Размещение экипажа и компоновка кабины летчика осуществлялись таким образом, чтобы на всем этапе поиска цели в горизонтальном полете, при переходе в пикирование и в процессе самого пикирования летчик все время мог видеть цель. Для этого был необходим оптический прицел, головка которого должна была находиться снизу самолета, а окуляр у летчика. Подобный перископический прицел начали разрабатывать под руководством А.В.Надашкевича.
В ходе проектирования выяснилось, что отечественные фугасные и даже бронебойные бомбы не приспособлены для скоростного бомбометания с пикирования. При ударе бомб о бронепалубу их корпуса раскалывались, резко ослабляя эффект поражения корабля. А.Н.Туполев поручил А.В.Надашкевичу проработать предложения по новой системе авиабомб, с использованием рекомендаций профессора Е.А.Беркалова, крупнейшего специалиста в области систем артиллерийских боеприпасов, который также находился в этом же лагере, но только в другом бараке и занимался проектированием новых артсистем для РККА. Вскоре предложения по новой системе бомбового вооружения, включавшей бомбы калибра 100, 250, 500, 1500, 3000 кг, были подготовлены и представлены руководству НКВД и ВВС. В дальнейшем наработки по ней стали основой при работах по системам авиационных бомб типа М-43 и М-46, которые были запущены в серийное производство и долгие годы состояли на вооружении ВВС.
Работы по проекту продвигались достаточно быстро. К началу лета 1939 года проблемы по выбору основных параметров самолета "ПБ" были в основном решены. Был построен деревянный макет самолета, началась более детальная проработка проекта.
В июле 1939 года были подготовлены материалы к эскизному проекту самолета "ПБ". Согласно им, "ПБ" представлял собой цельнометаллический вы- сокоплан с крылом большого удлинения и с фюзеляжем сравнительно небольшой длины (соотношения напоминали рекордный АНТ-25) с герметическими кабинами экипажа и двухкилевым хвостовым оперением. Экипаж машины состоял из трех человек. Оборонительное вооружение, состоявшее из трех спаренных установок с дистанционным механизированным управлением под пушки ШВАК (одна установка – в носовой части фюзеляжа, для обстрела передней полусферы, две – в задней части фюзеляжа, прикрывали верхнюю и нижнюю полусферы), обеспечивало эффективную защиту самолета от истребителей. Силовая установка должна была состоять из четырех высотных двигателей М- 105ТК-2, представлявших серийные М- 105 с максимальной мощностью 1100 л.с, оборудованные турбокомпрессорами (аналогичные двигатели использовались в проекте высотного истребителя "100" В.М.Петлякова). Согласно подготовленным проектным материалам самолет "ПБ" с четырьмя двигателями М- 105ТК должен был иметь следующие данные:
– длина самолета – 15,05 м;
– размах крыла – 26 м;
– нормальная взлетная масса – 12200 кг;
– максимальная взлетная масса – 15300 кг;
– нормальная бомбовая нагрузка – 1500-2000 кг;
– максимальная бомбовая нагрузка – 4000 кг;
– максимальная скорость на высоте 8000-10000 м – 570-600 км/ч;
– нормальная дальность полета с 2000 кг бомб при скорости 400 км/ч – 1500 км;
– максимальная дальность полета при перегрузочной взлетной массе 15500 кг;
– 3500-4000 км;
– пушечное вооружение – 6 х ШВАК;
– экипаж – 3 чел.
По мере дальнейшей проработки проекта "ПБ" все острее ощущалась нехватка кадров. НКВД перетрясал все свои "закрома", присылая все новых и новых людей. В начале лета 1939 года в группу попадает бывший начальник С.М.Егера по ЦКБ-39 В.А.Чижевский, арестованный в конце 1938 года в Смоленске. В.А.Чижевский, пройдя допросы и теперь оказавшись в Болшево, продолжал искренне считать, что его арест – это трагическая ошибка, а вот все остальные, окружающие его, во главе с А.Н.Туполевым – это настоящие враги народа. Он был со всеми вежлив, но старался не заводить ни с кем дружбы – все таки враги. "Оттаял" он только через 15 лет, когда вместе со всеми получил документ о реабилитации. В группе В.А. Чижевский работал над конструкцией и общим проектированием вместе с С.М.Егером.
В июле С.М.Егера вызвали с "вещами" и перевели на завод №156, куда его направили в группу В.М.Мясищева, которая выделилась из "100" В.М.Петлякова. Новая группа "102" приступила к работам над дальним высотным бомбардировщиком ДВБ-102, в какой- то степени являвшимся конкурентом "ПБ" и ей нужны были квалифицированные кадры. С.М.Егер в "102" поступил в распоряжение С.М. Кондоре кого, бывшего начальника бригады общих видов в КБ А.Н.Туполева. С.М.Егер не успел даже освоиться на новом месте, как "воронок" на следующий день увез его обратно в Болшево к Андрею Николаевичу. Оказалось, что Туполев потребовал от НКВДешного начальства немедленного возвращения его человека назад. Для подтверждения своих аргументов он вручил им заявление об отказе от работы. С.М.Егер был возвращен к работам над проектом "ПБ".