В марте 1945 г. в состав русской подгруппы соединения были переданы белорусский диверсионный батальон «Дальвитц» и украинская парашютная бригада Тараса Боровца, однако из-за царившей суматохи упомянутые части так и не прибыли в расположение соединения. Несмотря на это, Скорцени попытался восстановить разгромленное подразделение и приказал сформировать новое истребительное соединение, получившее обозначение «Ост II», его возглавил штурмбаннфюрер СС Аух. Новый состав соединения был спешно набран из различных разведшкол. Качество свежесобранных диверсантов было посредственным, да и воевать в последние месяцы войны уже не сильно хотелось даже самым убежденным борцам с коммунизмом. По этой причине соединение не справилось с заданием, полученным от Скорцени в марте 1945 г., — взорвать четыре моста через Вислу — у Варшавы, Кракова, Демблина и Торна. Из-за потерь и дезорганизации соединение было сведено в одну роту. В апреле 1945 г. она участвовала в обороне Нойештрелица. Командиром роты был назначен штурмбаннфюрер СС Хайнце.
Подгруппы «Руманиен» и «Унгарн» истребительного соединения СС «Зюдост» осенью 1944 г. участвовали в диверсионных операциях в Карпатских горах и в боях на территории Румынии. Другие подгруппы участвовали в антипартизанских акциях. Осенью 1944 г. в венгерской подгруппе была создана истребительная команда СС «Донау», в ее составе было около 30 добровольцев из частей Скорцени, кригсмарине и Русской освободительной армии[259]. Командовал этой частью гауптштурмфюрер СС Хуммель. Осенью 1944 г. команда действовала на реках Румынии, используя самые различные методы диверсий — боевых пловцов, моторные лодки с взрывчатыми веществами, вооруженные яхты и т. д. В ходе операции немцам удалось потопить советские речные суда общим водоизмещением 13 тыс. брутто т.
Задачей команды был прорыв по Дунаю на катерах к окруженному Будапешту. Операция началась поздним вечером 31 декабря, катера двигались только в темное время суток, на чины РОА была возложена задача ввести в заблуждение советских часовых в случае обнаружения катеров. В начале декабря 1944 г. в Будапеште советскими войсками была окружена почти 200-тысячная группировка венгерско-немецких войск. Окруженные очень нуждались в боеприпасах и медикаментах, поэтому Скорцени получил приказ обеспечить доставку осажденным всего необходимого. Скорцени решил осуществить прорыв в город по Дунаю. Для операции было отобрано самое быстроходное судно из всех имевшихся и баржа. Скорцени планировал прорваться в город на большой скорости. Для достижения эффекта внезапности планировалось провести операцию в новогоднюю ночь. Часть команды была одета в советскую форму. Суда смогли пройти первое кольцо советских войск, но перед вторым наскочили на мель почти в 15 км от города. На моторной лодке два добровольца пробрались в окруженный город и сообщили о своих неприятностях. На протяжении четырех ночей суда курсировали из города до баржи и вывозили направленные осажденным грузы. В первый же день красноармейцы заподозрили неладное и подошли на катере к севшим на мель судам. В состав экипажа судна был включен один русский доброволец (вероятно, эмигрант), который при подходе советского катера вступил в диалог с красноармейцами. Он предъявил фальшивые советские документы и сказал, что суда выполняют особое задание, после чего катер отошел от судов диверсантов. Грузы были доставлены в осажденный город, но диверсанты уже не смогли прорваться к Скорцени и остались в осажденном городе. По другим данным, 2 января 1945 г. катера были обнаружены и уничтожены.
В начале марта 1945 г. румынскую подгруппу (около 70 человек) и остатки венгерской подгруппы планировалось использовать в операции «Пробуждение весны». В случае успешного наступления 6-й танковой армии СС подгруппы должны были прорваться в район Плоешти и удерживать его до подхода основных немецких сил, но провал этого наступления не дал осуществиться этому замыслу. В апреле 1945 г. уцелевшие чины «Зюдоста» были собраны в Штокеррау, реорганизованы и посланы на фронт в Нижней Австрии. В конце войны соединение получило приказ прибыть в Линц. Командиром соединения был ветеран «Бранденбурга» штурмбаннфюрер СС Александр Аух.
Истребительное соединение «Зюдвест» из Тироля было переведено в район Шварцвальда, где участвовало в боях и диверсиях против американцев. В конце марта командир соединения штурмбаннфюрер СС Бек получил приказ Скорцени прибыть в Линц. Соединение начало движение и в конце апреля 1945 г. прибыло в упомянутый район. В мае часть сдалась американцам.