Гетману принадлежала высшая военная, исполнительная и судебная власть. Гетман также определял внешнеполитический курс, руководил финансами. При гетмане имелась «рада» (совет) из высшей казачьей старшины. Впрочем, то был совещательный орган, с мнением которого гетман мог и не считаться. В Раду входили: генеральный судья, генеральный обозный – второй после гетмана чин (командовал артиллерией, снабжением войска, руководил строительством военных лагерей, был их комендантом), генеральный подскарбий (казначей), генеральный писарь (административно-политические дела, хранитель войсковой печати, во время войны – начальник штаба), два генеральных есаула (непосредственные помощники гетмана), генеральный хорунжий (хранитель знамени – хоругви, глава охраны гетмана), генеральный бунчужный (хранитель бунчука – символа войсковой власти, выполнял особые поручения гетмана).
Для решения важнейших дел созывали Генеральную («полную») раду. Генеральная рада была высшим представительным органом государственной власти Гетманщины. В ее состав входили гетман, старш
Административно Гетманщина разделялась на полки и сотни. Количество полков и сотен не было постоянным. Всего было учреждено 16 полков: 9 на правом берегу Днепра и 7 – на левом. На правом берегу Днепра: Чигиринский, Черкасский, Каневский, Корсуньский, Белоцерковский, Уманский, Брацлавский, Кальницкий и Киевский. На левом берегу: Переяславский, Кропивенский, Миргородский, Полтавский, Прилукский, Нежинский и Черниговский. Со временем территория полков и их названия могли меняться. Неодинаковым было и число сотен. В некоторых полках их было около десятка, в других до двух десятков. Отличалась и численность казаков в сотнях: в некоторых было 200–300 казаков, в других – от двух до нескольких десятков. На Левобережной Украине в 1672 году насчитывалось 117 сотен, а в конце XVII века – 163 сотни.
Главой полка был полковник. Его выбирали казаки полка или назначал гетман. Полковник осуществлял военную, административную и судебную власть. Основным исполнительным органом были полковые канцелярии, куда входили полковые старшины: обозный, два есаула, судья, писарь, хорунжий. Эти чины были выборными. Вспомогательным органом власти был полковой совет казаков и старшин. Сотнями управляли сотники, которых выбирали казаки или назначал полковник. При сотниках существовала сотенная старшина: писарь, хорунжий, обозный, есаул. Существовал также сотенный совет. Судебную власть осуществляли полковые и сотенные суды.
В поселках и селах казаки входили в курень, который выбирал атамана, а селяне и мещане выбирали войта. Атаманы и войты представляли низшее звено войсковой администрации. В городах, как полковых, так и сотенных, был выборный городской атаман. Одновременно существовало и городское самоуправление – магистраты и ратуши, состоявшие из выборных от городского населения.
В конце XVII века на Левобережной Гетманщине было около 2 тыс. населенных пунктов, в которых проживало порядка 1,5 млн человек. Города с Магдебургским правом сохраняли свои права и возглавлялись войтами. В состав городского управления входили бурмистры, райцы и лавники. Другие города и поселки, имевшие самоуправление, назывались ратушными; в то же время в них власть имели казацкие старшины, которым подчинялись казаки.
Резиденцией гетмана (и тем самым столицей Гетманщины) был сначала город Чигирин (1649–1669), затем Батурин (1669–1708) и наконец Глухов (1708–1764).
Основную массу населения составляли крестьяне. Хотя они и были лично свободными, но постепенно оказывались в зависимости от старшины. Гетман Мазепа ввел для крестьян двухдневную барщину. Со временем барщина стала трехдневной. К концу существования Гетманщины свободных сел оставалось около 10 %. Остальные населенные пункты со всеми жителями становились зависимыми от старшинских семейств. Крестьяне сопротивлялись закрепощению. Это нашло отражение в побегах в Запорожье и Слобожанщину. В 1761 году гетман Кирилл Разумовский запретил переходить крестьянам на новое место в самой Гетманщине без предъявления особого документа от старого владельца. Так медленно, но верно шло вторичное закрепощение крестьянства.
Казаки, которые считались основой Гетманщины, должны были нести воинскую службу, на которую должны были являться со своими конями и оружием. Общее число казаков при всеобщей мобилизации доходило до 50–60 тыс. В 1723 году при мобилизации на службу явился 55 241 казак. Постепенно среди казаков все больше становилось совершенно неимущих. Появилась даже определенная категория «подсоседков» – так стали называть казаков, живущих трудом батраков, не имеющих собственного жилья. Многие казаки со временем перестали отличаться от зависимых крестьян.