Но когда де Рюссель прибыл в Массауа, положение уже в корне изменилось. Теодрос II со своей армией выступил в поход на север, объявив награду за голову Ныгусэ. Одержав победу в нескольких сражениях в январе 1861 года, Теодрос II настолько ослабил армию противника, что у Ныгусэ осталось только несколько тысяч солдат. Войска императора окружили остатки армии ныгусэ Тигре близ Аксума и нанесли им окончательное поражение. По приказу Теодроса II схваченным Нэгусэ и его брату отрубили правую руку и левую ногу, а только потом казнили. Император Теодрос II раз за разом одерживал победы над мятежниками, но в постоянных военных действиях разорялись эфиопские провинции и редела императорская армия.
В феврале 1862 года в Эфиопию приехал новый британский консул, капитан Камерон. Теодрос II рассчитывал на помощь Британии в вопросе выхода Эфиопии к морю. 30 октября 1862 года эфиопский император отправил письмо королеве Виктории. Письмо Теодроса II отвёз в Лондон Камерон, который сообщил, что император выразил желание пригласить в Эфиопию инженеров и врачей. Министр иностранных дел, лорд Рассел, отклонил все предложения Теодроса II. Камерон возвратился без ответного письма от королевы, а только с инструкцией лорда Рассела переехать из Эфиопии в Массауа. Обиженный Теодрос II в январе 1864 года приказал арестовать Камерона по обвинению в антиэфиопской деятельности. Основанием послужила поездка британского дипломата в пограничные с Египтом районы и встречи с командирами мусульманских отрядов. Вместе с Камероном арестовали ещё около 40 европейцев находившихся в Эфиопии.
В том же году Теодрос II приказал арестовать абунэ, который выступал против усиления власти императора и его вмешательства в дела церкви. Закованного абунэ бросили в тюрьму в Мэкдэле, где он и умер. Были подвергнуты репрессиям и другие духовные сановники, выступавшие против императора. К середине 1860-х годов Теодросу II пришлось бороться против всех. Непрерывные покушения на его жизнь и вооружённые мятежи изматывали и императора, и страну. Никакой возможности создать великую Эфиопию у императора не было, пока он не подавит сопротивление крупных феодалов. А подавить это сопротивление ему не удавалось, хотя он регулярно громил бунтовщиков. Но на место одних немедленно вставали другие.
Из Мэкдэлы 30 июня 1865 года бежал сын Хайле-Мэлекота, Сахле-Марьям, и провозгласил независимость Шоа. К борьбе с Теодросом II готовилась Уоркит – правительница провинции Уолло. Император наказал её за помощь, оказанную бежавшему из Мэкдэлы Сахле-Марьяму. По его приказу была сброшена в пропасть дочь Уоркит, находившаяся в Мэкдэле как заложница. В том же 1865 году Сахле-Марьям взял себе имя Менелик и титул ныгусэ Шоа. Затем Менелику удалось разгромить Бэззаббыха, а потом пригласить его на переговоры и расстрелять.
Мэкдэла, резиденция императора, располагалась на плоской вершине горы с обрывистыми склонами. В окружающих Мэкдэлу пропастях нашли свою смерть многие заложники и противники императора Теодроса II.
Солдаты Теодроса II поднимают в гору гигантскую мортиру.
Гравюра 1869 года
В середине 1860-годов в Эфиопии уже было три региона, где не подчинялись императорской власти. Первым была провинция Шоа, где Сахле-Марьям не только провозгласил независимость, но и стремился сам захватить императорскую власть. Вторым была Ласта, где правящий уаг шум Гобэзе тоже готовился к захвату императорской короны. Третьим был Тигре, где дэджазмач Бэзыбэз-Каса, потомок раса Микаэля-Сыуля, тоже стремился на императорский пост. К 1865 году под контролем императора Теодроса II оставались только Бэгемдыр, Дэланта и ещё несколько округов.
После ареста Камерона британское правительство пыталось освободить его при помощи переговоров. Для этого в Эфиопию был направлен политический советник в Адене Х. Рассам. Не имея возможности прибыть ко двору Теодроса II через Северную Эфиопию, находящуюся под контролем сил Бэзыбэз-Касы и Гобэзе, Рассам поехал через Судан. В ноябре 1865 года Рассам прибыл в Мэтэмму. В январе 1866 года в сопровождении охраны, присланной Теодросом II, он направился в императорский лагерь на границе Дамота и Агау-Мыдыра. Рассам передал Теодросу II письмо от королевы Виктории. В нем содержалось требование освобождения арестованных европейцев. Теодрос II сказал Рассаму, что освободит европейцев, если Британия пришлёт ему оружейников и поможет в строительстве военного завода. А до тех пор пока это не будет сделано, Рассам останется в Эфиопии.
Тем временем в Лондоне начали готовить вооружённое вторжение в Эфиопию. В апреле 1867 года министр иностранных дел официально обратился к военному министру и к государственному секретарю по делам Индии с предложением разработать план экспедиции в Эфиопию. В июле того же года кабинет министров Британии принял решение отправить вооружённую экспедицию в Эфиопию. Командовать войсками был назначен генерал Роберт Нэпир.