Обеспокоенность Рузвельта, сохранявшаяся весь этот период, была смягчена первыми практическими результатами американских физиков. Второго декабря 1942 года в лаборатории Чикагского университета осуществили первую в мире управляемую ядерную реакцию. С этого времени центр тяжести в американских исследованиях начинает смещаться с теоретических и лабораторных исследований к опытно-конструкторским работам. Главной фирмой была избрана "Дюпон", чьи лаборатории и испытательные корпуса располагались в городе Уилмингтон (штат Делавер). Президент Рузвельт очертил совокупность специальных мер, направленных на сохранение секретности расширяющихся работ.
В США создавалась сложная система прикрытия крупного научно-промышленного проекта. Руководитель проекта - генерал Гроувз предпринял необычные даже для военного времени меры безопасности. И посмотрим, кого прежде всего он имел в виду. (Также меры свидетельствовали и о том, против кого мог в будущем быть использован данный проект.) Цитируем генерала Гроувза: "Через две недели после того, как я взял на себя руководство проектом, у меня навсегда исчезли иллюзии в отношении того, что Россия является нашим врагом, и проект осуществлялся именно на этой основе".
В ходе сенатского расследования генерал Гроувз (более чем десять лет спустя) рассказывал о том, что президент Рузвельт был полностью осведомлен об антисоветской направленности работы над бомбой. На этих же слушаниях офицеры
разведки говорили о тщательном "просеивании" людей, установлении наблюдения за каждым ученым с левыми убеждениями. Самого научного руководителя проекта Р. Оппенгеймера генерал Гроувз сохранил на посту только ввиду того, что его участие было "абсолютно необходимо для реализации проекта".
Рузвельт и его окружение не были уверены, сможет ли атомное оружие быть использованным в ходе текущей войны. Но они полагали, что получают могущественный инструмент воздействия на послевоенный мир, получают новый фактор международных отношений. Более всего будущую ядерную дипломатию Рузвельт обсуждал не с американцами, а с англичанином Черчиллем. Складывается впечатление, что в ответ на согласие Черчилля быть младшим партнером коалиции Рузвельт на первых порах приобщал английского союзника к атомным секретам. Но и он вскоре показался Рузвельту лишним на пути к невероятному военному могуществу. Как только американцы увидели реальную перспективу создания атомного оружия, это отразилось на дипломатии, в данном случае союзнической. Англичане, которые были так нужны на начальном этапе, теперь стали восприниматься помехой, нежелательными свидетелями, лишними потенциальными обладателями сверхоружия. Конант пишет Бушу, что "не видит смысла в совместных усилиях, когда речь заходит о собственно развертывании и производстве". От него поступает предложение ограничить сотрудничество с Англией. Причины таковы: 1) проект переводится в сугубо военную сферу; 2) именно в США производится почти вся работа по испытанию и развертыванию нового оружия; 3) соображения сохранения секрета.
Главное же открыто пока не обсуждалось: Англия теряет силы, солнце Британской империи закатывается, стоит ли вооружать партнера сверхоружием, дающим такое могущество его обладателю. Пятнадцатого декабря 1942 года Рузвельт одобряет резкое ограничение сотрудничества американцев с англичанами в атомной сфере. Неприятная работа поручается Конанту. Он уведомляет 13 января 1943 года своих английских коллег, что правила двустороннего сотрудничества меняются. Англичане и канадцы пусть в дальнейшем рассчитывают на секретную информацию только в том случае, если "они смогут использовать ее в течение данной войны". Конант (чтобы у англичан не было иллюзий) указывает, что исполняет приказы своего высшего руководства. Отныне английские исследователи не получают от американцев новых сведений по следующим вопросам: электромагнетизм, производство тяжелой воды, производство уранового газа, реакция быстрых нейтронов и все, что связано с расщеплением материалов. Черчилль буквально взорвался: новая американская политика (пишет он Рузвельту) ведет к краху англо-американского сотрудничества в области исследования атомной энергии. Черчилль напоминает Рузвельту об обещании, данном 11 октября 1941 года относительно "координированной или даже совместно проводимой работы двух стран... Решение производить работы раздельно бросает мрачную тень".