Ньютону пришлось объясняться по этому поводу на страницах «Philosophical Transactions» и потратить последние месяцы жизни на писание полной хронологии, которая и появилась в печати после его смерти, в 1728 году, под заглавием: «Хронология древних царств с присоединением краткой хроники от первых упоминаний о событиях в Европе до завоевания Персии Александром Великим».
Ньютон исходил из мысли, что сведения, сохранившиеся от древних египтян, греков и т. д., фантастичны и во многих случаях являются только поэтическим вымыслом. Колоссальная протяжённость древней истории с отдельными оазисами народов, царств и событий, по его мнению, должна быть сильно укорочена. Также он возражал против применения в расчётах длительности царствований такого показателя, как средняя длительность одного поколения. Издревле (от Геродота) срок поколения полагали равным 33 годам. Ньютон же для средней длительности царствований предложил 18–20 лет, основываясь на исторических примерах.
Наконец, он привлёк для установления хронологии соображения историко-астрономического характера.
И что же? Труд его, вызвавший большой шум тогда, теперь совершенно забыт. Да и тогда, чтобы дискредитировать сорокалетнюю работу выдающегося учёного в области хронологии, в оборот была запущена легенда, что сэр Исаак спятил из-за своих научных занятий, и что эту его книгу нельзя принимать всерьёз.
И в дальнейшем попытки пересмотра хронологии вызывали нарекания как со стороны ортодоксальных учёных, так и со стороны власти.
В 1943 году в СССР отмечали 300-летний юбилей Ньютона. По решению юбилейной комиссии были изданы два сборника статей, а также две биографические книги, первая — ставшего несколько позже известным историком физики П. С. Кудрявцева, а вторая — будущего президента АН СССР С. И. Вавилова. Её переиздали уже в следующем году, а затем еще раз в 1961.
В книге С. И. Вавилова интересна глава «Богословские и исторические работы Ньютона, и его религиозные воззрения». В ней, в частности, говорится:
«На основании всех этих соображений и получается укороченная хронологическая шкала по Ньютону. Самая древняя известная нам историческая эпоха соответствует по этой хронологии приблизительно 1125 г. до н. э.»
И здесь же следует примечание:
«В наше время не менее радикальная, но столь же неудачная, как и Ньютона, попытка пересмотра хронологии была сделана Н. А. Морозовым в его обширном сочинение «Христос».
Таково было отношение официальной власти и официальной науки к хронологическим работам и Ньютона, и Морозова. С учётом того, что книга появились при жизни Морозова, понятно, что критика направлена именно против него. В самом деле, один из ведущих учёных страны в юбилейном сборнике, посвящённом Ньютону, ни с того ни с сего показывает «заблуждения великого ума» на историческом поприще, и в примечании пишет, что это, дескать, ещё что, а вот у нас академик Морозов продолжает заблуждаться.
Есть и ещё одна параллель между восприятием личности Исаака Ньютона и Н. А. Морозова, тоже связанная с их увлечением хронологией. Так же, как и Ньютона за его работы объявляли сумасшедшим, так и про Морозова неоднократно сообщали, что, просидев достаточно долго в одиночной камере за участие в подготовке покушения на Александра II, он якобы сошёл с ума, и в этом причина его завиральных идей.
С. И. Вавилов пишет: