Ведение разведки возлагалось на все без исключения японские лодки, выходившие в море. При этом, помимо самолетов, они использовали оптические приборы, документы с потопленных транспортов, опрос захваченных пленных, радиопеленгование и радиоперехват. В последние годы войны для разведки использовали радиолокацию. Здесь надо сказать, что радиотехническое вооружение на японские ПЛ внедрялось чрезвычайно долго и с большим трудом. Командиры кораблей быстро оценили его достоинства, но МГШ проявил удивительный консерватизм. Так, капитан 3 ранга Хасимото в феврале 1943 г., будучи командиром I-158
, по собственной инициативе установил на ней один из образцов авиационной РЛС. Опыт не дал положительных результатов, и МГШ не стал разбираться в причинах. Лишь в сентябре 1943 г. на Ro-44 (капитан-лейтенант Фудзимото) смонтировали станцию обнаружения надводных целей, а внедрение станции обнаружения воздушных целей затянулось вплоть до февраля 1944 г. Объяснялось это тем, что МТД не хотел принимать на вооружение армейские образцы (как технически не приспособленные к морским условиям), а разработку своего завершил лишь в конце ноября 1943 г. Планомерное оснащение японских лодок радиотехническим вооружением началось в феврале 1944 г. Вместе с тем, МГШ и командование Шестого флота не смогли (или не захотели) разработать оперативно-тактические приемы его боевого использования. В результате, радиолакационные станции порой становились причиной гибели японских ПЛ. Показателен пример Ro-55, Ro-112 и Ro-113, которые были потоплены в течение одной недели (соответственно 7-го, 11-го и 12-го февраля 1945 г.) у о. Лусон американской ПЛ Batfish, выходившей в атаку по данным станции радиотехнической разведки (AN/APR-1). Ее успех обеспечили сами японцы, длительное время не выключавшие свои РЛС обнаружения воздушных целей. Только к концу воины МГШ ввел в действие инструкции по повседневному и боевому использованию радиотехнического вооружения, строящиеся корабли получили новые формы надстроек и ограждения рубок, снижавшие радиолакационную заметность, легкие корпуса покрывали специальным каучуковым составом, а механизмы (в том числе и вспомогательные) монтировали на двухкаскадных амортизаторах, что снижало уровень первичных аккустических полей.Среди специальных операций Шестого флота можно выделить обеспечение летающих лодок "Каваничи" (H8K1) во время атаки Перл-Харбор. Для этой цели I-15, I-19
и I-26 оборудовали цистернами для перевозки и передачи в море авиационного топлива. 28.02.1942 г. I-15 и I-19 заняли позицию у атоллов Френч-Фригейт. Навигационное обеспечение операции осуществляли: I-26, патрулировавшая в 200 милях к юго-западу; Ro-61 и Ro-62, занявшие позицию между атоллами Вотье и Френч-Фригейт. 3.03.1942 г. летающие лодки дозаправились с I-15 и I-19. 4.03.1942 г. они нанесли удар по Перл-Харбор. Подобный рейд планировали повторить в рамках операции по захвату атолла Мидуэй, но американцы узнали о планах МГШ и заранее развернули у атоллов Френч-Фригейт свои противолодочные корабли. Сама идея использовать ПЛ для обеспечения летающих лодок в открытом океане нашла продожение в создании специальных кораблей типа SH. Боевые лодки для этой цели использовались лишь в конце 1942 г., когда I-21 у Соломоновых о-вов дважды передавала топливо на летающие лодки "Каваничи" (H8K1), ведшие разведку в районе о-вов Фиджи и Самоа.Лодки привлекались для спасения экипажей погибших кораблей и самолетов. В отличие от американцев, японцы не смогли организовать надежную систему спасения. Подобные операции проводились без достаточной подготовки и не согласовывались с другими силами флота. Так, 3.03.1943 г. I-17
и I-26 направили из Рабаула в море Бисмарка для спасения экипажей судов и кораблей, разгромленного противником конвоя. Одновременно сюда пришли несколько эсминцев, командиры которых не знали о присутствии лодок. Лишь благодаря случайности японские офицеры раэобрались в обстановке. 4.03.1943 г. I-17 и I-26 подобрали с воды 350 человек, которых доставили 5.03.1943 г. в Рабаул. Ранее упоминавшиеся Ro-55, Ro-112 и Ro-113 вышли в море для спасения экипажей сбитых самолетов. Их действия не были согласованы с авиационным командованием и командиры были вынуждены все время использовать радиолакационные станции для определения местоположения своих самолетов.Японские лодки высаживали на побережье противника агентов армейской разведки, готовились к высадке достаточно крупных десантов, имевших на вооружении даже танки. Для решения последней задачи привлекались "стандартные" крейсерские лодки и разрабатывались специальные транспортные корабли.
Б.8 Использование быстроходных японских ПЛ против боевых кораблей