Как говорится, инициатива наказуема, и после короткого отпуска вернувшийся на родину Мёльдерс в январе 1939 г. был откомандирован в рейхсминистерство авиации. При этом он официально числился в I./JG133 – такое обозначение 1 ноября прошлого года получила его бывшая I./JG334.
Ему было поручено написать инструкцию по опробованной им тактике действий истребителей. Правда, Мёльдерс не только сидел в берлинских кабинетах, а в течение трех месяцев посещал истребительные группы, рассказывая и обучая пилотов своей новой тактике. Когда дело было сделано и пара стала основой истребительной авиации Люфтваффе, он 15 марта вернулся на должность командира 1./JG133, которую затем 1 мая переименовали в 1./JG53.
Спустя три дня – 4 мая – Мёльдерс получил известие: генерал Франко, уже отпраздновавший победу в гражданской войне, удостоил его за «интернациональную помощь» сразу двух испанских наград – «Medalla Militaria» и «Medalla de la Campana». В конце мая «Легион „Кондор“ вернулся в Германию, и командование Люфтваффе создало специальную комиссию по награждению и организации торжеств. Успешные действия в Испании были использованы пропагандой по максимуму, и торжества вылились в восьмидневный „Фестиваль Победы“. Завершились же празднества 6 июня торжественным прохождением „Легиона «Кондор“ под Бранденбургскими воротами в Берлине. В тот же день легионерам, включая Мёльдерса, вручили специально учрежденную награду – Немецкий Испанский Крест в Золоте.
Однако уже практически после этого руководство Третьего рейха решило, что необходимо как-то выделить особо отличившихся в боях в Испании. Была срочно учреждена более высшая степень Немецкого Испанского Креста в Золоте – с Мечами и Бриллиантами. 20 июня им были награждены девять человек, в том числе шесть летчиков-истребителей, включая, конечно, Мёльдерса.
1 сентября 1939 г., когда части Вермахта вторглись в Польшу, эскадрилья Мёльдерса базировалась на аэродроме Зандхофен, на северной окраине Мангейма. Однако ее пилоты недолго сидели без дела. Поляки имели договоры о взаимопомощи с Великобританией и Францией, которые, выполняя свои обязательства, 3 сентября объявили войну Третьему рейху. Поскольку Франция непосредственно граничила с Германией и могла в любой момент подвергнуться атаке с ее стороны, британское правительство решило направить ей на помощь экспедиционные силы, в составе которых были и две авиационные группировки.
Истребители обеих сторон начали активные полеты вдоль германо-французской границы, при этом не особо ее соблюдая. Понятно, что рано или поздно это должно было окончиться прямыми боевыми столкновениями.
Около 07.00 8 сентября шесть французских «Хоков» 75А из 3-й эскадрильи GC II/4, прикрывавшие самолет-разведчик «Потез-63», в районе между немецкими городами Карлсруэ и Саарбрюккен встретились с четырьмя Bf-109E из 1./JG53 во главе с Мёльдерсом. По французским данным, в ходе короткого боя адъютант Пьер Виллье (Pierre Villey) и флайт-сержант-шеф Жан Антуан Казноб (Jean Antoine Casenobe) сбили по одному «Мессершмитту». Это были первые победы французских летчиков-истребителей в ходе Второй мировой войны.