Однако и в этом указании содержались недостаточно четкие ориентировки. В связи с тем, что войска действующей Красной Армии к тому времени отступали по всему фронту, нереальными были такие задачи, как подготовка и заброска на территорию противника моторизованных групп для захвата сотрудников и документов вражеских разведывательных и контрразведывательных органов, вербовка агентов среди военнослужащих армий противника, задержание руководителей и ответственных сотрудников разведывательных и контрразведывательных органов противника и передача их оперативно-чекистским группам НКГБ СССР.
Непонятно была определена 100-километровая зона засылки агентуры органов госбезопасности в тыл противника, поскольку именно в этой зоне были сосредоточены войска и контрразведывательные органы противника. Разведшколы и другие формирования фашистской разведки, для внедрения в которые выводились советские агенты, были расположены в глубоком тылу.
Таким образом, несмотря на то что в указаниях 3-го Управления от 22 и 27 июля 1941 г. содержались отдельные недостаточно обоснованные установки, в целом эти указания помогли руководящему и оперативному составу органов военной контрразведки в основном правильно организовать агентурно-оперативную работу в сложной обстановке начала войны.
Народный комиссариат государственной безопасности СССР в начале войны не издавал директив, в которых бы содержались общие задачи органов госбезопасности. НКГБ СССР в своей деятельности руководствовался соответствующими постановлениями Коммунистической партии и Советского правительства.
30 июня 1941 г. НКГБ СССР был издан приказ «Об агентурно-оперативной работе на железнодорожном транспорте и предприятиях оборонной промышленности»[217]
. Согласно этому приказу в целях обеспечения успешной борьбы с вредителями, диверсантами и шпионами на железнодорожном транспорте и на предприятиях оборонной промышленности» во 2-м управлении НКГБ создавались специальные отделения.Задача борьбы с вредителями в тот период не вытекала из политической и оперативной обстановки. Во время войны советские люди отдавали все свои силы на разгром врага, всемерно укрепляли обороноспособность страны.
В связи с объединением НКГБ и НКВД СССР в единый Народный комиссариат внутренних дел СССР органы государственной безопасности руководствовались в своей работе приказами, инструкциями и указаниями НКВД СССР.
В сложной обстановке войны остро встал вопрос о необходимости централизованного руководства обеспечением безопасности государства и его Вооруженных Сил. ЦК ВКП(б), Государственный Комитет Обороны СССР и СНК СССР признали целесообразным объединить усилия органов государственной безопасности, внутренних дел и военной контрразведки и направить их на отпор врагу: борьбу с подрывной деятельностью разведки фашистской Германии, оказание всемерной помощи Вооруженным Силам в проведении боевых операций против немецко-фашистских войск, обеспечение охраны тыла страны от подрывных действий вражеской агентуры, беспощадную борьбу с дезертирами, паникерами, распространителями провокационных слухов, организацию широкой разведывательно-диверсионной и контрразведывательной работы в тылу врага.
В Указе Президиума Верховного Совета СССР от 20 июля 1941 г. говорилось: «В связи с переходом от мирного времени на военные условия работы признать целесообразным объединение Народного комиссариата внутренних дел и Народного комиссариата государственной безопасности в единый Народный комиссариат внутренних дел. Соответствующее объединение органов НКВД и НКГБ произвести в союзных и автономных республиках, в краях и областях».[218]
17 июля 1941 г. и 10 января 1942 г. постановлениями Государственного Комитета Обороны органы военной контрразведки армии и флота были выделены из НКО СССР и НКВМФ СССР, преобразованы в особые отделы и подчинены НКВД СССР. В НКВД СССР на базе ранее существовавших 3-х управлений НКО и НКВМФ было образовано Управление особых отделов НКВД СССР, в составе которого находился отдел по обслуживанию Военно-Морского Флота.[219]
Данная структура органов государственной безопасности просуществовала до апреля 1943 г.
Весной 1943 г. военно-политическая обстановка существенно изменилась. Планы фашистской Германии на «молниеносную войну» против СССР провалились. Перед органами госбезопасности вставали новые задачи, связанные с организацией работы на освобожденной советской территории, в тылу врага и на территории сопредельных государств. Однако существовавшая структура НКВД СССР не отвечала возросшим требованиям. Надо было, как и накануне войны, освободить органы госбезопасности от выполнения несвойственных им функций.