Предчувствия и мученическая смерть
8 июля 1921 года на город Верный после урагана и проливных дождей обрушился страшный сель — грязекаменный поток чудовищной силы. Громадные тяньшанские ели вырывало из земли и крутило потоком, как спички, валуны размером с дом неслись, как песчинки. По ущелью, мимо скита на сопке Мохнатой, где обитали в скиту монахини, поток устремился в город, сметая на своем пути целые кварталы и унося сотни жизней.
В этот день отец Серафим приехал в скит на сопке Мохнатой, чтобы служить всеночную. Монахини были испуганы разбушевавшейся стихией, бегали, кричали, но Серафим лишь улыбался им ободряюще, чтобы погасить панику. В жизни своей он ничего не боялся, всегда поддерживал сестер и братьев. Разве что каждый раз, завидев вооруженного человека, он вздрагивал, словно дрожь по всему телу проходила.
Отец Серафим предчувствовал свою кончину. И своим духовным дочерям — монахиням, которые жили в старом ските на сопке Мохнатой, он говорил: «Меня не будет. Я буду здесь похоронен, а вы каждый год ходите ко мне на могилу».
Вечером 10 августа 1921 года в Кызыл-Жарский скит приехали трое красноармейцев на лошадях с ружьями. Отец Серафим встретил их приветливо, угостил их чаем и уложил спать. Сам же монах спать не стал и всю ночь читал Свящнное Писание. Проснувшись под утро, красноармейцы зашли в его келью и приставили винтовки к спине молящегося. Серафим только успел крикнуть: «Беги, Анатолий!». И в этот момент раздались выстрелы. Тело отца Серафима лишь вздрогнуло от выстрелов. Как молился, так и остался стоять на коленях в земном поклоне, одной рукой держась за столбик, а в другой сжимая четки — в такой позе он и умер.
Услышав крик, отец Анатолий, келья которого была ближе всего к келье Серафима, бросился бежать с горы вниз.
Красноармейцы же, поняв, что уже не догонят беглеца, начали шарить вокруг. Так они добрались до пещеры, где по ночам любил молиться отец Феогност. К несчастью, иеромонах к утру задремал в своей каменной келье. Не слышал он выстрелов, убивших Серафима, не слышал и шагов приближающихся убийц. А те, ворвавшись к нему, выстрелили ему прямо в сердце. И монах, спавший, скрестив на груди руки, так и почил о Господе в этой смиреной позе.
Так 11 августа 1921 года погибли от рук богоборцев два преподобомученника — отец Серафим и отец Феогност.