На основе Стратегической части ВМУО ГМШ 6 апреля 1906 г. был создан Морской Генеральный штаб. 6 июня состоялся высочайший указ Правительствующему Сенату, гласивший, что разработка всех мероприятий по организации морских сил возлагалась на МГШ[125]
. Циркуляром начальника ГМШ контр-адмирала А. А. Вирениуса 28 апреля 1906 г. в распоряжение капитана 1 ранга Л.А. Брусилова, назначенного начальником нового учреждения, были выделены 14 офицеров, которые и составили костяк Морского Генерального штаба. Это были капитаны 2 ранга М.И. Каськов 1-й, Л.Б. Кербер, М.М. Римский-Корсаков 3-й, барон О.О. Рихтер, А.В. Шталь, лейтенанты П.П. Владиславлев, Б.И. Доливо-Добровольский, М.И. Дунин-Барковский, А.В. Колчак, Л.Г. Постриганев, М.И. Смирнов 3-й, В.Н. Черкасов, А.Н. Щеглов и штабс-капитан В.М. Вавилов[126]. Несколько позднее в МГШ служил капитан-лейтенант барон И. А. Черкасов[127], что вызвало путаницу в наших прежних работах[128].П.П. Владиславлев, Б. И. Доливо-Добровольский, М.И. Каськов, Л.Б. Кербер, М.И. Смирнов и А.Н. Щеглов были старыми соратниками Л.А. Брусилова. Они входили в список офицеров, «признанных способными исполнять обязанности в составе» Стратегической части ВМУО, составленный еще в феврале 1904 г.[129]
Исполняющим обязанности помощника начальника штаба и заведующим 1-м (оперативным) отделением стал А.В. Шталь. В составе этого отделения служили А.Н. Щеглов, отвечавший за создание плана войны на Балтике, М.И. Каськов, ответственный за Черноморский театр, и М.М. Римский-Корсаков 3-й, составлявший планы, касавшиеся Дальнего Востока.
2-е отделение (русской статистики) возглавлял А.В. Колчак, в его же руках был сбор сведений по Балтийскому театру, в сборе сведений о состоянии русского флота А.В. Колчаку должны были помочь Л. Г. Постриганев и В.М. Вавилов. Отслеживать состояние русского Черноморского флота должен был лейтенант В.Н. Черкасов, а морские силы на Дальнем Востоке находились в ведении П.П. Владиславлева, он же заведовал картами во всем МГШ.
3-е отделение (иностранной статистики) возглавлял лейтенант Б.И. Доливо-Добровольский. В его подчинении служили капитан 2 ранга Л.Б. Кербер изучавший состояние военно-морских сил Великобритании и США. Изучение ВМФ Турции, Австрии, Франции, Италии, Испании, Греции и «мелких государств Европы» было возложено на лейтенанта М.И. Дунина-Барковского. Один из самых молодых сотрудников, лейтенант М.И. Смирнов 3-й отвечал за систематизацию и сбор сведений о флотах тихоокеанских государств, прежде всего, Японии, а также Китая, США и «мелких государств Америки». Капитан 2 ранга барон О.О. Рихтер отвечал за информацию о флотах Германии и Скандинавских государств.
Все офицеры «первого набора» МГШ были незаурядными личностями.
Начальник штаба – Лев Алексеевич Брусилов (1857— 1909), участник Русско-турецкой войны 1877-1878 гг. В феврале 1904 г. он стал заведующим ВМУО ГМШ. Уже в начале войны с Японией Брусилов понял, что из Петербурга невозможно повлиять на ход военных действий, и добился назначения командиром крейсера «Громобой». За ряд успешных походов у берегов Японии его наградили мечами к ордену Св. Владимира 3-й степени. В июне 1908 г. Л.А. Брусилов был вынужден покинуть пост начальника МГШ, не выдержав внутриведомственной борьбы и фактического бойкота морского ведомства со стороны Государственной думы. Л. А. Брусилов участвовал в разработке Малой судостроительной программы и оперативно-тактических заданий на проекты современных кораблей. В октябре 1906 г. он представил доклад об основных ближайших задачах флота, а в марте 1907 г. еще один – «Стратегические основания для плана войны на море». В 1909 г. Л. А. Брусилов был произведен в вице-адмиралы с увольнением от службы по болезни.
Прославившийся в годы Первой мировой войны генерал А. А. Брусилов приходился родным братом Л. А. Брусилову. Его старший сын – Георгий Львович – был морским офицером, в 1912 г. он организовал полярную экспедицию на шхуне «Святая Анна» и пропал без вести вместе с судном в 1914 г.