29.12.1941 г. На подходах к атоллу Кваджелейн, Ro-60
(26-й ДПЛ) в штормовых условиях, из-за поломки гирокомпаса, выскочила на риф и, спустя 2,5 часа, была разбита о камни. Часть экипажа корабля погибла. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 и Ro-67 (27-й ДПЛ) пришли на атолл Кваджелейн. Ro-33 и Ro-34 (21-й ДПЛ) пришли в Такао.2.01.1942 г. Корабли Четвертой и Пятой эскадр пришли в пункты базирования. I-16
(1-й ДПЛ), I-20 (2-й ДПЛ) и I-22 (3-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к Гавайским о-вам для поиска и атаки боевых кораблей противника.29.12.1941 г. На совещании в Императорской ставке командующий Шестым флотом высказал недовольство деятельностью подводных сил в первый месяц войны и в качестве основной причины назвал неправильную организацию их боевого использования, навязанную командованием Объединенного флота и МГШ. Он предложил отказаться от участия ПЛ в совместных операциях с НК и перенацелить их на борьбу с торговым судоходством. Для успешного решения задачи вице-адмирал Мицуми Симидзу планировал сформировать пять оперативных соединений постоянного состава, находившихся в его непосредственном подчинении. МГШ не согласился с предложениями командующего Шестым флотом, но разрешил сформировать три соединения, получивших названия: Группа А — из ПЛ Шестой эскадры, для действий к востоку от 117° Ost и борьбы с боевыми кораблями, идущими из Австралии к о-вам Голландской Индии; Группа В — из ПЛ Пятой эскадры, для действий к западу от 106° Ost и борьбы с судоходством в Индийском океане; Группа С должна была быть сформирована после оккупации Малайи и действовать в районе между 103° и 117° Ost, обеспечивая захват Явы и Суматры.
3.01.1942 г. Ro-33
и Ro-34 (21-й ДПЛ) вышли из Такао и направились к о. Анамбас для борьбы с судоходством противника. I-24 (4-й ДПЛ) вышла с атолла Кваджелейн и направилась в район Гавайских о-вов для поиска и атаки боевых кораблей противника.4.01.1942 г. I-1, I-2
и I-3 (7-й ДПЛ), I-4, I-5 и I-6 (8-й ДПЛ), I-10 (Второй флагман Второй эскадры ПЛ) сосредоточились в районе к юго-востоку от о. Оаху для борьбы с боевыми кораблями противника, следующими в Перл-Харбор. I-4 (капитан 3 ранга Накагава) на подходах к Перл-Харбор потопила американское торговое судно (4858 т). I-57 (19-й ДПЛ, капитан 3 ранга Накадзима) в районе к северо-востоку от Реданга потопила голландское торговое судно (3077 т).5.01.1942 г. I-56
(19-й ДПЛ, капитан 3 ранга Охаси) на подходах к Редангу потопила два голландских торговых судна (суммарным водоизмещением 5100 т).7.01.1942 г. I-65
и I-66 (30-й ДПЛ) вышли из порта Самах и направились в район к юго-западу от о-вов Ява и Суматра для борьбы с судоходством противника. I-121 и I-122 (13-й ДПЛ) вышли из бухты Кам-Рань и направились в Давао. I-62 и I-64 (29-й ДПЛ) вышли из порта Самах и направились в Бенгальский залив для борьбы с судоходством противника.8.01.1942 г. I-123
и I-124 (9-й ДПЛ) вышли из Такао и направились в Давао.9.01.1942 г. I-16
(1-й ДПЛ), I-20 (2-й ДПЛ), I-22 (3-й ДПЛ), I-24 (4-й ДПЛ), I-1, I-2 и I-3 (7-й ДПЛ), I-4, I-5 и I-6 (8-й ДПЛ), I-7 (флаг 2-й эскадры ПЛ) получили приказ сосредоточить усилия на поиске и атаке американского ОС TF.14 (во главе с АВ Saratoga). I-56 (19-й ДПЛ, капитан З ранга Охаси) на подходах к Редангу потопила английское торговое судно (2857 т) и два судна (американское и голландское, суммарным водоизмещением 5065 т) повредила.10.01 1942 г. I-6
(8-й ДПЛ, капитан З ранга Инаба) атаковала тремя торпедами в 500 милях к юго-востоку от о. Оаху американский АВ Saratoga. Взрыв одной из торпед нанес тяжелые повреждения кораблю (шесть человек погибло и затопило часть КО), но он смог своим ходом дойти до Перл-Харбор и затем перейти в Бремертон для ремонта, который продолжался около трех месяцев. Командир I-6 доложил о гибели АВ. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 (флаг командира группы, 27-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к архипелагу Бисмарка для проведения разведки в интересах соединения вице-адмирала Нагумо. Ro-67 (флаг командира группы, 27-й ДПЛ), Ro-63, Ro-64 и Ro-68 (33-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к западному побережью США для обстрела береговых объектов. Деятельность этих ПЛ обеспечивал тендер Дзuнгей (флаг Седьмой эскадры ПЛ контр-адмирала Ониси). ЛКР Юра (флаг Пятой эскадры ПЛ), I-121 и I-122 (13-й ДПЛ), I-123 и I-124 (9-й ДПЛ) прибыли в Давао. I-65 (30-й ДПЛ, капитан-лейтенант Харада) к югу от о. Ява потопила английское торговое судно (2950 т). I-66 (30-й ДПЛ, капитан З ранга Яоситоме) в районе к юго-западу от о. Ява потопила американское торговое судно (З500 т). I-24 (4-й ДПЛ) на подходах к о. Оаху обнаружила американский АВ Lexington и, будучи в надводном положении, начала его преследовать, пытаясь выйти в торпедную атаку.