Амиртей (404–397 гг. до н. э.) считается единственным правителем XXVIII, саисской династии. Вскоре он был низложен и убит, а к власти пришла основанная Неферитом I XXIX династия из г. Мендес в Центральной Дельте Нила (397–380 гг. до н. э.). Ее первые цари сменялись у власти довольно быстро; лишь фараон Акорис правил около 13 лет (392–379 гг. до н. э.), стремясь упрочить царскую власть и создать систему выгодных для поддержания независимости Египта союзов.
Характерный энтузиазм этого времени по поводу недавнего изгнания персов и восстановления независимости Египта звучит в найденной на территории Карнакского храма стеле с записью текста, известного под названием «Исцеление Бентреш».
Согласно ему, в свое время к Рамсесу II обратился породнившийся с ним царь азиатской страны Бахтан (в ее образе совмещаются как воспоминания о Хеттской державе уже далекого прошлого, так и восприятие главного противника Египта в современности — державы Ахеменидов) с просьбой помочь исцелить свою душевнобольную (обуянную злым духом) дочь Бентреш. Фараон отправляет правителю Бахтана целительную статую фиванского бога Хонсу, и тот, после выздоровления своей дочери, решает оставить столь ценного «посредника» в контакте с божеством себе навсегда. Через некоторое время он видит во сне, как бог Хонсу в обличие сокола покидает свою статую, устремляется в Египет и после этого возвращает ее Рамсесу. В этом рассказе явно звучит воспоминание о недавнем похищении нечестивыми персами культовых статуй и утвари из египетских храмов, а также уверенность в том, что боги, настроенные благожелательно к избранной ими стране, покинут свои похищенные изображения и оставят в руках врагов Египта лишь мертвый камень и металл.
Помимо отражения персидской угрозы, Акорис задумывался и о том, каким образом централизовать страну, в которой после изгнания персов большое влияние приобрели слабо зависящие от царя группировки номовой знати. Одним из средств к этому становится попытка централизации египетских культов под покровительством царской власти. Акорис развивает вслед за Неферитом целую программу строительства в древнем Карнакском храме в Фивах, в его время уже не самом значимом в Египте. По-видимому, не имея возможности напрямую восстановить здесь культ Амона-Ра как покровителя царской власти, он особенно заботится об оформлении путей праздничных процессий, связывавших Карнак с Луксором и Мединет Абу на западном берегу Нила и имевших отношение к почитанию Амона в его ипостаси создателя мира и бога плодородия.
Вскоре после смерти Акориса к власти в результате переворота приходит уроженец соседнего с Мендесом г. Севеннит Нектанеб I (380–361/360 гг. до н. э.), основавший XXX династию. При Нектанебе I Египет успешно отражает персидское вторжение в 373 г. до н. э., но в дальнейшем не рискует полагаться только на собственные силы и вступает в союз с греческими государствами Афинами и Спартой. При Нектанебе I продолжается начатая Акорисом строительная программа в Карнаке, но еще большее внимание он уделяет местным культовым центрам: так, он начинает возведение храмовых комплексов богини Хатхор в Дендера и богини Исиды на о. Филэ на крайнем юге Египта.
Существенно, что эти строительные программы, которые будут затем продолжаться на протяжении всего эллинистического времени, связаны с популярными в Позднем Египте культами богинь-матерей: новым и обязательным компонентом храмовых комплексов с этого времени становятся так называемые