Создание Государственного Комитета Обороны, института уполномоченных ГКО и местных комитетов обороны обеспечило усиление централизации в руководстве военным хозяйством, позволило быстро и конкретно претворять в жизнь политику партии, осуществлять наиболее полную мобилизацию и использование материальных и людских ресурсов государства для разгрома врага.
По решению ГКО были созданы народные комиссариаты танковой промышленности, вооружения, боеприпасов, минометного вооружения, при Совнаркоме СССР были образованы Комитет по учету и распределению рабочей силы, Совет по эвакуации, Советское информбюро. Вопросами военной экономики активно занимались И. В. Сталин, A. А. Андреев, Н. А. Вознесенский, А. А. Жданов, М. И. Калинин, А. П. Косыгин, А. И. Микоян, В. М. Молотов, Н. М. Шверник. Руководителями основных отраслей военной экономики СССР были М. Г. Первухин, Б. Л. Ванников, В. А. Малышев, Д. Ф. Устинов, И. Ф. Тевосян, А. И. Шахурин, П. И. Паршин, П. К. Байбаков, B. В. Вахрушев, А. И. Ефремов, П. Ф. Ломако и др.
Применительно к условиям военного времени была перестроена работа ЦК ВКП(б), ЦК компартий союзных республик, краевых и областных комитетов партии, Совнаркома СССР и совнаркомов союзных и автономных республик, крайисполкомов, облисполкомов, местных партийных и советских органов. В ЦК компартий союзных республик, обкомах и крайкомах были образованы новые отраслевые отделы по оборонной промышленности и транспорту. Увеличился состав парторгов ЦК ВКП(б) и комсоргов ЦК ВЛКСМ на заводах и фабриках. Для оперативного выполнения решений вышестоящих органов были расширены права совнаркомов союзных и автономных республик, а также местных органов государственной власти.
Великая Отечественная война подвергла суровой проверке партийные и советские руководящие органы, их организаторские и деловые способности. Эту проверку они с честью выдержали.
В условиях военного времени строжайшим образом соблюдалась жесткая плановая и производственная дисциплина, повысилась личная ответственность руководящих кадров.
В годы войны возросла централизация в планировании народного хозяйства, обусловленная потребностями военного времени. Перераспределение ресурсов народного хозяйства в первую очередь в пользу военного производства, а также вызванное войной ограничение выпуска ряда важных товаров потребовали централизованного распределения в плановом порядке гораздо большего количества продуктов, чем в мирное время. В период войны количество продуктов, распределяемых из единого центра по государственному плану, увеличилось более чем в 2 раза.
Народнохозяйственное планирование велось на научной методологической основе. Среди важнейших научных принципов планирования особое значение приобрели принцип ведущего звена и тесно связанный с ним принцип наибольшей экономической эффективности. В военно-хозяйственные планы закладывалось такое использование потенциальных возможностей социалистической экономики, которое давало возможность превзойти по производству военной техники гитлеровскую Германию, несмотря на то что она использовала экономические и трудовые ресурсы почти всей оккупированной ею Европы. В планах учитывались главные, решающие участки военной экономики и на них сосредоточивался максимум материальных, денежных и трудовых ресурсов. В планировании широко применялись балансовый метод, экономические расчеты наиболее эффективного использования производственных мощностей, трудовых ресурсов, сырья, материалов и т.д.
Плановый характер советской экономики, обусловленный господством общественной социалистической собственности на средства производства, обеспечил возможность установления пропорций между отраслями и предприятиями на основе государственного плана и дал возможность в короткий срок коренным образом изменить пропорции мирного периода в интересах победы над врагом. В распределении труда и материальных фондов преобладающую долю заняли военное производство и кооперированные с ним отрасли военного хозяйства.
Изменение пропорций в народном хозяйстве, направленное на быстрейшее развитие военной экономики и обеспечение нужд фронта, нашло отражение в балансе народного хозяйства. Он включал научный анализ основных пропорций и взаимных связей между отраслями за предыдущий плановый период и научно обоснованные расчеты по важнейшим показателям производства и использования общественного продукта и национального дохода на планируемый период. Баланс народного хозяйства базировался на использовании экономических законов социалистического воспроизводства, позволял рационально распределять производственные, материальные, финансовые, трудовые ресурсы и определять оптимальные задания по развитию военной экономики в интересах разгрома врага.