦУ

АЦЦ

ГУЦ

ЦЦУ

УЦА

АЦА

ГГГ

ГГУ

ГГУ

УГЦ

49

54

73

75

78

79

80

84

88

91

93

98

116

123

124

130

132

133

M

АЦУ

ГУУ

AAA

ЦЦЦ

АЦУ

УЦА

ГГУ

УЦА

ЦАУ

ЦУУ

АУУ

ГЦУ

АУУ

ААЦ

ГУУ

ГАУ

AAA

ЦУУ

Thr

Val

Lys

Pro

Phr

Ser

Gly

Ser

His

Leu

He

Ala

He

Asn

Val

Asp

Lys

Leu

H

Ala

Leu

Gin

His

Val

Ala

Asp

Ala

Asn

He

Val

Val

Val

Gin

He

Asn

Val

He

ГЦУ

ЦУУ

ЦАА

ЦАЦ

ГУУ

ГЦА

ГАУ

ГЦА

ААУ

АУУ

ГУУ

ГУУ

ГУУ

ЦАА

АУУ

ААУ

ГУА

АУУ

135

147

150

153

167

172

175

183

190

192

199

212

213

215

217

222

224

226

M

АУУ

ГЦУ

АУУ

УУУ

УЦУ

ЦАУ

ГГУ

ЦУА

ГУУ

ЦАГ

ЦЦУ

ААГ

ГЦА

ЦАУ

ГАУ

ГЦА

AAA

ЦАУ

Не

Ala

He

Phe

Ser

His

Gly

Leu

Val

Gln

Pro

Lys

Ala

His

Asp

Ala

Lys

His

H

Val

Thr

Leu

Leu

Thr

Tyr

Ala

Thr

Leu

Glu

Ala

Gln

Gln

Asp

Ala

Lys

Ser

Asn

ГУУ

АЦУ

ЦУУ

УУА

АЦУ

УАУ

ГЦУ

АЦУ

ЦУУ

ГАГ

ГЦУ

ЦАГ

ЦАГ

ГАУ

ГЦУ

АЛА

АГУ

ААУ

236

243

249

258

260

263

264

268

272

273

276

280

231

284

285

296

297

300

M

ГАУ

AAA

АГУ

ГАУ

ГЦУ

АУА

АУГ

ЦГУ

ЦЦУ

АУУ

ГЦУ

АУГ

ЦАУ

AAA

ГАУ

ГГУ

УЦА

АУУ

Asp

Lys

Ser

Asp

Ala

He

Met

Arg

Pro

He

Ala

Met

His

Lys

Asp

Gly

Ser

He

H

Glu

Arg

Asn

Glu

Cys

Met

Leu

Tyr

Ser

Val

Leu

Thr

Tyr

Gln

Asn

Ser

Ala

Leu

ГАА

АГА

ААУ

ГАА

УГЦ

АУГ

ЦУГ

УАУ

УЦУ

ГУУ

ЦУГ

АЦГ

УАУ

ЦАА

ААУ

АГУ

ГЦА

ЦУУ

302

304

305

306

307

310

314

315

316

325

329

331

333

M

ГАУ

ГУУ

AAA

АУГ

АУА

ЦЦУ

ГАА

ЦАГ

АУУ

ГГУ

ГАА

ЦАА

УУУ

Asp

Val

Lys

Met

He

Pro

Glu

Gln

He

Gly

Glu

Gln

Phe

H

Ser

He

Asn

Gln

Lys

Asp

Ala

Lys

Leu

Ser

Asp

Lys

Leu

АГУ

АУУ

ААУ

ЦАГ

AAA

ГАУ

ГЦА

ААГ

ЦУУ

АГУ

ГАУ

AAA

УУА

Примечание. Цифры в таблице — номера аминокислот по порядку, буквы — сравниваемые нами триплеты кодонов.

К абсолютному большинству случаев замен аминокислот, как указано выше, вероятно, применимы закономерности, работающие в простейших модельных системах во внеклеточных условиях и вне генетической регуляции.