Флейта оставалась популярной на протяжении всей предыстории человечества. Но ее историю, наряду с другими духовыми инструментами, труднее проследить с момента образования в 4 тысячелетии до н. э. основных городских цивилизаций Ближнего Востока. Как ни странно, это следствие не недостатка свидетельств, а, наоборот, их множества: в то время как музыкальные инструменты таких давних времен — редкость, находят много изобразительных свидетельств (скульптур, рисунков, керамических изделий и настенной живописи) их существования. Многочисленные сцены, относящиеся приблизительно к 3000 г. до н. э., изображают музыкантов, играющих на различных инструментах.
Например, на высеченной из камня вазе из Бизмая, в Ираке, относящейся к 2600 г. до н. э., изображена группа музыкантов, один из которых дует в какой-то инструмент наподобие современного гобоя. В других случаях инструмент сделан из тростника. На флейтах играют, дуя прямо в трубку, причем звук выходит из другого ее конца или из острого срезанного края, около мундштука. Но "трубка" из Бизмая могла быть также и трубой, духовым инструментом, действующим совсем по другому принципу, где вибрация вызывается за счет губ, прижатых к мундштуку.
Египетский музыкант играет на флейте. С наскального рисунка в Фивах.
Даже изображения флейт могут вводить в заблуждение. На некоторых флейтах играли, держа их вертикально и дуя в верхнее отверстие, так что по виду они походили на трубки или трубы, что подтверждается рисунками. К счастью, в некоторых случаях такие свидетельства более определенны. У египтян были также "поперечные" флейты, действовавшие по тому же принципу, что и современные оркестровые инструменты, то есть в них дули через дырочку, находившуюся сбоку. Такие флейты можно увидеть на надгробных изображениях времен Среднего царства (2040—1780 гг. до н. э.). Некоторые из них имели более 2 футов в длину, и, судя по рисункам, для игры на них требовались довольно длинные руки.
С таким инструментом, как окарина, также все довольно ясно. Она представляет собой небольшие керамические флейты, обычно овальные по форме. История приписывает ее изобретение итальянскому музыканту XIX столетия Джузеппе Донати, что на самом деле ошибочно. Окарины впервые появились у цивилизации майя в Гватемале и Южной Мексике. Образцы этих инструментов в форме затейливых человеческих или звериных фигурок относятся по крайней мере к IX в. н. э.
Свирели также принадлежат к семейству флейт. Сделанные из нескольких тростниковых трубок постепенно убывающей длины и связанные вместе, что позволяет извлекать из них звуки разного тона, они были любимыми музыкальными инструментами древнегреческих пастухов и названы по имени бога Пана, который, как они считали, их изобрел. Первые известные образцы свирели, найденные на юге Украины, относятся к 2000 г. до н. э. Похоже, что они были независимо изобретены в разных частях света. На них играли инки в Перу, они и по сей день популярны в Южной Америке. В Древнем Китае было разработано подобие огромного губного органа. В могиле маркизы Дай, похороненной в 168 г. до н. э., находилось несколько бамбуковых свирелей высотой 2,5 фута, имевших два ряда из 22 трубок равной длины, производивших 12 нот китайской гаммы: название каждой ноты было записано тушью в нижней части каждой трубки.
Самые ранние известные тростниковые инструменты пришли из Месопотамии. Первые образцы относятся ко 2 тысячелетию до н. э., когда тростниковая трубка стала наиболее популярным духовым инструментом по всему
Ближнему Востоку. В греко-римском мире ее относили к семейству тростниковых губных трубок, известных как аулус и являвшихся предшественницами современных кларнета и гобоя. На аулусе, как это можно увидеть на греческих керамических изделиях, всегда играют по двое, каждый пальцами обеих рук. Головы музыкантов были обычно стянуты кожаными повязками, защищавшими от перенапряжения при игре без отрыва губ от инструмента.