25.10.1944 г. соединение Курита прошло пролив Сан-Бернардино и атаковало американские эскортные АВ. В ходе сражения у острова Самар "ЯМАТО" впервые использовал 460-мм орудия для стрельбы по надводным кораблям противника. Огонь пытались корректировать два бортовых ГСМ, но их сбили американские истребители. Вероятно, ЛК не добился каких либо результатов, т. к. его бронебойные снаряды, не взрываясь и не нанося существенных повреждений, насквозь пробивали небронированные американские корабли. После боя "ЯМАТО" вернулся в Бруней. 17.11.1944 г. вместе с несколькими тяжелыми артиллерийскими кораблями он направился в Метрополию и 23.1 1.1944 г. бросил якорь в Куре. Здесь корабль простоял до конца 3.1945 г. 26.03.1945 г. ЛК возглавил Первое диверсионное соединение вице-адмирала Ито, призванное защитить близлежащие к Метрополии острова. После этого JlK дважды выходил в море для отработки задач боевой подготовки и проверки работоспособности различных механизмов. После высадке американцев на Оинаве (1.04.1945 г.) был введен в действие план "Тэн №1", в соответствии с которым 6.04.1945 г. "ЯМАТО" и корабли эскорта (ЛКР и 8 ЭМ) вышли в море. 7.04.1945 г. соединение Ито обнаружили американские ПЛ и вскоре его атаковали 227 самолетов с AB американского ОС 58. В корабль попало 6 бомб. Их взрывы уничтожили одну из 127-мм АУ, часть 25-мм зенитных автоматов, РЛС тип 13, кормовую башню 155-мм орудий и систему управления огнем ПМА. Кроме того, две торпеды (по другим данным четыре) частично разрушили обшивку корпуса и в MO левого борта начала поступать вода, появился крен в 5-6°. Во второй атаке участвовало около 70 самолетов. Им удалось добиться четырех (или пяти) попаданий торпед в "ЯМАТО". Взрывы трех из них пробили ПТЗ левого борта и три КО и одно из MO заполнились водой. Крен достиг 15-16
"МУСАСИ" (провинция на востоке острова Хонсю, где расположен Токио, префектура Камагава и Сайтама). После вступления в строй вошел в состав 1-й ДЛК Первого флота и направился в Трук, куда прибыл 15.08.1942 г. С 19.08 по 5.09.1942 г. "МУСАСИ" находился в составе Главных сил вице-адмирала Haryмо и крейсировал к северу от Соломоновых островов, обеспечивая доставку подкреплений на Гуадалканал. В ходе операции артиллерия и бортовые ГСМ корабля не использовались. С 9.09 по 23.09.1942 г. "МУСАСИ" вновь крейсировал к северу от Соломоновых островов, обеспечивая доставку подкреплений на Гуадалканал и ожидая возможного боя с американскими АВ. Контактов с противником он не имел. В дальнейшем корабль продолжал базироваться на Трук, но участия в боевых действиях не принимал и выходил в море только для отработки курса боевой подготовки. В 9.1942 г. на "МУСАСИ" смонтировали РЛС тип 21 . В 5.1943 г. он направился в Метрополию для отражения американского вторжения на Алеутские острова. После отмены операции оставался в Токийском заливе до 11.1943 г. В этот период корабль прошел текущий ремонт и модернизацию, в ходе которой демонтировали бортовые башни 155-мм орудий и на их месте установили 12 127-мм орудий в спаренных установках, до 36 увеличили число 25-мм зенитных автоматов. В начале 1 1.1943 г. "МУСАСИ" возвратился в Трук и вновь вошел в состав 1-й ДЛК Первого флота. К участию в боевых действиях корабль не привлекался.