После войны адмирал Тоёда говорил, что японскому флоту трудно было осуществить свой оборонительный план «Сего» в условиях, когда развивалось наступление американских войск на Филиппинские острова. «Мы чувствовали, — заявил он, — что направить оперативное соединение в район залива Лейте для нас означало пойти на серьезный риск. Вместе с тем было бы ошибочно думать, что на нас не влияло общественное мнение нашей страны, где все чаще стали спрашивать — чем, собственно, занимается наш флот, если он сдает на юге одну позицию за другой. Без участия же Соединенного флота наши силы, базировавшиеся на Филиппинских островах, не имели никаких шансов на успех. Поэтому и было решено рискнуть и отправить к заливу Лейте весь флот. Если бы все пошло удачно, мы могли неожиданно добиться хороших результатов, но могло произойти худшее, и тогда мы потеряли бы весь флот. Лично я считал, что нас ждет именно этот исход».
Другой офицер японского флота высказался об этом иначе: «Мы должны были что-то делать, и мы сделали все, что могли. Это был наш последний шанс, хотя и не очень удачный».
Японские адмиралы решили пожертвовать авианосцами. Это решение было принято неожиданно и оно совершенно не предусматривалось первоначальным планом «Сего». Курита получил приказание вести основные силы флота от Сингапура на север, а соединение авианосцев адмирала Окидзавы в составе четырех кораблей должно было немедленно отправиться из Японии и полным ходом идти на юг. Третье соединение под командованием адмирала Симы направлялось с острова Формоза также на юг. Таким образом, три соединения японского флота должны были двигаться к заливу Лейте, однако предполагалось, что непосредственно в залив войдут только два соединения.
Перед авианосцами стояли две задачи: самолеты авианосцев должны были нанести удар по 3-му флоту США и затем (так как летчики не умели производить посадку на палубу авианосца) отправиться на аэродромы на острове Лусон. Японские авианосцы, после того как их самолеты поднимутся в воздух, должны были оставаться в водах Филиппин и двигаться на север, чтобы отвлекать на себя американский флот. Авианосцы, служившие приманкой, возможно, погибли бы. В этом японское командование отдавало себе отчет, но японский флот или по крайней мере Тоёда хотел принести эту жертву, рассчитывая, что она позволит 2-му флоту Куриты пройти на восток через проливы между Филиппинскими островами и атаковать американские корабли, сосредоточенные для вторжения в заливе Лейте.
2-му флоту было приказано любой ценой уничтожить американские транспорты с войсками в заливе Лейте. Здесь японскому флоту предоставлялась последняя возможность спасти положение, так как потеря залива Лейте означала бы потерю Филиппин. А потеря Филиппин повлекла бы за собой потерю всей ост-индской нефти, что нанесло бы японским военно-морским силам смертельный удар. Силы имперского флота вышли в море с одной целью — выполнить это задание или погибнуть.
Казалось, что авианосцам, выполнявшим роль приманки, грозила неизбежная гибель, хотя не исключалось и то, что им удастся уйти. Японский 2-й флот располагал семью линейными кораблями и представлял собой большую силу. В его состав входили два крупнейших в мире линейных корабля — «Ямато» и «Мусаси». Этих гигантов эскортировали 13 крейсеров и 18 эскадренных миноносцев. Приказ командующего японским флотом Тоёды о проведении этой операции привел к крупнейшему в истории морскому сражению. Значительную роль в этом сражении суждено было сыграть американским подводным лодкам.
Командование американских военно-морских сил, разумеется, не знало о японских планах. Но все-таки из различных источников к нему просачивались некоторые сведения. О многом можно было догадываться, многое сообщали командиры подводных лодок Тихоокеанского и Азиатского флотов, действовавших в районе Лусона, островов Рюкю и близ Японии. К середине октября стало очевидно, что японцы собирают все имеющиеся морские силы для сражения в водах Филиппин.
15 октября подводная лодка «Бесуго» обнаружила соединение японских авианосцев. Между 8 и 9 час. были запеленгованы три тяжелых крейсера и один легкий. Они направлялись на юго-восток, в открытое море, и шли со скоростью 18 узлов. В 11 час. 15 мин. были обнаружены один крупный военный корабль и эскадренный миноносец, которые шли по тому же курсу со скоростью 20 узлов. На следующий день подводная лодка «Бесуго» сообщила о двух тяжелых крейсерах, вышедших из пролива Бунго. Командир лодки предпринял маневр с тем, чтобы перехватить один из них. Был произведен торпедный залп. Подводная лодка сообщила о том, что крейсер получил повреждение.
Близ островов Рюкю подводная лодка «Скэйт» 15 октября атаковала один из трех крейсеров, вышедших из пролива Бунго, и сообщила, что крейсер был ею поврежден.