15.05.1942 г. I-162
и I-164 (29-й ДПЛ) направились к атоллу Кваджелейн.16.05 1942 г. I-28
(14-й ДПЛ) доложила о неисправности одного из ДГ и получила приказ следовать на атолл Трук. Ro-63, Ro-64 и Ro-68 (33-й ДПЛ), I-22 (3-й ДПЛ) и I-29 (14-й ДПЛ) пришли на атолл Трук. Флоту была передана I-11, которая возглавила 3-ю эскадру ПЛ. I-8 стала вторым флагманом 8-й эскадры ПЛ. Бортовой ГСМ с I-21 (3-й ДПЛ) произвел облет о. Сува (о-ва Фиджи). I-28 (14-й ДПЛ) вышла с атолла Трук и направилась в район к юго-западу от Соломоновых о-вов для поиска и атаки боевых кораблей противника. I-27 (14-й ДПЛ) вышла с атолла Трук и направилась к северному побережью Австралии, имея на борту карликовую ПЛ.17.05.1942 г. В 230 милях от Кагосимы, американская ПЛ Triton
обнаружила идущую в надводном положении I-164 (30-й ДПЛ) и с дистанции 30 кабельтов выпустила по ней торпеду, которая попала в цель. I-164 затонула со всем экипажем. В 45 милях к югу от атолла Трук американская ПЛ Tautog, выйдя в надводном положении из полосы дождя, обнаружила I-28 (14-й ДПЛ) и произвела по ней трехторпедный залп. Две торпеды попали в цель. I-28 затонула со всем экипажем. Командир Tautog доложил об атаке еще одной ПЛ в этот день. Вероятнее всего, это была возвращавшаяся на базу I-24 (3-й ДПЛ). I-24 благополучно возвратилась на атолл Трук. I-29 (14-й ДПЛ) вышла с атолла Трук и направилась к северному побережью Австралии, имея на борту карликовую ПЛ.18.05.1942 г. I-2
и I-4 (7-й ДПЛ) вышли из Сингапура и направились в Куре. I-162 (29-й ДПЛ) пришла в Сасебо. I-3 (7-й ДПЛ) и I-5 (6-й ДПЛ) пришли в Куре.19.05.1942 г. I-171
и I-172 (13-й ДПЛ) пришли на атолл Кваджелейн. Ro-65 (26-й ДПЛ) пришла на атолл Трук. Ro-63 и Ro-64 (33-й ДПЛ) вышли с атолла Трук для противолодочного патрулирования подходов к базе флота. Бортовой ГСМ с I-30 (14-й ДПЛ) произвел облет Дар-ес-Салаама.Деятельность японских ПЛ в ходе сражения за атолл Мидуэй с 20.05. по 22.06.1942 г.
План операции по захвату атолла Мидуэй предусматривал массированное использование ПЛ, которые находились под общим руководством вице-адмирала Комацу. Их планировали развернуть в три завесы для разведки в интересах командования Объединенным флотом и атак крупных надводных кораблей противника. Первоначально МГШ выделил для участия в операции 19 ПЛ из состава 3-й, 5-й эскадр и 1З-го ДПЛ. Кроме того, две летающие лодки "Каваничи" H8K1 должны были произвести облет Перл-Харбор и определить наличие там военно-морских сил США, с дозаправкой у рифов Френч-Фригейт с лодок 13-го ДПЛ, у которых личный состав тендера Сантос Мару
на атолле Кваджелейн приспособил минные шахты под топливные цистерны (в дополнение к уже имеемым на верхней палубе). По данным МГШ, у рифов Френч-Фригейт находились американские противолодочные корабли, и полет летающих лодок к Перл-Харбор отменили. Все участвовавшие в операции по захвату атолла Мидуэй ПЛ, должны были занять назначенные позиции к 4.06.1942 г.20.05.1942 г. I-25
и I-26 (4-й ДПЛ) вышли из Куре и направились в Оминато. I-30 (14-й ДПЛ) под перископом произвела разведку подходов к порту Момбаса. Бортовой ГСМ с I-10 (флаг Восьмой эскадры ПЛ, капитан 3 ранга Каяхара, старший на борту контр-адмирал Исидзаки) произвел облет Дурбана. I-10 у восточного побережья Африки потопила английское торговое судно (4200 т). I-16 (1-й ДПЛ) у восточного побережья Африки потопила голландское торговое судно (7150 т). I-21 (3-й ДПЛ) пришла на атолл Трук.21.05.1942 г. I-162
(28-й ДПЛ) вышла из Сасебо (после восстановительного ремонта ДГ) и направилась в район к юго-западу от атолла Мидуэй. I-1 (7-й ДПЛ), I-15, I-17 и I-19 (2-й ДПЛ) пришли в Куре.23.05.1942 г. I-156, I-157
и I-158 (19-й ДПЛ) закончили текущий ремонт корпуса, механизмов и направились в район к юго-западу от атолла Мидуэй. I-168 (12-й ДПЛ) вышла с атолла Трук и направилась в район между атоллом Мидуэй и Гавайскими о-вами для поиска боевых кораблей противника. I-21 (флаг командира группы ПЛ капитана 1 ранга Ханку Сасаки), I-22 и I-24 (3-й ДПЛ), I-27 и I-29 (14-й ДПЛ) вышли с атолла Трук и направились к Сиднею для атаки боевых кораблей. Все корабли, кроме I-21, несли на себе карликовые ПЛ типа А. I-21 имела бортовой ГСМ. I-11 (флаг командующего Третьей эскадры ПЛ) вышла из Куре и направилась к атоллу Кваджелейн. Бортовой ГСМ с I-10 (флаг Восьмой эскадры ПЛ) произвел облет Порт Елизабет и Симонстауна. I-15, I-17 и I-19 (2-й ДПЛ) вышли из Куре и направились в Оминато.24.05.1942 г. I-159
(28-й ДПЛ) закончила текущий ремонт корпуса, механизмов и направилась в район к юго-западу от атолла Мидуэй. I-10 (флаг Восьмой эскадры ПЛ, капитан 3 ранга Каяхара) у восточного побережья Африки потопила английское торговое судно (7450 т).