Спустя годы, в разгар Первой волшебной войны, Дамблдор собрал опытных волшебниц и волшебников, которым доверял, и создал Орден Феникса для борьбы с Волдемортом, чье могущество росло час от часу. Двух членов Ордена, Джеймса и Лили Поттеров, Дамблдор спрятал – после того как Сивилла Трелони, соискательница должности преподавателя прорицаний, сделала пророчество о рождении ребенка, который победит Темного лорда. Северус Снейп, Пожиратель смерти, при этом безумно влюбленный в Лили, услышал пророчество и сообщил Дамблдору, что Волдеморт считает этим ребенком дитя Поттеров. Несмотря на то что ранее Дамблдор отказался от своего желания объединить все три Дара Смерти, он позаимствовал у Джеймса один из них – мантию-невидимку. Мантия все еще была у Дамблдора во время нападения на Джеймса и Лили. Еще один Дар Смерти у Дамблдора уже был: Бузинная палочка.
Теперь за жизнь и безопасность Гарри отвечает Дамблдор. Он прячет мальчика у родственников по материнской линии – Петунии и Вернона Дурслей (пока Гарри не исполнится одиннадцать, и он не поступит в Хогвартс). Снейп обещает Дамблдору быть его тайным агентом и обеспечивать защиту мальчику. Десять лет спустя, когда Гарри становится первокурсником школы волшебства, Дамблдор и его самые надежные преподаватели-коллеги прячут в школе Философский камень и устанавливают вокруг тайника несколько уровней защиты. Несмотря на то что Гарри непосредственно вовлечен в события, связанные с похищением Камня, Дамблдор решает, что мальчику пока рано знать всю правду о своей судьбе. В следующем учебном году Джинни Уизли открывает Тайную комнату, попав под темные чары дневника Тома Риддла. Гарри предан и верит Дамблдору, и Фоукс, феникс директора, прилетает к мальчику на помощь в Тайную комнату. Дамблдор постигает весь ужас плана Волдеморта: тот расщепляет свою душу на несколько частей и прячет их в неких предметах – хоркруксах. Темный лорд не побежден, пока цел хотя бы один хоркрукс. Чтобы раз и навсегда уничтожить Волдеморта, нужно найти и разрушить их все.
В 1995 году, когда Гарри становится свидетелем телесного воскрешения Волдеморта, Дамблдор вновь собирает Орден Феникса. Не желая признавать очевидные угрозы для волшебного мира, Министерство магии дискредитирует слова Дамблдора, ведет против него клеветническую кампанию. Волшебника лишают титулов и званий, высмеивают в печати, и в конце концов ему приходится бежать из Хогвартса. В июне 1996 года Дамблдор противостоит Волдеморту и сражается с ним в министерской Комнате смерти. В официальных магических кругах наконец признают факт возвращения Темного лорда – тому есть большое количество свидетелей. После того как Дамблдор восстановлен в должности директора, он наконец раскрывает пророчество Гарри и проводит лето в поисках хоркруксов.
Вскоре Дамблдор становится жертвой проклятия, которое убьет его менее чем через год. Осознавая это, волшебник разрабатывает хитроумный план: его должен убить Северус Снейп, чтобы у Волдеморта не было ни малейших сомнений в его преданности. В течение учебного года директор постепенно раскрывает Гарри правду, дает ему знания, необходимые для победы над Темным лордом, например информацию о прошлом Волдеморта и о природе хоркруксов. Когда Дамблдор обнаруживает местонахождение очередного хоркрукса (это медальон), он позволяет Гарри сопровождать его. Пользуясь отсутствием директора, в Хогвартс проникают Пожиратели смерти. Дамблдор и Гарри возвращаются в Хогвартс. Там, на вершине Астрономической башни, они встречают Драко Малфоя и нескольких Пожирателей смерти. Снейп поражает Дамблдора смертельным заклятием, и тот падает с башни.
Похороны Дамблдора состоялись в начале лета 1997 года (см. с. 205). На них присутствовали те, кто любил и уважал волшебника. Портрет Дамблдора висит в кабинете директора над письменным столом.
Амбридж занимает пост директора Хогвартса в течение короткого периода времени в 1996 году (после того как она выследила Отряд Дамблдора). Основание назначения: Декрет об образовании № 28 Министерства магии. Ее глубоко презирают и ученики, и преподаватели. Горгулья, охраняющая кабинет директора, отказывается признавать ее законно избранной директрисой и не пускает ее внутрь. Однажды, когда Амбридж уж совсем допекла Гарри и его нужно было срочно спасать, Гермиона обманом заставила директрису отправиться в Запретный лес. Там Амбридж сталкивается с кентаврами, которых она жутко не любит. Директриса оскорбляет кентавров, называет «мерзкими животными» – большая ошибка! Разъяренный табун уносит ее прочь, в чащу (приходит ей на помощь не кто иной, как Дамблдор). С тех пор даже цокот копыт повергает Амбридж в ужас. Ее увольняют и изгоняют из школы, когда Министерство восстанавливает в должности и правах Дамблдора.