На следующий год динамовцы составили костяк сборной СССР, которая стала в итоге финалистом Кубка Европы, уступила лишь в завершающем матче Испании-1:2. Порой в составе сборной играли сразу шесть представителей клуба, как, например, в четвертьфинальном матче с Швецией-Лев Яшин, Эдуард Мудрик, Владимир Глотов, Игорь Численко, Валерий Короленков, Геннадий Гусаров. За олимпийскую сборную выступали Мудрик, Глотов, Виктор Аничкин, Валерий Маслов и Валерий Фадеев. Словом, динамовские игроки разрывались на несколько фронтов, а в результате итогом для «Динамо» стало 7-е место в чемпионате страны. Вдобавок после окончания первенства бело-голубые совершили длительное турне по Южной Америке, которое традиционно стало предвестником неудачного сезона. И в чемпионате-1965 под руководством нового тренера Вячеслава Соловьева команда лишь замкнула первую пятерку. Тем не менее Лев Яшин продолжал находиться в центре всеобщего внимания, 28 апреля он сыграл за сборную Европы в матче, посвященном 50-летию великого английского форварда Стэнли Мэтьюза, а в октябре вместе с торпедовцем Валерием Ворониным получил в Париже европейский футбольный «Оскар».
В сезоне 1966 года «Динамо» выступало крайне неровно, и запомнился он лишь фантастической игрой команды в Лужниках со «Спартаком», когда Игорь Численко на пару с дебютантом бело-голубых Геннадием Еврюжихиным, сделавшим хет-трик, буквально разорвали оборону красно-белых. Счет 4:0 в пользу «Динамо» полностью не отразил его превосходства на поле. К сожалению, это был лишь редкий яркий эпизод на общем блеклом турнирном пути бело-голубых. Для Численко матч с вечным соперником стал первым после возвращения с чемпионата мира, где сборная СССР добилась своего высшего достижения-завоевала бронзовые медали, уступив в игре за 3-е место португальцам. На этом первенстве вновь продемонстрировал свой выдающийся класс Лев Яшин, а Численко наверняка попал бы в символическую сборную первенства, если бы не удаление в полуфинальном матче с ФРГ, спровоцированное немецкими защитниками. А в чемпионате СССР даже беспроигрышная финишная серия из девяти матчей не позволила команде подняться выше 8-го места.
Дважды посеребренный кубок
В 1967 году «Динамо» возглавил один из его символов, самых ярких игроков в его истории Константин Бесков, и команда лишь чудом не дотянула до чемпионства, став обладательницей серебряных медалей и завоевав Кубок СССР, в финале которого был повержен ЦСКА-3:0. А первого успеха бело-голубые добились еще в марте, выиграв всесоюзный предсезонный турнир «Подснежник». Уже третий тур чемпионата свел москвичей с фаворитами-киевскими динамовцами в столице Украины. Точный удар Геннадия Гусарова принес тогда сенсационную победу гостям-3:2. К промежуточному финишу московское «Динамо» пришло первым в таблице. Признанный футбольный авторитет заслуженный мастер спорта Андрей Старостин констатировал: «Успехи лидера в значительной мере следует отнести на счет возрождения лучших традиций в игре команды с применением широкого скоростного маневра, так отвечающего духу времени…»
«Динамо» брало соперников стремительной атакой, в которой прорывы первоклассных крайних форвардов Игоря Численко и Геннадия Еврюжихина удачно завершал столь же быстрый, может быть, не такой искусный, зато результативный Юрий Вшивцев. Но с приходом в команду Владимира Козлова из «Локомотива» Бесков посадил Вшивцева на скамейку запасных, и атака бело-голубых потеряла темп: высокотехничный, но не обладавший скоростными качествами своих партнеров Козлов замедлял ее. Возможно, эта тренерская ошибка и стоила динамовцам золотых медалей. Хотя в очном поединке киевские одноклубники едва унесли от них ноги-преимущество москвичей выглядело неоспоримым. Судьба золота фактически решилась в матче московского и минского «Динамо». Несмотря на мощную поддержку своих поклонников в Петровском парке, москвичи, вынужденные выйти на поле без своих лидеров-игроков сборной Численко, Маслова и Аничкина, наблюдавших за матчем с трибуны, уступили соперникам-0:2. Проигранный вновь в том же ослабленном составе следующий матч луганской «Заре» поставил окончательный крест на чемпионских амбициях московского «Динамо».
Накануне финала Кубка с ЦСКА игроки уговорили Бескова вернуть в основной состав Вшивцева, который стал автором второго, переломного гола в игре, и «Динамо» одержало внушительную победу-3:0 (еще по голу забили Гусаров и Аничкин).
В кубковых матчах цвета команды защищали: вратари Лев Яшин, Александр Ракитский, Михаил Скоков, защитники Владимир Штапов, Виктор Аничкин, Георгий Рябов, Валерий Зыков, полузащитники Валерий Маслов, Геннадий Гусаров, Вадим Иванов, Владимир Дудко, Анатолий Суслов, Николай Бобков, нападающие Игорь Численко, Геннадий Еврюжихин, Юрий Вшивцев, Виктор Вотоловский, Борис Кох, Юрий Авруцкий. Старший тренер-Константин Бесков, тренеры-Владимир Ильин и Юрий Кузнецов.