Однако это решение до сих пор не проведено в жизнь. Тем временем подготовка документов для стройки шла полным ходом: в 2004 г. ИХФ РАН в лице директора Александра Берлина заключил инвестиционный контракт на строительство с ЗАО «СУ-155» в лице гендиректора Александра Мещерякова (сведений о том, что проводился конкурс, нет). А председателем совета директоров строительной компании уже был Михаил Балакин, тот самый, что когда-то обнадеживал жителей от имени московских властей.
Между тем, другая часть участка — размером в 1,2 га — была занята федеральной собственностью. В инвестиционном контракте указывалось, что земля не свободна от имущественных обязательств: на ней находятся складские помещения ИХФ РАН площадью 1905 кв. м, которые необходимо снести. Взамен до начала строительства СУ-155 должно было возвести здание материального склада площадью 850 кв. м. И, наверное, никто бы не заметил, что размеры государственного имущества уменьшились более чем в два раза, если бы склад все-таки был построен. Но работы на участке начались, а склада до сих пор нет. И, судя по развитию событий, вряд ли будет.
В октябре 2008 г. на территорию пришли строители из подрядной организации — ООО «Фирма «Латгалия» и стали огораживать участок забором. Причем по старому периметру, который значился в документах, отмененных годом ранее московской прокуратурой. Во избежание протестов со стороны жителей была установлена серьезная охрана, которая не пускала на работу даже сотрудников ИХФ. Уже пожилым ученым, чтобы попасть в институт, приходилось перелезать через высокий забор. В феврале 2009 г. Мосгосстройнадзор из-за нарушений в документации приостановил разрешение на строительство. Но и после этого работы не прекращались, были вырублены 125 деревьев. Департамент природопользования подтвердил незаконность вырубки и оценил ущерб, нанесенный окружающей среде, более, чем в 1 млн руб. Ставился вопрос о привлечении подрядчика к уголовной ответственности.
Вскоре работы опять были продолжены — теперь уже по сносу здания, в котором, как сообщал директор ИХФ Берлин в письме Леонтьеву и Солнцеву, размещались службы институтов и работали их сотрудники. А в инвестиционном контракте вообще ничего не сказано про наличие на участке строительства этого объекта федеральной собственности — лабораторного корпуса общего назначения, который находился в оперативном управлении другого академического учреждения — Института биохимической физики им. Н.М. Эммануэля РАН. Судьба этого модуля уже решена. Хотя разрешения на его снос не давали ни уже расформированное МТУ по управлению имуществом РАН, ни Росимущество, ни московские органы, оформляющие проведение работ по сносу.
Уничтожению действующей научной лаборатории не противился ни президент РАН Юрий Осипов, ни высокопоставленные политики, коих и в академии, кстати, немало. По-своему сопротивляются лишь местные жители и отдельные ученые, которые до сих пор живут не рынком и бизнесом, а наукой. В нашем распоряжении оказалось письмо, написанное в 2002 г. (задолго до заключения инвестиционного контракта), в котором бывший директор Института биохимической физики Александр Шилов просит у Юрия Осипова и администрации Президента РФ защитить интересы Российского государства и российской науки и не сносить модуль, который известен во всем мире, ведет совместные исследования с научными учреждениями Канады, США, Германии, Китая и который занимал призовые места на всероссийских и международных выставках.