Барбеты артиллерии главного калибра тоже радикально изменились: за счет рациональной конструкции подъемников они стали в плане круглыми, став в диаметре всего 11,3 м, что дало существенную экономию в весе по сравнению с грушевидными на “Фудзи”. Толщина их с обращенной к противнику стороны составляла 356 мм, а под защитой траверзов – 203 мм. Защита орудий главного калибра значительно усилилась: в лобовой части башни имели толщину 254, а с верху, бортов и тыла – 203 мм. Боевая рубка имела толщину брони 356 мм, а запасная кормовая – 76. Средняя артиллерия теперь вся получила казематы, но уже восьмигранные, с такой же как на “Фудзи” толщиной брони – 152 мм из гарвеированной никелевой стали в их трех лобовых частях, обращенных к противнику, и 51 – в остальных, включая крыши. Общий вес брони “Сикисимы” составил 4526 т.
Артиллерия состояла первоначально из 4 305-мм, 14 152-мм, 20 76-мм(12фн), 8 47-мм (3 фн) сорокакалиберных, 6 47-мм 33-калиберных (2,5 фн) орудий (по другим данным, 4 47/33) производства завода Армстронга. Броненосец имел 8 пулеметов Максима. По своим характеристикам орудия аналогичны тем, что устанавливались на “Фудзи”. 305-мм орудия размещались попарно в двух круглых в плане барбетах, имевших толщину бронирования 356 мм, установленных традиционно в носу и в корме и с углами обстрела по 270°. На “Сикисиме”, первом среди броненосцев японского флота, стало возможным по- настоящему полное круговое заряжание орудий главного калибра в горизонтальной плоскости. Два подъёмника обеспечивали подачу снарядов и зарядов снизу из погребов к казенным частям орудий.
Одновременно они же выполняли функции рабочих камер, содержащих запасные снаряды. “Сикисима” и три его современника “Хатсусе”, “Асахи” и “Микаса” имели тяжёлые установки эльсвикской конструкции, которых в первое время объединяло одинаковое исполнение пушечных портов в броневой защите.
Хотя подъёмники и механизмы горизонтального наведения изготавливались гидравлическими, но предусматривались дублирующие их электрические приводы производства фирмы Армстронга, а также резервное ручное управление. Скорость заряжания стала выше, чем у “Фудзи”, что позволило обеспечить для каждого 305-мм орудия минутную готовность к выстрелу, поэтому боевая скорострельность ожидалась не ниже одного выстрела за две мин.
152-мм орудия располагались побортно в средней части между барбетами главного калибра в отдельных бронированных казематах, максимально разнесённых по длине корабля и размещённых в уже знакомом шахматном порядке для того, чтобы защитить остальные орудия от повреждений при попадании в один из казематов.
С каждого борта находилось по 4 орудийных каземата в батарейной и по три – на верхней палубах.
Расположенные на верхней палубе в носовых и кормовых углах надстройки орудия имели возможность вести огонь вдоль диаметральной плоскости – их казематы несколько вытягивались вдоль нее и угол обстрела из них составлял по 135°. У остальных – по 110°. Казематы делались водонепроницаемыми как с внешней, так и с внутренней стороны защищая не только от разрыва снаряда, но и от попадания воды внутрь корабля через повреждённый порт.
Противоминная артиллерия располагалась следующим образом. Восемь 76-мм орудий устанавливались по два на каждый борт в носу и в корме батарейной палубы, четыре – на верхней палубе, симметрично относительно расположенных на миделе 152-мм пушек, четыре – на надстройке, на крышах казематов угловых стоявших в районе мостиков 152-мм орудий, и четыре – на крыльях мостиков, имея возможность вести огонь в нос и корму поверх башен главного калибра, также, как первоначально стояли двадцать 47-мм пушек на “Фудзи”.
Малокалиберные 47-мм пушки размещались: 4 – на надстройке (навесной палубе) в районе миделя, четыре – на верхних крыльях мостиков, и по три (два) орудия на каждом нижнем марсе. Из марсовых пушек четыре ставились симметрично относительно диаметральной плоскости, а две – вдоль нее. Боекомплект составлял по 60 305-мм, 200 152-мм, 300 76-мм снарядов на ствол.
Торпедных аппаратов калибром 457 мм на броненосце насчитывалось 5, как и на “Ясиме”, и размещались они аналогично, имея тот же боекомплект: 4 бортовых подводных и один носовой надводный. Последний уже защищался 102-мм бронёй. Он оказался и последним надводным аппаратом на броненосцах японского флота.
Больше их ставить не рисковали из опасения взрыва не столько боевого зарядного отделения, сколько воздушного баллона при попадании.