Фролов командовал Дунайской флотилией с 16 сентября по 21 ноября 1941 года[1110]
. Флотилия после боев на Дунае, Буге и Днепре понесла значительные потери. Оставшиеся корабли 24 сентября прибыли в Севастополь. После ремонта и переформирования командование Черноморского флота решило использовать флотилию для обороны части Керченского полуострова от Ак-Моная до Керченского пролива и самого пролива. К 20 октября в Камыш-Буруне собрались монитор «Железняков», дивизион канонерских лодок («Красная Грузия», «Красный Аджаристан» и «Красная Абхазия»), плавучая батарея, 6 бронекатеров, 5 катеров-тральщиков, 46-й отдельный зенитный артдивизион, батальон морской пехоты и другие подразделения. В Камыш-Буруне расположились командный пункт и штаб флотилии, в ходе боев они перемещались в Керчь (6 ноября) и на пристань Войково (16 ноября). Тем временем 20 октября германские войска прорвали Ишуньские позиции. Под их давлением Отдельная Приморская армия отходила к Севастополю; Керченский полуостров предстояло оборонять 51-й армии при поддержке Керченской военно-морской базы, Дунайской и Азовской флотилий. Фролов приказал основать посты наблюдения и связи в Казатине, на мысах Зюк, Хрони, Пекли, выслал подвижные корабельные дозоры, организовал разведку побережья в операционной зоне флотилии, наладил взаимодействие со штабами 51-й армии, Азовской флотилии и Керченской военно-морской базы[1111].Совместно с частями 51-й отдельной армии корабли и береговые части флотилии занимали оборону под Керчью. 6 ноября германские войска вышли к Камыш-Буруну и Керчи. Ввиду превосходства противника было решено оставить Керченский полуостров. Перевозки войск и эвакуацию гражданского населения поручили Дунайской флотилии. Командующий направил в войска офицеров штаба для руководства погрузкой. Сам он руководил действиями из Керчи, а затем и с пристани Войково. Корабли артиллерийским огнем поддерживали сухопутные войска, удерживавшие позиции до завершения эвакуации[1112]
.Эвакуация войск армии на Таманский полуостров была успешно выполнена. 16 ноября войска оставили Керченский полуостров. 20 ноября решением заместителя наркома ВМФ И.С. Исакова Дунайская военная флотилия была расформирована; к 1 декабря ее корабли и части были переданы в состав Азовской военной флотилии и Керченской военно-морской базы. С ноября 1941 по июнь 1942 года командиром Керченской военно-морской базы являлся Фролов[1113]
. В этом качестве он участвовал в Керченско-Феодосийской десантной операции.По плану следовало высадить на Керченский полуостров войска 44-й и 51-й армий. 26 декабря корабли Азовской военной флотилии и Керченской военно-морской базы должны были высадить часть сил 51-й армии на северное и восточное побережье Керченского пролива. Отряду кораблей контр-адмирала Н.О. Абрамова предстояло доставить на берег у горы Опук отряд войск 44-й армии. Основные силы армии Черноморский флот высаживал 29 декабря в порт Феодосия[1114]
.Штормовая погода позволила высадить только часть сил 51-й армии. Корабли Керченской военно-морской базы должны были высадить десант в нескольких пунктах, но 26 декабря были высажены лишь три группы, ибо по плану каждый из трех отрядов кораблей и судов получил несколько районов высадки. К вечеру на берег доставили 2175 человек, в основном в Камыш-Бурун и на Камыш-Бурунскую косу. Последующие эшелоны десанта перевозили в ночь на 28 декабря, когда шторм поутих[1115]
.После того как Керченский полуостров был освобожден от противника и образовался Крымский фронт, Керченская военно-морская база обеспечивала снабжение войск фронта. Ей же досталась и эвакуация с Керченского полуострова, когда весной 1942 года войска Крымского фронта потерпели поражение. В боевой характеристике Фролова записано: «Проявил достаточную инициативу, смелость и решительность в выполнении задач… Под сильным воздействием авиации и артиллерии противника хорошо руководил эвакуацией войск из Керчи на Таманский полуостров при оставлении нашими войсками Керченского полуострова»[1116]
.С июня 1942 по январь 1943 года A.C. Фролов был начальником тыла Черноморского флота. С ноября 1942 по февраль 1943 года моряк являлся консультантом по военно-морским вопросам при представителе СССР в Консультативном совете по делам Италии. В феврале 1943 – июне 1944 года Фролов состоял начальником Управления подводного плавания. С ноября 1943 по февраль 1944 года контр-адмирал был наблюдателем в штабе англо-американского командования на Средиземном море при проведении союзным командованием десантной операции в январе 1944 года в Анцио. С июня 1944 года A.C. Фролова назначили начальником штаба Тихоокеанского флота. 25 сентября 1944 года его произвели в вице-адмиралы. В этом качестве он принимал участие в советско-японской войне 1945 года. Имя Фролова отмечали в приказах Верховного главнокомандования[1117]
.