Однако уровни углекислого газа не выросли так сильно, как ожидалось, и эксперименты показали, что на изменения, измеряемые в воздухе, воздействовал еще один фактор: CO2 поглощался участками открытого бетона внутри Биосферы 2. Скорее как богатые кальцием горные породы в реальном мире, CO2 откладывался в виде карбоната кальция в Биосфере 2, что эквивалентно геологическим месторождениям.
Оглядываясь назад, Аллен считает, что «самая большая инженерная ошибка, которую мы совершили, заключалась в том, что мы оставили голый бетон». Мы его не красили, поэтому внутрь вошли молекулы СО2, уносящие кислород. Было падение кислорода. На это ушло шестнадцать месяцев, но уровень неуклонно падал до такой степени, что люди начинали чувствовать дискомфорт ». Было решено повысить уровень кислорода искусственно, чтобы защитить здоровье биосферы.
Нельсон вспоминает, что «люди, смотрящие на нас со стороны, говорили, что это было похоже на просмотр замедленной съемки. Отчасти это произошло из-за того, что мы сидели на низкокалорийной диете, но также и из-за наличия кислорода. Оно стало настолько низким, что нам пришлось ввести немного кислорода, чтобы восполнить его в помещении. Когда оно упало примерно до 14 процентов, мы все двинулись туда, и кислород в тамбуре составлял около 25 процентов, прежде чем он был выпущен по всей Биосфере 2.
Люди начали смеяться и бегать, а затем я понял, что не слышал звука бега три-четыре месяца. Находясь там, когда был добавлен кислород, вы действительно ценили то, что считаете само собой разумеющимся - чистый воздух, воду и пищу. Без биосферы в воздухе не было бы свободного кислорода. Это ошеломляющий вывод, но мы действительно поняли это. Я попал в облако свежего воздуха, как 95-летний мужчина, и это было похоже на то, что мое тело прошло через десятилетия. Сколько людей благодарят биосферу за кислород?»
Незапланированные изменения наблюдались не только в воздухе. Некоторые виды тропических лесов быстро росли, но страдали от слабости. То же самое произошло и с древесными породами, произрастающими в саванне. Это произошло из-за отсутствия ветров, которые в природе помогают производить прочную и упругую древесину.
Пустыня стала больше походить на калифорнийский чапараль(тип субтропической жестколистной кустарниковой растительности). Мангровые заросли преуспели и быстро росли, но отличались от такой системы в реальном мире, с гораздо меньшим количеством подлеска, вероятно, потому, что стекла уменьшали уровень солнечного света.
Среди фауны некоторые из видов позвоночных, таких как птицы, океанические рыбы и рептилии, вымерли или значительно сократились в численности. Многие насекомые-опылители вымерли. Произошел всплеск популяции видов вредителей, включая тараканов (хотя, к счастью, они взяли на себя некоторые функции опыления). Несколько видов муравьев, которые были намеренно введены для поддержания тропических лесов, резко сократились и были заменены местными видами, которые пробрались в систему так, что никто и не заметил.
В океане произошли изменения. Из-за быстрого роста водорослей ученым пришлось войти в воду и вручную удалить их с кораллов, чтобы предотвратить гибель рифа. В результате поглощения углекислого газа морем уровень углекислоты повышался, что делало воду более кислой.
Кальций был добавлен в морскую воду, чтобы противодействовать этому эффекту, поскольку он представлял угрозу для всей океанской системы, и с ним нужно было бороться до того, как возникнут серьезные последствия, включая потенциальную гибель кораллов, которые не смогут нормально функционировать в слишком кислой среде.
Несмотря на эти экологические сдвиги, команда осталась здоровой и собрала огромное количество данных, и 26 сентября 1993 года - ровно через два года после входа в Биосферу 2 - они вернулись. Помимо освещения бесчисленных аспектов функционирования жизненных систем, они показали, как творческая и здоровая человеческая культура может поддерживаться небольшим кусочком функционирующей природы. Экипаж из восьми человек процветал на 2000 квадратных метрах сельскохозяйственных угодий, крошечном кусочке атмосферы и небольшом количестве воды. Они были первыми успешными путешественниками в другую биосферу.
Марк Нельсон оглядывается на те два года и говорит, что эксперимент дал важное сообщение: «Биосфера 2 помогла понять тот факт, что люди не прибывают в скрытых упаковках, которые находятся за пределами биосферы. Жить внутри этой системы и на самом деле чувствовать ее своим телом было потрясающим опытом. Ваше тело понимало, что нельзя вредить растениям - это было немыслимо, и вам не нужно было напоминать (как садомазоводам-обрезальщикам)».
Кажется, что глубокие идеи, воплощенные в эксперименте, также были замечены широкой публикой. «Я думаю, что для многих из людей, которые приходили к нам, это задело нервы. К нам приходили люди, почти как паломники. «Это было необычайно трогательно», - говорит он.