В конце 1930-х гг. ряд сортов селекции П. П. Лукьяненко (Гибрид 622, Краснодарка 622/2, Первенец Н 51) был районирован, а их автор в 1940 году получил Большую серебряную медаль ВСХВ.
Во время войны П. П. Лукьяненко вывез селекционный материал в Алма-Ату, где продолжил свои опыты. В 1944 г. им была создана Скороспелка 2; в 1945 г. ― Новоукраинка 83, имевшие более высокую урожайность. В 1946 году автор новых сортов стал лауреатом Сталинской премии, а в 1948 году — академиком ВАСХНИЛ.
Большим успехом П. П. Лукьяненко стал сорт Безостая 4, полученный скрещиванием Скороспелки 2 и украинской Лютесценс 17. Безостая была на 20 см. ниже Новоукраинки и на 5–7% урожайнее.
В 1955 году П. П. Лукьяненко на основе Безостой 4 создал Безостую 1, ставшую главным его достижением в селекции. Она давала 35–40 ц/га на полях и порядка 60 ц/га на сортоучастках; имела короткий стебель; была устойчива к ржавчине; не осыпалась, что было особенно важно при механизированной уборке.
Безостая 1 широко распространилась в нашей стране и за рубежом. Она также стала ценным источником селекции, широко используемым и в настоящее время.
В 1955 году П. П. Лукьяненко был награждён Большой золотой медалью ВСХВ. В 1957 г. он стал Героем Социалистического Труда; в 1959 г. ― лауреатом Ленинской премии; в 1964 г.
— академиком АН СССР. Он был также избран почётным академиком и получил правительственные награды ряда стран, где сорта его селекции заняли большие площади. Так, в Венгрии его Безостая-1, Скороспелка 3б, вместе с Мироновской 808 селекции В. Ремесло заняли 80 % всех посевов пшеницы[157].
В 1969 г. П. П. Лукьяненко была вручена золотая медаль им. Мичурина. В 1971 г. он стал дважды Героем Социалистического Труда. В 1972 году были районированы новые сорта селекции П. П. Лукьяненко Кавказ и Аврора. В 1979 г. ему ещё раз была присуждена Государственная премия СССР.
П. П. Лукьяненко опубликовал более 150 научных работ, в том числе 8 книг и брошюр. Он читал лекции на ежегодных курсах для кубанских агрономов в своём институте.
В своих теоретических взглядах и практической деятельности П. П. Лукьяненко был твёрдым сторонником мичуринского направления, возглавлявшегося академиком Т. Д. Лысенко. В своей селекционной работе он неоднократно применял мичуринский метод географически отдалённого скрещивания и разработанный Т. Д. Лысенко приём направленного изменения наследственности путём преобразования яровых в озимые. Как и Т. Д. Лысенко, П. П. Лукьяненко критически относился к пропагандировавшимся тогда оппонентами мичуринцев методам использования химических и радиоактивных веществ для получения новых сортов пшениц. Он писал: "Пшеница является одним из первых растений, с которым были начаты работы по получению искусственных мутаций воздействием рентгеновский лучей, а позже и других ионизирующих излучений… искусственный мутации у пшеницы изучаются уже около сорока лет … Несмотря на это, ни одного сорта пшеницы, ни в одной стране мира таким способом не выведено" [158]. Нарком земледелия СССР И. А. Бенедиктов отмечал: "Преданным учеником Лысенко, высоко чтившим его до конца своих дней, был и Павел Пантелеймонович Лукьяненко, пожалуй, наш самый талантливый и плодовитый селекционер". Когда идеологические противники Т. Д. Лысенко предприняли против него во второй половине 1960-х гг. массированную диффамационную кампанию, П. П. Лукьяненко совместно с другими известными учёными-сельскохозяйствен-никами направил письмо в правительство с описанием работ советских селекционеров и протестом против очернения их достижений.
Безостая 1 изображалась на почтовых марках. На родине дважды Героя Социалистического труда П. П. Лукьяненко был установлен его бюст. Его работы по селекции продолжаются в Краснодарском НИИ сельского хозяйства им.
Лукьяненко. Раз в три года за достижения в селекции присуждается золотая медаль им. П. П. Лукьяненко.
В. Н. Ремесло