После победы в сражении с войсками Фасиля воины раса Микаэля схватили посланцев императора, хотя сам Фасиль сумел бежать. Кроме показаний этих посланников, оказалось, что в составе войск Фасиля было несколько подразделений из состава армии императора.
Возвратившись в Гондэр, рас Микаэль-Сыуль созвал 7 мая 1769 года собрание высших светских и духовных сановников, где предъявил императору обвинение в заговоре. Во время этого собрания Гондэр контролировался только войсками раса Микаэль-Сыуля.
Открывая заседание, рас Микаэль сказал: «По приказу императора я выступил против бунтовщиков. Император же в помощь бунтовщикам направил верных себе людей. Во время боя один из них, выполняя поручение своего властителя, пытался меня убить, но плохо прицелился, и погиб один из находившихся рядом со мной солдат».
В ходе дальнейшей дискуссии мнения разделились. Часть собравшихся высказывалась за заключение императора в тюрьму. Но возобладала другая точка зрения. Собрание знати решило, что ныгусэ нэгэст Ийоас заслуживает смертной казни посредством удушения муслиновой шалью. Через неделю по приказу раса Микаэль-Сыуля император Ийоас был задушен. После чего вся власть перешла в руки наместника Гондэра. Но ытеге Мынтыуаб никакой власти не получила и удалилась в основанный ей монастырь Кускуам.
Ликвидируя императора, рас Микаэль-Сыуль заранее подобрал на его место преемника. Им стал Йоханныс II, сын Иясу I, брат Бэкаффы. В своё время за попытку побега из Уохни-Амба по приказу Бэкаффы Йоханнысу отрубили руку. Когда его привезли в Гондэр из Уохни-Амба, ему было 70 лет, и он уже давно не интересовался политикой.
Когда рас Микаэль-Сыуль представил совету знати свою кандидатуру на пост императора, некоторые сановники возражали, ссылаясь на то, что старый, немощный, безрукий и неопытный в политике человек не сможет исполнять обязанности императора. Но эти качества устраивали раса Микаэля, и Йоханныс II был утверждён. Затем рас Микаэль-Сыуль выдал замуж за императора свою внучку Уолете-Сылласе.
Йоханныс II просидел на троне всего пять месяцев. Поскольку он отказывался принимать даже формальное участие в церемониях, ни разу не выступил публично, отказался ехать с армией в поход и просил вернуть его в Уохни-Амба, рас Микаэль-Сыуль понял, что такая марионетка ему не нужна. 7 октября 1769 года по приказу гондэрского наместника нэгусэ нэгэст Йоханныс II был отравлен.
После ликвидации Йоханныса II, рас Микаэль-Сыуль посадил на императорский трон его 15-летнего сына Тэкле-Хайманота II. В отличие от своего отца Тэкле-Хайманот II энергично помогал расу Микаэль-Сыулю подавлять бунты в провинциях. Они вместе выступили против войск Фасиля. В битве при Фагит погибли более 10 тысяч воинов. Войска Фасиля были разбиты, но он сам опять сумел сбежать. Тогда рас Микаэль приказал убивать всех пленных. В ответ восстания только усилились. Взбунтовались рас Гошу из Амхара-Сайнт и дэджазмач Уонд из Ласты.
Эфиопские воины. Гравюра 1854 года
Перед сражением с войсками бунтовщиков рас Микаэль отвёл армию в Аксум. Здесь, в провинции Тигре, он сумел набрать пополнение. А пока император с гондэрским наместником находились в Аксуме, войска повстанцев заняли Гондэр. Было объявлено о низложении Тэкле-Хайманота II и провозглашении императором Сусныйоса II, внука Иясу II.
Узнав о свержении Тэкле-Хайманота II, Фасиль тоже направился в Гондэр, рассчитывая занять какой-нибудь высокий пост. Но поскольку Гошу и Уонд ничего достойного ему не предложили, то Фасиль сделался горячим сторонником законного императора Тэкле-Хайманота II. Вскоре рас Микаэль-Сыуль и Тэкле-Хайманот II, собрав 40-тысячную армию, двинулись на Гондэр. Узнав об этом, Сусныйос II, брошенный союзниками, бежал из столицы и скрылся в лесах к западу от озера Тана. Не встречая сопротивления, император и рас Микаэль вступили в Гондэр. Они помирились с Фасилем, который стал именоваться Фасиль Могучий.
После возвращения Тэкле-Хайманота II в Гондэр начались расправы с изменниками. Множество светских и духовных сановников, поддерживавших Сусныйоса II, были повешены. С октября 1770 года многие недели в Гондэре продолжались публичные казни.
В начале 1771 года началось восстание в Бэгемдэре. Восставшие заняли округ Дэмбия и подступили к Гондэру. Рас Микаэль-Сыуль выступил им навстречу с 25-тысячной армией. 6 мая 1771 года произошло сражение около Сыбэркуаза, южнее Гондэра. Победу не удалось одержать никому. На следующий день после сражения главные руководители мятежников Гошу и Уонд предложили императору отослать раса Микаэль-Сыуля в Тигре в обмен на лояльность восставших. Тэкле-Хайманот II не согласился на это предложение.
19 мая 1771 года сражение возобновилось, однако его остановил ливень. На следующий день битва разгорелась с новой силой. 20 мая войска императора потеряли 3 тысячи солдат убитыми, в то время как мятежники потеряли 10 тысяч человек.