В отличие от своих подруг Твайлайт всерьез стремилась одержать победу в войне, поэтому не гнушалась никакими средствами. Огромные успехи министерства (Селестия Один) перемежались с ужасающими неудачами (Порча). Так лабораторным ученым удалось создать технологию СтелсБаков на основе зебринского стелс-плаща, а позже и запустить их в серийное производство. Многочисленные же попытки создать Зелье Вынужденной Трансформации для превращения единорогов в аликорнов привели к появлению огромных запасов токсичного вещества, беспорядочно разбросанных по всей Эквестрии, которое со временем получило название «Порча».
На базе Министерства Тайных Наук в Мэйнхеттене возникла Башня Тенпони – одно из самых защищенных и безопасных мест на Эквестрийской Пустоши. Благодаря надежным стенам и водным талисманам население города процветает, однако из-за сильно ограниченной площади проживание там является уделом избранных. Именно в Башне Тенпони расположился загадочный DJ Pon3, который вот уже более сотни лет транслирует эфиры своего радио на всю Эквестрийскую Пустошь.
По секретным базам министерств разбросано множество прототипов устройств, по различным причинам не вошедших в серийное производство – «Камера Регенерации» (Главный офис министерства в Кантерлоте), «Лунар Призм» (Солар Армс), «Небесный Клинок» (Солар Армс), «Радужное Возмездие» (Солар Армс), «Сады Эквестрии» (Пик Наблюдателя), «Селестия Один» (Башня Тенпони), «Сияние» (Солар Армс), СтелсБак 01 (Главный офис министерства в Кантерлоте), Тви-икс (Особняк Арк Нексуса) и т.д.
Неофициальное название Министерства Тайных Наук – Министерство Магии.
Мусорщики
(Научный Институт Медицинских Исследований Пустоши
(Ученые НИМИП дают хорошую цену за любое медицинское оборудование и книги, предлагая в обмен исцеление Порчи, тяжелых ран и всевозможных болезней. Они лечат всех, у кого есть крышки – наемников, рейдеров, мародеров, Стальных Рейнджеров, обычных путешественников. На землях института объявлено вечное перемирие.
Одновременное покровительство Союза Стойл, клана «Белого щита» и банды «Гадюк» превратили НИМИП в одно из самых безопасных мест Западного Сектора Эквестрийской Пустоши.
Небесный Бандит
(Небесный танк
(