До 18 в. национальных научных кадров в Ф. не было. Единственный университет (академия) был открыт в 1640 в Або (Турку); преподавание велось на швед. языке. Исследование природы Ф., её минеральных ресурсов осуществляли иностранные, главным образом швед., учёные. Становление фин. науки связано с влиянием идей Просвещения и Великой французской революции. Положительную роль играли также контакты с развивавшейся рус. наукой и научными школами др. европейских стран. В конце 18 – начале 19 вв. получил известность 3-томный труд (1753–61) ботаника П. Калма, изучавшего флору Сев. Америки. Важной вехой в истории национальной науки стали работы по химии и минералогии Ю. Гадолина (член-корреспондент Петербургской АН с 1811), приведшие к открытию минерала гадолинита и редкоземельного элемента гадолиния. Труды Калма и Ю. Гадолина способствовали созданию фин. научной терминологии и формированию естественнонаучной литературы на фин. языке. Были разведаны месторождения медных руд в Оутокумпу и др.
После присоединения Ф. к России (1809) была усовершенствована система образования; университет был расширен и переведён (1827) из Або в Хельсинки; при университете создана астрономическая обсерватория в Хельсинки. С университетом связана деятельность многих фин. учёных. В 1842 в Хельсинки был основан Политехнический институт, также ставший одним из исследовательских центров. В 1838 организован Фин. метеорологический институт. В 1-й половине 19 в. известностью пользовались работы Н. Шультена (член-корреспондент Петербургской АН с 1821) по алгебре и др. разделам математики, И. Я. Нервандера (член-корреспондент Петербургской АН с 1842) и Г. Г. Хельстрёма по метеорологии и физике, Ф. В. А. Аргеландера (член-корреспондент Петербургской АН с 1826) по астрономии.
Во 2-й половине 19 в. круг естественнонаучных исследований значительно расширился. При университете развернули работу физическая, химическая, физиологическая и др. лаборатории, анатомический и др. институты, минералогический кабинет. Появились труды Э. Р. Неовиуса по начертательной и дифференциальной геометрии, Р. Я. Меллина по теории функций и др. Работы по фотографической астрономии вёл А. Доннер (член-корреспондент Петербургской АН с 1897). Под руководством К. С. Лемстрёма фин. учёные осуществили (1882–1883) широкую программу метеонаблюдений в рамках Международного полярного года. Активизировалось обследование территории Ф. Под руководством К. В. Гюльдена в 60-х – начале 70-х гг. составлена фин. географическая карта страны в масштабе 1: 400 000. В 1885 организована Геологическая служба Ф. Крупным техническим достижением стало строительство (1845–56) Сайменского канала. В 1862 проложена первая в стране железная дорога.
Э. Йельт написал первый фин. учебник по органической химии и ряд трудов по истории химии. Широкую известность приобрели капитальные труды ботаников В. Нюландера и Э. А. Вайнио по лихенологии. Значительными были работы Р. Хульта по геоботанике, К. Э. Хирна по альгологии и К. М. Левандера по изучению морского и озёрного планктона. И. А. Пальмен (член-корреспондент Петербургской АН с 1894) опубликовал ряд исследований по орнитологии (в т. ч. о миграциях птиц) и сравнительной анатомии. Вопросами энтомологии занимался О. Рейтер. Развитие медицины в Ф. связано с деятельностью Р. Тигерстедта, автора учебника по физиологии человека (1897–98) и ряда др. работ, анатомов Э. Ю. Бунсдорфа, Э. А. Хомена и др., терапевта И. Рунеберга, хирургов Я. А. Эстландера и Ф. А. Б. Кругиуса. Трудами Н. Г. М. Гротенфельта по полеводству и луговодству и К. Г. М. Гротенфельта по селекции с.-х. животных (фин. породы скота) было положено начало перестройке сельского хозяйства Ф. на научной основе. В конце 19 в. в Ф. работал ряд научных обществ: медицинское (основано в 1835), Фин. научное (1838; среди организаторов был Хельстрём), геологическое (1886), географическое (1888), инженеров (1896).
Начало 20 в. ознаменовало новый этап развития фин. науки. В 1908 создана Фин. академия наук и литературы, при ней в 1914 открыта геофизическая обсерватория в Соданкюле. В 1916 основаны научно-исследовательские лаборатории целлюлозы и бумаги.
После получения независимости организованы научные институты: геодезический (1918), лесоводства (1918), биохимических исследований (1929) и др. Важную роль в научной разработке проблем сельского хозяйства стал играть основанный в 1898 государственный С.-х. научно-исследовательский центр, в составе которого были созданы институты агрохимии, растениеводства, селекции растений, почвоведения, животноводства и др. Открылись новые высшие учебные заведения: университеты в Турку с преподаванием на швед. языке (1917) и на фин. языке (1922), университет в Тампере (1925), Высшее техническое училище в Хельсинки (1908). Появились новые научные общества: лесоведческое (1909), биологическое (1919, ведёт историю от студенческой ассоциации, основанной в 1896), химическое (1919) и др. Научная деятельность в Ф. стала более многообразной.