В Одесской губернии первым председателем Чрезвычайно-следственной комиссии стал Б.С, Северный (начальником разведывательного отдела, т. е. наружной разведки — Л.А. Мамендос), уже в марте того же года после реорганизации ЧСК в ГЧК ее возглавил поляк Реденс, еще через 5 месяцев, в августе, его сменил Макс (Мендель) Абелевич Дейч. С декабря 1921 г., из-за болезни Дейча, бывшего на хорошем счету и награжденного за разгром антибольшевистского подполья орденом Красного Знамени, Одесской ЧК руководил (в качестве временно исполняющего обязанности председателя) С.С. Дукельский. Заместителем его после латыша Л.М. Заковского был в 1921 г. Марк Борисович Корнев (Капелюс). Среди руководителей подразделений ОГЧК были заведующий отделом политконтроля Антон Романович Вайнов (в 1920-е-1930-е г.г. известный партийный работник), ЭКО — Леонид Самойлович Букраба и др.
В Херсонской губернии (с декабря 1920 г. вошла в состав Николаевской губернии) председателем ГЧК в 1920 г. был старый большевик Мирон Абрамович Переславский, в Александровской (Запорожье) губернии — Самуил Соломонович Цвайг, в Черниговской губернии — Семен Давидович Вольский (Миллер), Лившиц (1920–1921), с января 1922 г. — Циклис.
В Волынской губернии (1921–1922) зампредами ГЧК были Аркадий Соломонович Богар, Западный, Николай Давидович Шаров (Шавер).
В Николаевской губернии зампредами ГЧК были Израиль Яковлевич Дагин (до августа 1920 г., председатель городской ЧК с декабря 1919 г.) и Шаров (май 1921-сентябрь 1921 г.). СОО руководил Валерий Михайлович Горожанин (1920), СОЧ — Александр Матвеевич Минаев-Цикановский (1921–1922 г.).
В губернских и армейских ЧК
На территории Белоруссии, большая часть которой до середины 1920-х г.г. входила в РСФСР, ЧК появились в 1918 г. в Западной области (в нее в 1918 г. входила часть современной территории Белоруссии, которая не была оккупирована немцами). Из учрежденных ЧК евреи-чекисты возглавили их в Могилеве (в мае 1918 г., первый председатель — И.Л. Пинскер, затем Д.М. Гуревич). Таким образом, на территории Белоруссии (Западная область входила в РСФСР) ЧК появились раньше, чем во многих губерниях собственно Великороссии. В 1919 г. ГЧК в Витебске руководили Яков Лазаревич Аскольдов (затем военачальник, корпусной инженер), Соломон Акимович Хасман (впоследствии партийный работник), в 1920–1922 г.г. — С.С. Шварц, в Могилевской губернии — В.И. Хаскин.
В ЧК собственно Белоруссии (в 1919 г. — Литовско-Белорусской ССР, председатели — Виктор Иванович Яркин и Вацлав Антонович Богуцкий) из евреев-руководящих работников — можно отметить члена коллегии Ефима Моисеевича Кроля и прибывшего из Москвы в составе группы чекистов (во главе с И.П. Жуковым) Макса Моисеевича Зинде (в начале 1930-х г.г. легальный резидент советской внешней разведки в Лондоне). После освобождения Минской губернии от поляков в июле на базе Минской губЧК была в том же году создана ЧК ССР Белоруссии (на правх губернской ЧК), председателем которой стал А.И. Ротенберг (до июня 1921 г.). В ноябре 1921 г. Ротенберг возглавил ЧК Крымской АССР.
На Северном Кавказе из руководящих работников-евреев в ЧК служили Самуил Львович Пупко (председатель Терской ГЧК в 1920 г.)., Иосиф Борисович Генкин (председатель Пятигорской городской ЧК, на правах губернской ЧК, 1920).
В Туркестане евреи в органах ЧК были на втором плане. Начальником оперчасти ТуркЧК в 1920 г. был Давид Яковлевич Каплан, СОЧ Ташкентской облЧК — Абрам Аронович Слуцкий (впоследствии начальник советской разведки).
Полпредом ВЧК в Киргизской АССР был г. С. Мороз (декабрь 1920–1921 г.).
Таким образом в РСФСР из примерно 60 губернских и областных ЧК евреи в период 1918–1921 г.г. руководили двумя десятками ЧК. На Украине евреи побывали во главе почти всех губернских ЧК, что объясняется большим количеством местных уроженцев среди чекистов.
Из руководителей Особых отделов можно отметить: в 3-й армии (1919) — Борис Абрамович Бреслав (в 1919–1920 г.г. начальник ОО 12-й армии и Южного фронта) и Владимир Семенович Дукельский (в 1919–1920 — начальник ОО 14-й и 16-й армий, погиб в бою во время войны с Польшей 23 августа 1920 года под Замбревом, посмертно награжден орденом Красного Знамени), 5-й армии — Матвей Давидович Берман, 8-й армии (1919–1920) — Абрам Михайлович Левин (с 1921 года — Лев Николаевич Вельский, полпред ВЧК в Тамбовской губернии), 9-й армии — Сергей Евсеевич Богров (1919–1920, член партии с 1901 года, впоследствии дипломат, генеральный консул в Милане), бывший анархист-политкаторжанин Лазарь Иосифович Коган (1920), 12-й армии — Зиновий Борисович Кацнельсон (1920) и Иосиф Маркович Островский (1921). В гражданскую войну в особых отделах ВЧК начинали свою чекистскую работу известные впоследствии сотрудники разведки и контрразведки И.М. Блат, B.C. Гражуль, З.И. Пассов, Я.И. Серебрянский, С.М. Шпигельглаз, Н.И. Эйтингон и многие другие.
Проблема еврейского присутствия в органах госбезопасности как политический фактор всегда была в центре внимания руководства партии и правительства и решалась по разному.