Перед врагом фронта советских или других войск уже не было. 28 февраля 1918 года Дыбенко, собрав отряд революционных моряков, отправился защищать Нарву. Бывший матрос не смог организовать оборону, а тут еще морякам досталась цистерна спирта. Началась нескончаемая пьянка. Первые же бои для советских войск были неудачными, они начали отступление. Немцы заняли Киев, Минск, Могилев, Ревель, Нарву, Псков, подошли к Петрограду. Дыбенко на фронте был срочно заменен бывшим генерал-лейтенантом Дмитрием Павловичем Парским. 16 марта Дыбенко был снят с поста наркома. Сам он в своем заявлении писал, что уходит из правительства в знак протеста против Брестского мира.
К тому времени, в связи с подписанием 5 марта 1918 года Брестского мира, большевики решили окончательно закончить со старой действующей армией. 13 марта Ленин подписал постановление Совнаркома об упразднении должности Верховного главнокомандующего и, естественно, лишении Н. В. Крыленко этой должности.
Николай Иванович Подвойский, сын сельского священника, окончивший духовную семинарию, в 1901 году в Ярославле вступил в социал-демократическую рабочую партию. Он стал профессиональным революционером, знал законы конспирации, умел вести агитацию в войсках, но в стратегии, конечно же, не разбирался. 27 ноября 1917 года он был назначен председателем коллегии Народного комиссариата по военным делам. Крыленко и Антонов-Овсеенко назначались народными комиссарами по военным делам. Так образовался триумвират руководства вооруженными силами страны, который просуществовал недолго. После падения Нарвы и Пскова Н. И. Подвойский, как и Дыбенко, лишился своей должности. Его освободили 13 марта 1918 года.
Итак, к середине марта 1918 года армия осталась фактически без руководства, уже в который раз. И это в условиях незавершенной мировой войны и начавшейся Гражданской войны, в условиях насильственного слома старой организации и отсутствия новой, в условиях катастрофической нехватки руководящих кадров и материальной базы…
13 марта 1918 года председателем Высшего военного совета был назначен Лев Давыдович Троцкий. Он же был назначен и народным комиссаром по военным делам. Начался новый этап создания и развития Рабочее-Крестьянской Красной армии. Быстро росла ее численность, она одерживала победы. Но что это была за армия?
24 сентября 1918 года член Реввоенсовета 1-й армии С. П. Медведев писал Ленину: «Я убедился, что у нас есть толпы вооруженных, а не крепкие воинские части. Зло, которое причиняли эти толпы делу борьбы с чехословаками и белогвардейцами, прямо неописуемо. Как только они занимали какую-нибудь деревню или село, они вызывали своей неорганизованностью и распущенностью величайшее озлобление всего населения.
Всякий мало-мальский самостоятельный житель и его дом рассматривался как белогвардейское пристанище и подвергался явному и тайному ограблению. Самовольные захваты лошадей, фуража, продуктов питания, обыски в домах и при всем этом грабежи стали нормой».
Но дело обороны Социалистического Отечества требовало иметь крепкую армию. 2 сентября 1918 года постановление ВЦИК объявило республику военным лагерем. Было указано, что «во главе всех фронтов и всех военных учреждений республики ставится Революционный военный совет с одним Главнокомандующим». Революционный военный совет возглавлял Троцкий. Главнокомандующим был назначен Вацетис.
Иоаким Иоакимович Вацетис, латыш по происхождению. Окончил академию Генерального штаба. В годы Первой мировой войны командовал Земгальским латышским полком, вместе с которым принял сторону большевиков. Весной 1918 года он сформировал Латышскую советскую стрелковую дивизию, которая охраняла Кремль и подавила мятеж левых эсеров. Но опыта строительства вооруженных сил и стратегического командования у Вацетиса не было.
Став главнокомандующим, он разъезжал по фронтам, отдавал приказы, вершил суд. Но от этого боеспособность армии не поднималась.
Положение могли исправить офицеры старой армии, если бы большевики им доверяли. Но особого доверия не было. И генштаб Вацетис решился защищать своих бывших товарищей перед Лениным, обвинив при этом одного из видных чекистов Кедрова. В ответ Кедров «нашел» заговор в Полевом штабе РККА, и в июне 1919 года Вацетиса и других арестовали. Правда, в октябре, за отсутствием состава преступления, арестованных освободили. Вацетиса отправили на преподавательскую работу в Военную академию РККА.
Новым главнокомандующим стал Сергей Сергеевич Каменев, также из «бывших», также выпускник академии Генерального штаба. В годы Первой мировой он также командовал полком.